Pregled po projektu: Cas3 kao kontrolna točka obrane CRISPR-Cas: razjašnjenje njegove regulacije istraživanjem stabilnosti proteina i prepisivanja u bakteriji Escherichia coli (Cas3 status) (MB: HRZZ-IP-2016-06-8861)
Pronađeno 32 radova
Prikaz po CROSBI kategorijama
-
1.Killelea, Tom; Dimude, Juachi U.; He, Liu; Stewart, Alison L.; Kemm, Fiona E.; Radovčić, Marin; Ivančić-Baće, Ivana; Rudolph, Christian J.; Bolt, Edward L.Cas1–Cas2 physically and functionally interacts with DnaK to modulate CRISPR Adaptation // Nucleic acids research, 51 (2023), 1-13 doi:10.1093/nar/gkad473 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.He, Liu; Jelić Matošević, Zoe; Mitić, Damjan; Markulin, Dora; Killelea, Tom; Matković, Marija; Bertoša, Branimir; Ivančić-Baće, Ivana; Bolt, Edward L.A Tryptophan ‘Gate’ in the CRISPR-Cas3 Nuclease Controls ssDNA Entry into the Nuclease Site, That When Removed Results in Nuclease Hyperactivity // International journal of molecular sciences, 22 (2021), 6; 2848, 19 doi:10.3390/ijms22062848 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
3.Markulin, Dora; Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Ivančić Baće, IvanaCRISPR-Cas in Escherichia coli: regulation by H-NS, LeuO and temperature // Periodicum biologorum, 121-122 (2020), 3-4; 155-160 doi:10.18054/pb.v121-122i3-4.10994 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Markulin, Dora; Ivančić Baće, IvanaStpA represses CRISPR-Cas immunity in H-NS deficient Escherichia coli // Biochimie, 174 (2020), 136-143 doi:10.1016/j.biochi.2020.04.020 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
5.Liu, He; James, Michael St. John; Radovcic, Marin; Ivancic-Bace, Ivana; Bolt, Edward L.Cas3 protein - a review of a multi-tasking machine // Genes, 11 (2020), 208; 1-14 doi:10.3390/genes11020208 (međunarodna recenzija, pregledni rad, znanstveni)
-
6.Kurilovich, Elena; Shiriaeva, Anna; Metlitskaya, Anastasia; Morozova, Natalia; Ivančić-Baće, Ivana; Severinov, Konstantin; Savitskaya, EkaterinaGenome maintenance proteins modulate autoimmunity mediated primed adaptation by the Escherichia coli type I-E CRISPR-Cas system // Genes, 10 (2019), 11; 872, 15 doi:10.3390/genes10110872 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
7.Radovčić, Marin; Čulo, Anja; Ivančić-Baće, IvanaCas3-stimulated runaway replication of modified ColE1 plasmids in Escherichia coli is temperature dependent // FEMS microbiology letters, 366 (2019), fnz106, 7 doi:10.1093/femsle/fnz106. (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
8.Radovčić, Marin; Killela, Tom; Savitskaya, Ekaterina; Wettstein, Lukas; Bolt, Edward L., Ivančić-Baće, IvanaCRISPR-Cas adaptation in Escherichia coli requires RecBCD helicase but not nuclease activity, is independent of homologous recombination, and is antagonized by 5' ssDNA exonucleases. // Nucleic acids research, 46 (2018), 19; 10173-10183 doi:10.1093/nar/gky799 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
9.Cubbon, Andrew; Ivančić-Baće, Ivana; Bolt, Edward L.CRISPR-Cas Immunity, DNA repair and Genome Stability // Bioscience reports, 38 (2018), 5; 1-10 doi:10.1042/BSR20180457 (međunarodna recenzija, pregledni rad, znanstveni)
-
1.Mitić, Damjan; Ivančić Baće, IvanaRegulacija aktivnosti sustava CRISPR-CAS u bakteriji Escherichia coli: uloga četvrtog promotora // ZBORNIK SAŽETAKA 14. HRVATSKOG BIOLOŠKOG KONGRESA s međunarodnim sudjelovanjem (BOOK OF ABSTRACTS OF THE 14th CROATIAN BIOLOGICAL CONGRESS with International Participation) / Caput Mihalić, Katarina ; Mičetić Stanković, Vlatka ; Urlić, Inga ; Mešić, Armin ; Kružić, Petar (ur.).
Zagreb: Hrvatsko biološko društvo, 2022. str. 11-12 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
2.Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Killelea, Tom; Liu, He, Bolt, Edward L.; Ivančić-Baće, IvanaCuriosities of Naïve and Primed CRISPR Adaptation in Escherichia Coli // 7th Croatian Congress of Microbiology, Book of Abstracts / Sviličić Petrić, Ines ; Leboš Pavunc, Andreja ; Šantić, Marina ; Kifer, Domagoj (ur.).
Zagreb: Croatian Microbiological Society, 2022. str. 80-80 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
3.Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Killelea, Tom; He, Liu; Bolt, Edward L.; Ivančić-Baće, IvanaCuriosities of naïve and primed CRISPR adaptation in E. coli // Annual conference 2022, 4-7 April, ICC Belfast / Besra, Del (ur.).
London : Delhi: microbiology society, 2022. str. 13-13 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
4.Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Markulin, Dora; Ivančić Baće, IvanaThe effect of the transcriptional repressor StpA on CRISPR-Cas activity in E. coli cells lacking H-NS // The 45th FEBS Virtual Congress
Ljubljana, Slovenija, 2021. str. 106-106 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo) -
5.He, Liu; Jelić Matošević, Zoe; Mitić, Damjan; Markulin, Dora; Killelea, Tom; Matković, Mrija; Bertoša, Branimir; Ivančić-Baće, Ivana and Bolt, Edward L.A tryptophan ‘gate’ in the CRISPR-Cas3 nuclease controls ssDNA entry into the nuclease site in Escherichia coli // CRISPR2021
Pariz, 2021. str. 98-98 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
6.He, Liu; Jelić Matošević, Zoe; Mitić, Damjan; Markulin, Dora; Killelea, Tom; Matković, Marija; Bertoša, Branimir; Ivančić-Baće, Ivana; Bolt, Edward L.A tryptophan ‘gate’ in the CRISPR-Cas3 nuclease controls ssDNA entry into the nuclease site in Escherichia coli // FEBS Open Bio, vol. 11, issue S1, Supplement: The 45th FEBS Congress: Molecules of Life: Towards New Horizons
Ljubljana, Slovenija, 2021. str. 3-3 doi:10.1002/2211-5463.13206 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
7.Markulin, Dora; Peharec Štefanić, Petra; Čulo, Anja; Pandžić, Marta; Matković, Marija; Ivančić Baće, IvanaTemperature-dependent structural changes in Cas3 protein in Escherichia coli // FEBS Open Bio, 9
Kraków, Poljska, 2019. str. 271-271 doi:10.1002/2211-5463.12675 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
8.Mitić, Damjan; Macuka, Marin; Peharec Štefanić, Petra; Ivančić Baće, IvanaCas3 protein levels in Escherichia coli stationary-phase cultures grown at different growth temperatures // HDBMB 2019 Crossroads in Life Sciences - Book of Abstracts / Katalinić, Maja ; Dulić, Morana ; Stuparević, Igor (ur.).
Zagreb, 2019. str. 103-103 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
9.Radovčić, Marin; Čulo, Anja; Ivančić Baće, IvanaCas3-stimulated runaway replication of modified ColE1 plasmids in Escherichia coli is temperature dependent // HDBMB 2019 Crossroads in Life Sciences - Book of Abstracts / Katalinić, Maja ; Dulić, Morana ; Stuparević, Igor (ur.).
Zagreb, 2019. str. 110-110 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
10.Radovčić, Marin; Čulo, Anja; Ivančić-Baće, IvanaCas3-stimulated runaway replication of ColE1 plasmids in Escherichia coli is temperature dependent // CRISPR2019 / Moineau, Sylvian ; Maxwell, Karen ; Davidson, Alan (ur.).
Quebec, 2019. str. 177-177 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
11.Radovčić, Marin; Wettstein, Lukas; Killelea, Tom; Bolt, Edward L.; Ivančić-Baće, IvanaInterplay of CRISPR adaptation, recombination and host nucleases in Escherichia coli // Book of abstracts of the 13th Croatian Biological Congress / Kružić, Petar ; Caput Mihalić, Katarina ; Gottstein, Sanja ; Pavoković, Dubravko ; Kučinić, Mladen (ur.).
Zagreb: Croatian Biological Society, 2018. str. 284-285 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
12.Ivančić Baće, Ivana; Markulin, Dora; Peharec-Štefanić, Petra; Majsec, Kristina; Čulo, Anja; Pandžić, Marta; Matković, MarijaIdentification of novel regulation of Cas3 activity in Escherichia coli. // FEBS3+ Conference: From Molecules to Living Systems : Final Programme & Book of Abstracts / Szüts, Dávis ; Buday, László (ur.).
Veszprém: OOK-Press, 2018. str. 42-42 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
13.Radovčić, Marin; Wettstein, Lukas; Killelea, Tom; Bolt, Edward L.; Ivančić-Baće, IvanaInterplay of host nucleases, RecBCD and CRISPR-Cas adaptation in Escherichia coli // CRISPR 2018 / Šikšnys, Virginijus ; Horvath, Philippe ; Barrangou, Rodolphe (ur.).
Vilnius: CRISPR 2018, 2018. str. 172-172 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
14.Radovčić, Marin; Wettstein, Lukas; Killelea, Tom; Bolt, Edward L.; Ivančić-Baće, IvanaInterplay of host nucleases, RecBCD and CRISPR-Cas adaptation in Echerichia coli. // Mechanisms of recombination / West, Steve (ur.).
London : Delhi: Abcam, 2018. str. 48-48 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
15.Radovčić, Marin; Bolt, Edward L., Ivančić-Baće, IvanaInterplay of recombination, plasmid stability, and CRISPR-Cas immunity in Escherichia coli // Cell Symposia CRISPR: From biology to technology and novel therapeutics / Pham, John ; Saxe, Jon ; Joung, Keith ; May, Andy (ur.).
online: Cell Press, Elsevier, 2017. str. 3-3 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
1.Mitić, Damjan; Radovčić, Marin; Markulin, Dora; Ivančić Baće, IvanaStpA represses CRISPR-Cas immunity in H-NS deficient Escherichia coli // CRISPR2021 Conference
online, 2021. str. 141-141 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
1.Damjan MitićMehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli, 2023., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
2.Radovčić, MarinUloga enzima RecBCD i drugih nukleaza u CRISPR- Cas naivnoj adaptaciji u bakteriji Escherichia coli, 2021., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet/ Biološki odsjek, Zagreb
-
1.Patricija KnechtlUtjecaj brzine rasta na efikasnost adaptacije sustavom CRISPR-Cas u bakterija Escherichia coli različitih genetičkih pozadina, 2022., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
2.Peter, KlaraUtjecaj različitih gena na zaštitnu ulogu sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli, 2021., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet/ Biološki odsjek, Zagreb
-
3.Barbarić, LeaOdređivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Echerichia coli, 2021., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet/ Biološki odsjek, Zagreb
-
4.Pravica, MihaelaUtjecaj šaperona HtpG na količine proteina Cas3 i zaštitu od infekcije fagom lambda u ovisnosti o temperaturi u bakteriji Escherichia coli, 2020., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
5.Macuka, MarinOdređivanje količine proteina Cas3 u mutantima ∆hns i ∆htpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta, 2019., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
