Pregled po projektu: Aminoacil-tRNA-sintetaze kao čuvari standardnog genetičkog koda (AARSCODE) (MB: HRZZ-IP-2016-06-6272)
Pronađeno 48 radova
Prikaz po CROSBI kategorijama
-
1.Živković, Igor; Ivković, Kate; Cvetešić, Nevena; Maršavelski, Aleksandra; Gruić Sovulj, ItaNegative catalysis by the editing domain of class I aminoacyl-tRNA synthetases // Nucleic acids research, 50 (2022), 7; 4029-4041 doi:10.1093/nar/gkac207 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.Pang, Luping; Zanki, Vladimir; Strelkov, Sergei V.; Van Aerschot, Arthur; Gruić Sovulj, Ita; Weeks, Stephen D.Partitioning of the initial catalytic steps of leucyl-tRNA synthetase is driven by an active site peptide-plane flip // Communications biology, 5 (2022), 1; 883, 12 doi:10.1038/s42003-022-03825-8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
3.Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Antičević, Ivan; Rokov-Plavec, Jasmina; Maršavelski, AleksandraImportance of protein intrinsic conformational dynamics and transient nature of non-covalent interactions in ligand binding affinity // International journal of biological macromolecules, 192 (2021), 692-700 doi:10.1016/j.ijbiomac.2021.10.045 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.López-Méndez, Blanca; Baron, Bruno; Brautigam, Chad A.; Jowitt, Thomas A.; Knauer, Stefan H.; Uebel, Stephan; Williams, Mark A.; Sedivy, Arthur; Abian, Olga; Abreu, Celeste et al.Reproducibility and accuracy of microscale thermophoresis in the NanoTemper Monolith: a multi laboratory benchmark study // European biophysics journal, 50 (2021), 411-427 doi:10.1007/s00249-021-01532-6 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
5.Baranašić, Jurica; Mihalak, Anita; Gruić Sovulj, Ita; Bauer, Nataša; Rokov Plavec, JasminaExpression of genes for selected plant aminoacyl- tRNA synthetases in the abiotic stress // Acta botanica Croatica, 80 (2021), 1; 35-42 doi:10.37427/botcro-2021-010 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
6.Despotović, Dragana; Longo, Liam M; Aharon, Einav; Kahana, Amit; Scherf, Tali; Gruic-Sovulj, Ita; Tawfik, Dan SPolyamines Mediate Folding of Primordial Hyperacidic Helical Proteins // Biochemistry (Easton), 59 (2020), 46; 4456-4462 doi:10.1021/acs.biochem.0c00800 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
7.Tawfik, Dan; Gruic-Sovulj, ItaHow evolution shapes enzyme selectivity - lessons from aminoacyl-tRNA synthetases and other amino acid utilizing enzymes // The FEBS journal, 287 (2020), 7; 1284-1305 doi:10.1111/febs.15199 (međunarodna recenzija, pregledni rad, znanstveni)
-
8.Živković, Igor; Moschner, Johann; Koksch, Beate; Gruić Sovulj, ItaMechanism of discrimination of isoleucyl-tRNA synthetase against nonproteinogenic a- aminobutyrate and its fluorinated analogues // The FEBS journal, 287 (2020), 800-813 doi:10.1111/febs.15053 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
9.Biluš, Mirna; Šemanjski, Maja; Močibob, Marko; Živković, Igor; Cvetešić, Nevena; Tawfik, Dan; Toth-Petroczy, Agnes; Maček, Boris; Gruić-Sovulj, ItaOn the Mechanism and Origin of Isoleucyl-tRNA Synthetase Editing against Norvaline // Journal of molecular biology, 431 (2019), 6; 1284-1297 doi:10.1016/j.jmb.2019.01.029 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
10.Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Kekez, Ivana; Baranašić, Jurica; Hodnik, Vesna; Duchêne, Anne- Marie; Anderluh, Gregor; Gruić Sovulj, Ita; Matković-Čalogović, Dubravka; Weygand-Đurašević, Ivana; Rokov Plavec, JasminaArabidopsis seryl-tRNA synthetase: the first crystal structure and novel protein interactor of plant aminoacyl-tRNA synthetase // The FEBS journal, 286 (2019), 3; 536-554 doi:10.1111/febs.14735 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
11.Dulić, Morana; Cvetešić, Nevena; Živković, Igor; Palencia, Andrés; Cusack, Stephen; Bertoša, Branimir; Gruić-Sovulj, ItaKinetic Origin of Substrate Specificity in Post-Transfer Editing by Leucyl-tRNA Synthetase // Journal of molecular biology, 430 (2018), 1; 1-16 doi:10.1016/j.jmb.2017.10.024 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
1.Močibob, Marko; Pranjić, Marija; Šemanjski Čurković, Maja; Spät, Philipp; Maček, Boris; Gruić-Sovulj, ItaProteome response to mistranslation // Book of Abstracts of the 1st Workshop on Mass Spectrometry in Life Sciences / Novak, Ruđer ; Dulić, Morana ; Horvatić, Anita ; Močibob, Marko ; Pranjić, Marija (ur.).
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2022. str. L2-L2 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni) -
2.Ević, Valentina; Šoić, Ružica; Matković-Čalogović, Dubravka; Gruić Sovulj, Ita; Kekez, Ivana; Rokov Plavec, JasminaContrasting effect of evolutionary conserved cysteines on the stability of plant seryl-tRNA synthetase // Book of Abstracts of the Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Grafokor d.o.o., 2022. str. 131-131 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
3.Ević, Valentina; Peharec Štefanić, Petra; Gruić Sovulj, Ita; Rokov Plavec, JasminaBeneficial effect of mistranslation on proliferation and viability of bacteria Escherichia coli in oxidative stress // HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2022. str. 45-45 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
4.Ević, Valentina; Peharec Štefanić, Petra; Gruić Sovulj, Ita; Rokov Plavec, JasminaMistranslation helps Escherichia coli to adapt to oxidative stress // The Biochemistry Global Summit, 25th IUBMB Congress, 46th FEBS Congress, 15th PABMB Congress, July 9–14, 2022, Lisbon, Portugal
Lisabon: FEBS Press, 2022. str. 225-225 doi:10.1002/2211-5463.13440 (poster, sažetak, znanstveni) -
5.Ević, Valentina; Peharec Štefanić, Petra; Gruić Sovulj, Ita; Rokov Plavec, JasminaThe role of mistranslation in oxidative stress response in bacteria Escherichia coli // 6. simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : knjiga sažetaka = 6th PhD student symposium : book of abstracts / Schneider, Petra (ur.).
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2022. str. 88-89 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
6.Rokov Plavec, Jasmina; Kekez, Mario; Ević, Valentina; Zanki, Vladimir; Šoić, Ružica; Matković-Čalogović, Dubravka; Kekez, IvanaEmerging noncanonical functions of plant aminoacyl- tRNA synthetase // FEBS Open Bio, vol. 11, issue S1, Supplement: The 45th FEBS Congress: Molecules of Life: Towards New Horizons
Ljubljana, Slovenija, 2021. str. 14-14 doi:10.1002/2211-5463.13206 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
7.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaIsoleucyl-tRNA synthetase editing domain accepts broad range of amino acids that are efficiently discriminated at the synthetic active site // Programme and abstract book of the 20th FEBS Young Scientists’ Forum
Lovran, Hrvatska, 2021. str. 60-60 (poster, sažetak, znanstveni) -
8.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaIsoleucyl-tRNA synthetase editing domain accepts broad range of amino acids that are efficiently discriminated at the synthetic active site // FEBS Open Bio, vol. 11, issue S1, Supplement: The 45th FEBS Congress: Molecules of Life: Towards New Horizons
Ljubljana, Slovenija, 2021. str. 148-149 doi:10.1002/2211-5463.13205 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni) -
9.Ević, Valentina; Gruić Sovulj, Ita; Rokov- Plavec, JasminaInfluence of mistranslation stress on oxidative stress response in bacteria Escherichia coli // 45th FEBS Congress: Molecules of Life: Towards New Horizons
Ljubljana: FEBS Press, 2021. str. 154-155 doi:10.1002/2211-5463.13205 (poster, sažetak, znanstveni) -
10.Ević, Valentina; Gruić Sovulj, Ita; Rokov Plavec, JasminaEffect of mistranslation and oxidative stress on growth and viability of bacteria Escherichia coli // 5th Faculty of Science PhD Student Symposium 2021 : book of abstracts / Barišić, Dajana (ur.).
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2021. str. 324-325 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
11.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaIzoleucil-tRNA-sintetaza hidrolizira tRNA misacilirane aminokiselinama koje su efikasno diskriminirane u sintetskom mjestu // Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : Knjiga sažetaka / Rončević, Sanda ; Barišić, Dajana (ur.).
Zagreb, 2020. str. 27-27 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
12.Pranjić, Marija; Močibob, Marko; Šemanjski, Maja; Spät, Phillip; Maček, Boris; Gruić-Sovulj, ItaUtjecaj kanonske i nekanonske mistranslacije na proteostazu stanice // Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : Knjiga sažetaka / Rončević, Sanda ; Barišić, Dajana (ur.).
Zagreb, 2020. str. 110-110 (poster, sažetak, ostalo) -
13.Gruic-Sovulj, ItaWhat shaped selectivity of the class I editing domain? // 12th International Symposium on Aminoacyl-tRNA Symthetases / Min-Xin Guan (ur.).
Hangzhou, Kina, 2019. str. 18-18 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
14.Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Kekez, Ivana; Matković-Čalogović, Dubravka; Rokov Plavec, JasminaPlant seryl-tRNA synthetase as a link between translation and metabolism of brassinosteroid hormones // Molecular biophysics : ABC of the puzzle of life, book of abstracts / Ivošević DeNardis, Nadica ; Campos-Olivas, Ramon ; Miele, E. Miele ; England, Patrick ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković ; Croatian Biophysical Society, 2019. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
15.Rokov Plavec, Jasmina; Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Kekez, Ivana; Matković-Čalogović, DubravkaPlant seryl-tRNA synthetase as a link between translation and metabolism of brassinosteroid hormones // HDBMB2019 - Crossroads in Life Sciences : Book of abstracts / Katalinić, Maja ; Dulić, Morana ; Stuparević, Igor (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2019. str. 113-113 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
16.Močibob, Marko; Biluš, Mirna; Šemanjski, Maja; Živković, Igor; Cvetešić, Nevena; Maček, Boris; Gruić Sovulj, ItaMaintaining the protein biosynthesis fidelity by isoleucyl-tRNA synthetase // HDBMB2019 - Crossroads in Life Sciences : Book of abstracts / Katalinić, Maja ; Dulić, Morana ; Stuparević, Igor (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo za biokemiju i molekularnu biologiju (HDBMB), 2019. str. 49-49 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni) -
17.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaWhat tailors discrimination against smaller hydrophobic amino acids in isoleucyl-tRNA synthetase? // Advanced Course Trends in Enzymology and Biocatalysis
Rim, 2019. str. 56-56 (poster, sažetak, znanstveni) -
18.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaHow hydrophobicity modulates amino acid discrimination by isoleucyl-tRNA synthetase? // 26. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera / Galić, Nives ; Rogošić, Marko (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2019. str. 83-83 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
19.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaDiscrimination of α-aminobutyrate and its fluorinated analogues in the synthetic and editing reactions of isoleucyl-tRNA synthetase // Molecular biophysics : ABC of the puzzle of life, book of abstracts / Ivošević DeNardis, Nadica ; Campos-Olivas, Ramon ; Miele, Adriana E. ; England, Patrick ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković ; Croatian Biophysical Society, 2019. str. 142-143 (poster, sažetak, znanstveni) -
20.Pranjić, Marija; Močibob, Marko; Šemanjski, Maja; Maček, Boris; Gruić Sovulj, ItaCellular responses to proteome-wide isoleucine mistranslation // Molecular Biophysics: ABC of the puzzle of Life : Book of abstracts / Ivošević DeNardis, Nadica ; Campos-Olivas, Ramon, Miele, Adriana E. ; England, Patrick ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Ruđer Bošković Institute, Croatian Biophysical Society, 2019. str. 116-117 (poster, sažetak, znanstveni) -
21.Živković, Igor; Gruić Sovulj, ItaMehanizmi diskriminacije izoleucil-tRNA-sintetaze prema α-aminobutiratu i njegovim fluoriranim analozima // Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : Knjiga sažetaka / Primožič, Ines (ur.).
Zagreb, 2019. str. 32-32 (poster, sažetak, znanstveni) -
22.Biluš, Mirna; Šemanjski, Maja; Močibob, Marko; Živković, Igor; Cvetešić, Nevena; Tawfik, Dan; Toth-Petroczy, Agnes; Gruić-Sovulj, ItaTrimming a branch: norvaline is more toxic than valine in isoleucine mistranslation // 3rd International Conference on Post-Translational Modifications in Bacteria
Tübingen, 2018. str. 33-33 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
23.Biluš, Mirna; Šemanjski Maja; Močibob, Marko; Toth- Petroczy, Agnes; Maček, Boris; Gruić- Sovulj, ItaIleRS editing primarily targets norvaline whose misincorporation is more toxic than of valine // 27th tRNA conference / Gigie, Philippe ; Drouard, Laurence (ur.).
Strasbourg, 2018. str. 224-224 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
24.Baranasic, Jurica; Kekez, Mario; Mihalak, Anita; Jasmina, Rokov PlavecPlant aminoacyl-tRNA synthetases in abiotic stress // FEBS3+ From molecules to living systems / Dávid Szüts, Laszlo Buday (ur.).
Veszprém: OOK-Press Ltd., 2018. str. 114-114 (poster, sažetak, znanstveni) -
25.Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Kekez, Ivana; Matković-Čalogović, Dubravka; Rokov-Plavec, JasminaWhere translation meets plant steroid metabolism: interaction of seryl-tRNA synthetase and BEN1 protein from Arabidopsis thaliana // FEBS3+ From molecules to living systems / Dávid Szüts, Laszlo Buday (ur.).
Veszprém: FEBS3+, 2018. str. 97-97 (predavanje, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni) -
26.Živković, Igor; Gruić-Sovulj, ItaKinetička razdioba u sintetskom mjestu izoleucil- tRNA-sintetaze određuje mehanizam diskriminacije nepripadnih aminokiselina // Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : knjiga sažetaka / Primožič, Ines (ur.).
Zagreb, 2018. str. 31-31 (poster, sažetak, znanstveni) -
27.Gruić-Sovulj, ICrosstalk of the synthetic and editing pathways that excludes artificial amino acids from translation // Book of abstracts, IUBMB Focused Meeting on the Aminoacyl-tRNA synthetases / Alexander, Rebecca ; Francklyn, Christopher ; Roy, Herve (ur.).
Lahti, 2017. str. 74-74 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni) -
28.Gruić-Sovulj, ItaMaintaining the Canonical Amino Acid Alphabet: a Story about Aminoacyl-tRNA Synthetases // 25. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera : Knjiga sažetaka / Šantić, Ana ; Đaković, Marijana (ur.).
Poreč: Hrvatsko kemijsko društvo, 2017. str. 51-51 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni) -
29.Živković, Igor; Dulić, Morana; Cvetešić, Nevena; Bertoša, Branimir; Gruić-Sovulj, ItaExclusion of the cognate substrate from the leucyl - tRNA synthetase editing pathway // 25. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera : Knjiga sažetaka / Šantić, Ana ; Đaković, Marijana (ur.).
Poreč: Hrvatsko kemijsko društvo, 2017. str. 208-208 (poster, sažetak, znanstveni) -
1.Rokov Plavec, Jasmina; Ević, Valentina; Kekez, Mario; Kekez, Ivana; Šoić, Ružica; Houser, Josef; Wimmerová, Michaela; Matković-Čalogović, DubravkaImportance of the disulfide link in the stability of cytosolic protein // ARBRE-MOBIEU Plenary Meeting - Living Molecules: towards Integrative Biophysics of the Cell
Prag, Češka Republika, 2020. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni) -
2.Pranjić, Marija; Močibob, Marko; Šemanjski, Maja; Maček, Boris; Gruić Sovulj, ItaCellular responses to proteome-wide isoleucine mistranslation // EMBO Practical Course, Quantitative Proteomics: Strategies and Tools to Probe Biology
Heidelberg, Njemačka, 2019. (poster, neobjavljeni rad, znanstveni) -
1.Živković, IgorMehanizmi ostvarivanja supstratne specifičnosti u sintetskom i korektivnom mjestu izoleucil-tRNA- sintetaze, 2021., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
1.Prosinečki, MarkoUtjecaj mistranslacije i oksidacijskog stresa na bakteriju Escherichia coli, 2023., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
2.Brkić, AlojzijeUtjecaj mistranslacije na stabilnost modelnih proteina u staničnom ekstraktu, 2019., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
3.Antičević, IvanAnaliza proteinskih interakcija mikrotermoforezom ; Nastavni kromatografski pokusi, 2019., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
4.Hloušek-Kasun, AndreaElongacijski faktor Tu kao potencijalni marker mistranslacijskog stresa u bakteriji Escherichia coli, 2018., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
5.Viher, MarijaDrevni proteini kao termički stabilniji analozi postojećih proteina, 2017., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
