Pregled po projektu: KSA kompjutorsko istraživanje repeticija višeg reda i duplikona u humanom genomu (MB: MZOS-119-0982464-1253)
Pronađeno 34 radova
-
1.Rosandić, Marija; Paar, Vladimir; Glunčić, MatkoFundamental role of start/stop regulators in whole DNA and new trinucleotide classification // Gene, 531 (2013), 2; 184-190 doi:10.1016/j.gene.2013.09.021 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.Glunčić, Matko; Paar, VladimirDirect mapping of symbolic DNA sequence into frequency domain in global repeat map algorithm // Nucleic acids research, 41 (2013), 1; e17-1 doi:10.1093/nar/gks721 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
3.Ananthanarayanan, Vaishnavi; Schattat, Martin; Vogel, Sven K.; Krull, Alexander; Pavin, Nenad; Tolić-Nørrelykke, Iva M.Dynein motion switches from diffusive to directed upon cortical anchoring // Cell, 153 (2013), 7; 1526-1536 doi:10.1016/j.cell.2013.05.020 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.Kalinina, Iana; Nandi, Amitabha; Delivani, Petrina; Chacón, Mariola R.; Klemm, Anna H.; Ramunno-Johnson, Damien; Krull, Alexander; Lindner, Benjamin; Pavin, Nenad; Tolić-Nørrelykke, Iva M.Pivoting of microtubules around the spindle pole accelerates kinetochore capture // Nature cell biology, 15 (2013), 82-87 doi:10.1038/ncb2640 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
5.Rosandić, Marija; Matko, Glunčić; Paar, VladimirStart/stop codon like trinucleotides extensions in primate alpha satellites // Journal of theoretical biology, 317 (2013), 301-309 doi:10.1016/j.jtbi.2012.09.022 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
6.Pavin, Nenad; Laan, Liedewij; Ma, Rui; Dogterom, Marileen; Jülicher, FrankPositioning of microtubule organizing centers by cortical pushing and pulling forces // New journal of physics, 14 (2012), 105025-1 doi:10.1088/1367-2630/14/10/105025 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
7.Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Jelovina, Denis; Dekanić, Krešimir; Vlahović, Ines; Paar, VladimirGlobal repeat map method for higher order repeat alpha satellites in human and chimpanzee genomes (build 37.2 assembly) // Croatica chemica acta, 85 (2012), 3; 327-351 doi:10.5562/cca1987 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
8.Laan, Liedewij; Pavin, Nenad; Husson, Julien; Romet-Lemonne, Guillaume; van Duijn, Martijn; Preciado López, Magdalena; Vale, Ronald D.; Jülicher, Frank; Reck-Peterson, Samara L.; Dogterom, MarileenCortical Dynein Controls Microtubule Dynamics to Generate Pulling Forces that Position Microtubule Asters // Cell, 148 (2012), 3; 502-514 doi:10.1016/j.cell.2012.01.007 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
9.Jelovina, DenisDirektno preslikavanje simboličke sekvence u frekvencijsko područje, 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
10.Kadežabek, TomislavIstraživanje periodičnih struktura u genomskoj sekvenci, 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
11.Bošnjak VladimirPrimjena fraktalne geometrije u analizi sekvenci, 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički, Zagreb
-
12.Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, VladimirStart/stop codon-like trinucleotides (CLTs) and extended clusters as new language of DNA // Croatica chemica acta, 84 (2011), 2; 331-341 doi:10.5562/cca1948 (podatak o recenziji nije dostupan, prethodno priopćenje, znanstveni)
-
13.Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Basar, Ivan; Vlahović, InesIntragene higher order repeats in neuroblastoma breakpoint family genes distinguish humans from chimpanzees // Molecular biology and evolution, 28 (2011), 6; 1877-1892 doi:10.1093/molbev/msr009 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
14.Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Paar, Petar; Cvitković, MislavLarge tandem, higher order repeats and regularly dispersed repeat units contribute substantially to divergence between human and chimpanzee Y chromosomes // Journal of molecular evolution, 72 (2011), 1; 34-55 doi:10.1007/s00239-010-9401-8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
15.Kalinina, Iana M.; Krstić, Vladimir; Tolić- Norrelykke, Iva MarijaCell polarity : which way to grow in an electric field? // Current biology, 20 (2010), 8; R355-R356 doi:10.1016/j.cub.2010.03.022 (podatak o recenziji nije dostupan, vijest, znanstveni)
-
16.Leduc, C.; Pavin, Nenad; Julicher, F.; Diez, S.Collective behavior of antagonistically acting kinesin-1 motors // Physical Review Letters, 105 (2010), 12; 128103-1 doi:10.1103/PhysRevLett.105.128103 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
17.Pavić, AnaIstraživanje globalne repeticijske mape periodičnih i superperiodičnih struktura u ljudskom kromozomu 20, 2010., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
18.Rosandić Pilaš, MarijaOpća i specijalna gastroenterološka endoskopija. Zagreb: Školska knjiga, 2010 (sveučilišni udžbenik)
-
19.Kelić, AnaAproksimativne superperiodičnosti i supersimetrije u kvazikristalnoj strukturi ljudskog genoma, 2009., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
20.Vogel, S.K.; Pavin, Nenad; Maghelli, N.; Julicher, F.; Tolić-Norrelykke, Iva MarijaMicrotubules and motor proteins : Mechanically regulated self-organization in vivo // European physical journal-special topics, 178 (2009), 57-69 doi:10.1140/epjst/e2010-01182-6 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
21.Paar, VladimirOd HNOS-a do nacionalnog kurikula // Vukovarsko-srijemski učitelj, 6 (2009), 7-14 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, stručni)
-
22.Vogel, S.; Pavin, Nenad; Maghelli, N.; Julicher, F; Tolić-Norrelykke, Iva M.Self-organization of dynein motors generates meiotic nuclear oscillations // PLoS biology, 7 (2009), 4; 918-928 doi:10.1371/journal.pbio.1000087 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
23.Krstić, VladimirTrodimenzionalni stohastički reakcijsko-difuzijski model za opis oscilacija Min familije proteina u bakteriji Escherichia coli, 2008., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
24.Glunčić, MatkoIstraživanje korelacija periodičnosti u sekvenci ljudskog genoma, 2008., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
25.Vladimir PaarPromjena odgojno-obrazovne paradigme - temelj HNOS-a i HNAK-a // Hrvatsko školstvo sadašnje stanje i vizija razvoja / Stanko Popović (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2008. str. 15-22 (poster, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
26.Paar, VladimirHNOS je okvir za Nacionalni kurikulum (nacionalni nastavni plan) // Hrvatski obrazovni sustav u odnosu prema obrazovnoj politici Europske unije / Bobinski, Vesna ; Klinger, Ljiljana ; Kolar-Billege, Martina ; Rukljač, Igor (ur.).
Zagreb: Hrvatski pedagoško-književni zbor, 2008. str. 14-30 (plenarno, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo) -
27.Paar, Vladimir; Pavin, Nenad; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, NilsHierarchical structure of cascade of primary and secondary periodicities in Fourier power spectrum of alphoid higher order repeats // BMC bioinformatics, 9 (2008), 466-1 doi:10.1186/1471-2105-9-466 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
28.Paar, Vladimir; Rosandić, Marija; Basar, Ivan; Glunčić, Matko; Pavin, NenadKey string algorithm - New computational method for identification and analysis of very long repeats in genomic sequences // Application of Genomics and Bioinformatics in Plants / Rao, G.P. ; Wagner, C. ; Singh, R.K. (ur.).
Houston (TX): Studium Press, 2008. str. 91-120 -
29.Paar, VladimirProces Galilei // Vjesnik Đakovačke i Srijemske biskupije, 2 (2008), 180-182 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, ostalo)
-
30.Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, Vladimir; Basar, IvanThe role of alphoid higher order repeats (HORs) in the centromere folding // Jounal of Theoretical Biology, 254 (2008), 3; 555-560 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
31.Engelsfeld, Tihomir; Šumanovac, Franjo; Pavin, NenadInvestigation of underground cavities in a two-layer model using the refraction seismic method // Near Surface Geophysics, 6 (2008), 4; 221-231 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
32.Rubčić, Antun; Rubčić, Jasna; Chickos, J.S.Modeling and physical properties of a homologous series on the melting temperatures and densities of n-alkanes and their simple alkyl-derivatives // E-Polymers, 8 (2008), 1; 036, 15 doi:10.1515/epoly.2008.8.1.403 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
33.Paar, Vladimir; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Glunčić, MatkoConsensus higher order repeats and frequency of string distributions in human genome // Current Genomics, 8 (2007), 93-111 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
34.Krstić, Vladimir; Maglica, Željka; Čipčić Paljetak, Hana; Podobnik, Boris; Pavin, NenadMin-protein oscillations in E. Coli: three-dimensional off-lattice stochastic reaction-diffusion model // Journal of Statistical Physics, 128 (2007), 1/2; 5-20 doi:10.1007/s10955-006-9189-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
