Pregled po CROSBI profilu: Antonija Tomić (CROSBI Profil: 30600, MBZ: 326513)
Pronađeno 43 radova
-
1.Tomić, Antonija; Karačić, Zrinka; Tomić, SanjaInfluence of Mutations of Conserved Arginines on Neuropeptide Binding in the DPP III Active Site // Molecules, 28 (2023), 4; 1976, 17 doi:10.3390/molecules28041976 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.Matić, Antonia; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Tomić SanjaDipeptidyl peptidase iii inhibition tests by metal dications // Book of Abstracts of the Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2022. str. 105-105 (poster, sažetak, znanstveni) -
3.Karačić, Zrinka; Šupljika, Filip; Tomić, Antonija; Brkljačić, Lidija; Tomašić Paić, Ana; Ćehić, Mirsada; Tomić, SanjaNeuropeptides, substrates and inhibitors of human dipeptidyl peptidase III, experimental and computational study — A new substrate identified // International journal of biological macromolecules, 220 (2022), 1390-1401 doi:10.1016/j.ijbiomac.2022.09.119 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkljačić, Lidija; Šupljika, FilipNeuropeptides - substrates of dipeptidyl peptidase III // From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Hrvatsko Društvo za Biotehnologiju, 2022. str. 151-151 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
5.Tomić, Antonija; Karačić, Zrinka; Šupljika, Filip; Tomić, SanjaComputational modelling an aid to understand binding and hydrolysis of neuropeptides in the active site of human DPP III // Book of abstracts of the 1st Central and Eastern European Conference on Physical Chemistry and Materials Science (CEEC-PCMS1) / Erceg, Matko ; Rotaru, Andrei ; Vrsalović, Ladislav (ur.).
Split, Hrvatska: Central and Eastern European Committee for Thermal Analysis and Calorimetry (CEEC-TAC), 2022. str. 196-196 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
6.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaComputational study of the human DPP III catalyzed peptide hydrolysis - difference between „good“ and „slow“ substrate // Math/Chem/Comp 2022 and 33rd MC2 Conference : Book of Abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy ; Namjesnik, Danijel (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2022. str. 24-24 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
7.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaDemystifying DPP III Catalyzed Peptide Hydrolysis— Computational Study of the Complete Catalytic Cycle of Human DPP III Catalyzed Tynorphin Hydrolysis // International journal of molecular sciences, 23 (2022), 3; 1858, 24 doi:10.3390/ijms23031858 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
8.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaUnderstanding the human DPP iii substrate specificity : QM/MM and MD calculations // Math/Chem/Comp 2021 : 32nd MC2 Conference : book of abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy ; Namjesnik, Danijel (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2021. str. 42-42 (poster, sažetak, znanstveni) -
9.Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Matić, Antonia; Tomić, SanjaUnravelling the inhibitory zinc ion binding site and the metal exchange mechanism in human DPP III // PCCP. Physical chemistry chemical physics, 23 (2021), 13267-13275 doi:10.1039/D1CP01302E (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
10.Matić, Antonia; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Tomić, SanjaIspitivanja inhibicije dipeptidil peptidaze III metalnim dikationima // Knjiga sažetaka - 18. Ružičkini dani: Danas znanost - Sutra industrija / Jukić, Ante (ur.).
Zagreb : Osijek: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI) Prehrambeno-tehnološki fakultet Osijek Sveučilišta J. J. Strosssmayera u Osijeku, 2020. str. 78-78 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
11.Tomić, Antonija; Horvat, Gordan; Ramek, Michael; Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, SanjaDevelopment of new zinc ion parameters suitable for classical MD simulations of zinc metallo-peptidases // Computational Chemistry Day 2019 :Book of abstracts
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2019. str. 3-3 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
12.Tomić, Antonija; Horvat, Gordan; Ramek, Michael; Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, SanjaNew zinc ion parameters suitable for classical MD simulations of zinc metallo-peptidases // Journal of chemical information and modeling, 59 (2019), 8; 3437-3453 doi:10.1021/acs.jcim.9b00235 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
13.Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Kazazić, Saša; Tomić, Antonija; Abramić, MarijaAprotinin interacts with substrate-binding site of human dipeptidyl peptidase III // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 37 (2019), 14; 3596-3606 doi:10.1080/07391102.2018.1521343 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
14.Tomin, Marko; Tomić, Antonija; Kovačević, Borislav; Tomić, SanjaThe Mechanism of Peptide Hydrolysis Catalysed by Dipeptidyl Peptidase III from Bacteroides thetaiotaomicron // Croatica chemica acta, 91 (2018), 2; 187-193 doi:10.5562/cca3343 (recenziran, članak, znanstveni)
-
15.Tomić, Antonija; Ramek, Michael; Tomić, SanjaDevelopment of new parameters for the Zn2+ ion for the specific environment of the DPP III enzyme catalytic site // Computational Chemistry Day Book of abstracts
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2018. str. 15-15 (poster, sažetak, znanstveni) -
16.Kazazić, Saša; Karačić, Zrinka; Sabljić, Igor; Agić, Dejan; Tomin, Marko; Abramić, Marija; Dadlez, Michal; Tomić, Antonija; Tomić, SanjaConservation of the conformational dynamics and ligand binding within M49 enzyme family // RSC Advances, 8 (2018), 24; 13310-13322 doi:10.1039/c7ra13059g (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
17.Sabljić, Igor; Tomin, Marko; Matovina, Mihaela; Sučec, Iva; Tomašić Paić, Ana; Tomić, Antonija; Abramić, Marija; Tomić, SanjaThe first dipeptidyl peptidase III from a thermophile: Structural basis for thermal stability and reduced activity // PLoS One, 13 (2018), 2; e0192488, 25 doi:10.1371/journal.pone.0192488 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
18.Tomić, Sanja; Kovačević, Borislav; Tomić, Antonija; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Matić, Sara; Abramić, Marija; Agić, DejanUnderstanding h.DPP III mechanism – an aid in rationalization of the mutants (in)activity // 19th IUPAB and 11th EBSA : Abstracts, European Biophysics Journal, Volume 46, Supplement 1
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S179-S179 doi:10.1007/s00249-017-1222-x (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
19.Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Gundić, MarioInfluence of ligands and protein binding to structure and flexybility of human dipeptidyl peptidase III // Conference proceedings of ICBMB 2016, International Conference on Biochemistry and Molecular Biology
Venecija, Italija, 2016. str. 9-9 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
20.Gundić, Mario; Tomić, Antonija; Wade, Rebecca C.; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Kazazić, Saša; Tomić, SanjaHuman DPP III – Keap1 Interactions : A Combined Experimental And Computational study // Croatica chemica acta, 89 (2016), 2; 217-228 doi:10.5562/cca2916 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
21.Tomić, Antonija; Kovačević, Borislav; Tomić, SanjaConcerted nitrogen inversion and hydrogen bonding to Glu451 are responsible for protein-controlled suppression of the reverse reaction in the human DPP III // Physical Chemistry Chemical Physics, 18 (2016), 39; 27245-27256 doi:10.1039/C6CP04580D (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
22.Tomić, Sanja; Tomić, AntonijaLigand binding to the flexible metaloenzymes: protein dynamics and the active enzyme conformation // European Biophysics Journal 2015, Volume 44, Supplement 1
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. 243-243 doi:10.1007/s00249-015-1045-6 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo) -
23.Tomić, AntonijaPrimjena računalnih pristupa različitih stupnjeva složenosti u svrhu razumijevanja strukture, dinamike i aktivnosti ljudske dipeptidil-peptidaze III, 2015., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
24.Tomić, Antonija; Berynskyy, Mykhaylo; Wade, Rebecca C.; Tomić, SanjaMolecular simulations reveal that the long range fluctuations of human DPP III change upon ligand binding // Molecular biosystems, 11 (2015), 3068-3080 doi:10.1039/c5mb00465a (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
25.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaHunting the human DPP III active conformation : combined thermodynamic and QM/MM calculations // Dalton transactions, 43 (2014), 15503-15514 doi:10.1039/C4DT02003K (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
