Pregled po CROSBI profilu: Sanja Tomić (CROSBI Profil: 28532, MBZ: 113604)
Pronađeno 265 radova
-
51.Matić, Sara; Karačić, Zrinka; Gruber, Karl; Tomić, SanjaCombination of SAXS and molecular modeling in structure-function characterization of the plant DPP III orthologue // 7th Visegrad Symposium on Structural Systems Biology : Program & Abstracts
Nové Hrady, 2017. str. P6-P6 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni) -
52.Tomić, Sanja; Kovačević, Borislav; Tomić, Antonija; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Matić, Sara; Abramić, Marija; Agić, DejanUnderstanding h.DPP III mechanism – an aid in rationalization of the mutants (in)activity // 19th IUPAB and 11th EBSA : Abstracts, European Biophysics Journal, Volume 46, Supplement 1
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S179-S179 doi:10.1007/s00249-017-1222-x (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
53.Tomić, Sanja; Kazazić, Saša; Abramić, Marija; Tomin, Marko; Agić, Dejan; Karačić, Zrinka; Grabar-Branilović, MarinaH/D exchange and MD simulation study of dipeptidyl peptidase III intrinsic dynamics and ligand binding // 19th IUPAB and 11th EBSA : Abstracts, European Biophysics Journal, Volume 46, Supplement 1
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S179-S179 doi:10.1007/s00249-017-1222-x (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
54.Tomin, Marko; Tomić, SanjaDynamic properties of dipeptidyl peptidase III from Bacteroides thetaiotaomicron and the structural basis for its substrate specificity – a computational study // Molecular biosystems, 13 (2017), 2407-2417 doi:10.1039/c7mb00310b (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
55.Matovina, Mihaela; Agić, Dejan; Abramić, Marija; Matić, Sara; Karačić, Zrinka; Tomić, SanjaNew findings about human dipeptidyl peptidase III based on mutations found in cancer // RSC Advances, 7 (2017), 58; 36326-36334 doi:10.1039/C7RA02642K (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
56.Tomin, Marko; Tomić, SanjaComputational study of dipeptidyl peptidase III from thermophile Caldithrix abyssi // Math/Chem/Comp 2017, 29th MC2 Conference : Book of Abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy (ur.).
Dubrovnik, Hrvatska, 2017. str. 16-16 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
57.Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Špoljarević, Marija; Lisjak, Miroslav; Bešlo, Drago; Abramić, MarijaValidation of flavonoids as potential dipeptidyl peptidase III inhibitors: experimental and computational approach // Chemical biology & drug design, 89 (2017), 4; 619-627 doi:10.1111/cbdd.12887 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
58.Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Gundić, MarioInfluence of ligands and protein binding to structure and flexybility of human dipeptidyl peptidase III // Conference proceedings of ICBMB 2016, International Conference on Biochemistry and Molecular Biology
Venecija, Italija, 2016. str. 9-9 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
59.Gundić, Mario; Tomić, Antonija; Wade, Rebecca C.; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Kazazić, Saša; Tomić, SanjaHuman DPP III – Keap1 Interactions : A Combined Experimental And Computational study // Croatica chemica acta, 89 (2016), 2; 217-228 doi:10.5562/cca2916 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
60.Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, IgorBacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III complexes with synthetic substrates // ECS3 Book of Abstracts / Jasminka Popović, Aleksandar Višnjevac (ur.).
Zagreb: Croatian Association of Crystallographers, Bijenička 54, HR - 10000 Zagreb, Croatia, VAT: HR47378791658, 2016. str. 14-14 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
61.Tomić, SanjaUnderstanding substrate recognition and function of human dipeptidyl peptidase III // Regional Biophysics Conference (RBC2016). Book of Abstracts
Trst, 2016. str. 9-9 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo) -
62.Tomić, Antonija; Kovačević, Borislav; Tomić, SanjaConcerted nitrogen inversion and hydrogen bonding to Glu451 are responsible for protein-controlled suppression of the reverse reaction in the human DPP III // Physical Chemistry Chemical Physics, 18 (2016), 39; 27245-27256 doi:10.1039/C6CP04580D (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
63.Matić, Josipa; Šupljika, Filip; Tir, Nora; Piotrowski, Patryciusz; Schmuck, Carsten; Abramić, Marija; Piantanida, Ivo; Tomić, SanjaGuanidiniocarbonyl-pyrrole -aryl conjugates as inhibitors of human dipeptidyl peptidase III: combined experimental and computational study // RSC Advances, 6 (2016), 83044-83052 doi:10.1039/c6ra16966j (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
64.Crnolatac, Ivo; Rogan, Iva; Majić, Boris; Tomić, Sanja; Deligeorgiev, Todor; Horvat, Gordan; Makuc, Damjan; Plavec, Janez; Pescitelli, Gennaro; Piantanida, IvoSmall molecule probes finely differentiate between various ds- and ss-DNA and RNA by fluorescence, CD and NMR response // Analytica chimica acta, 940 (2016), 128-135 doi:10.1016/j.aca.2016.08.021 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
65.Tir, NoraSimulacije molekulske dinamike kompleksa ljudske dipeptidil-peptidaze III s inhibitorima, 2016., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
66.Tomin, Marko; Tomić, SanjaConformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // Conference proceedings, ICBMB 2016
Venecija, Italija, 2016. str. 23-23 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
67.Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, IgorConformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // Simpozij studenata doktorskih studija PMF : Knjiga sažetaka / Primožič, Ines ; Hranilović, Dubravka (ur.).
Zagreb, 2016. str. 40-40 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
68.Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Martinčić, Jelena; Jajčanin-Jozić, Nina; Grabar- Branilović, Marina; Tomić, Sanja; Ludwig- Müller, Jutta; Piantanida, Ivo; Salopek- Sondi, BrankaThe role of conserved Cys residues in Brassica rapa auxin amidohydrolase: the Cys139 is crucial for the enzyme activity and the Cys320 regulates enzyme stability // Physical Chemistry Chemical Physics, 18 (2016), 13; 8890-8900 doi:10.1039/c5cp06301a (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
69.Tomić, Sanja; Tomić, AntonijaLigand binding to the flexible metaloenzymes: protein dynamics and the active enzyme conformation // European Biophysics Journal 2015, Volume 44, Supplement 1
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. 243-243 doi:10.1007/s00249-015-1045-6 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo) -
70.Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, IgorConformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // 29th European Crystallographic Meeting, Book of Abstracts, Acta Crystallographica A, 71
Rovinj, Hrvatska, 2015. str. 209-209 doi:10.1107/S2053273315096850 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
71.Bertoša, Branimir; Kazizić, Saša; Mikleušević, Goran; Štefanić, Zoran; Narczyk, Marta; Wielgus- Kutrowska, Beata; Hajnić, Matea; Leščić Ašler, Ivana; Tomić, Sanja; Tarnowski, Krzysztof et al.Role of subunit-subunit interactions in the catalysis conducted by hexameric purine nucleoside phosphorylase // 22nd International Conference on Analytical Ultracentrifugation
Melbourne, Australija, 2015. str. 1-1 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni) -
72.Tomić, AntonijaPrimjena računalnih pristupa različitih stupnjeva složenosti u svrhu razumijevanja strukture, dinamike i aktivnosti ljudske dipeptidil-peptidaze III, 2015., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
73.Rastija, Vesna; Agić, Dejan; Tomić, Sanja; Nikolić, Sonja; Hranjec, Marijana; Karminski-Zamola, Grace; Abramić, MarijaSynthesis, QSAR, and molecular dynamics simulation of amidino-substituted benzimidazoles as dipeptidyl peptidase III inhibitors // Acta chimica Slovenica, 62 (2015), 4; 867-878 doi:10.17344/acsi.2015.1605 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
74.Grabar Branilović, Marina; Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Salopek-Sondi, Branka; Piantanida, Ivo; Tomić, SanjaThe active site structure of manganese-containing Brassica rapa auxin-amidohydrolase BrILL2 // 29th European Crystallographic Meeting, Book of Abstracts, Acta Crystallographica A, 71
Rovinj, Hrvatska, 2015. str. 210-210 doi:10.1107/S2053273315096849 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
75.Grabar Branilović, Marina; Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Salopek-Sondi, Branka; Piantanida, Ivo; Tomić, SanjaBrassica rapa auxin-amidohydrolase: the Mn2+ binding affinities and the active site structure // European Biophysics Journal, Volume 44, Issue 1 Supplement :S43–S248
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. 166-166 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
76.Tomić, Antonija; Berynskyy, Mykhaylo; Wade, Rebecca C.; Tomić, SanjaMolecular simulations reveal that the long range fluctuations of human DPP III change upon ligand binding // Molecular biosystems, 11 (2015), 3068-3080 doi:10.1039/c5mb00465a (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
77.Gershberg, Jana; Radić Stojković, Marijana; Škugor, Marko; Tomić, Sanja; Rehm, Thomas H.; Rehm, Stephanie; Saha-Möller, Chantu R.; Piantanida, Ivo; Würthner, FrankSensing of Double-Stranded DNA/RNA Secondary Structures by Water Soluble Homochiral Perylene Bisimide Dyes // Chemistry - A European Journal, 21 (2015), 21; 7886-7895 doi:10.1002/chem.201500184 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
78.González-García, Jorge; Tomić, Sanja; Lopera, Alberto; Guijarro, Lluís; Piantanida, Ivo; García-España, EnriqueAryl-bis-(scorpiand)-aza receptors differentiate between nucleotide monophosphates by combination of aromatic, hydrogen bond and electrostatic interactions // Organic & biomolecular chemistry, 13 (2015), 1732-1740 doi:10.1039/c4ob02084g (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
79.Brkić, Hrvoje; Kovačević, Borislav; Tomić, SanjaHuman 3-hydroxyanthranilate 3, 4-dioxygenase (3HAO) dynamics and reaction, a multilevel computational study // Molecular biosystems, 11 (2015), 3; 898-907 doi:10.1039/C4MB00668B (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
80.Grabar Branilović, Marina; Tomić, SanjaComputational study of the IRES subdomain IIa structural plasticity and the ligand binding affinity // Chemistry towards Biology 7th Central European Conference - Book of Abstracts / Jarzembek, Krystyna (ur.) (ur.).
Katovice, 2014. str. P10-P10 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
81.Grabar Branilović, MarinaEksperimentalno utemeljeno modeliranje interakcija nukleinskih kiselina i malih molekula, 2014., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
-
82.Grabar Branilović, Marina; Tomić, SanjaComputational study of the structural plasticity and the ligand binding affinity of the IRES subdomain IIa // Molecular biosystems, 10 (2014), 12; 3272-3279 doi:10.1039/c4mb00469h (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
83.Maršavelski, Aleksandra; Lesjak, Sonja; Močibob, Marko; Weygand-Đurašević, Ivana; Tomić, SanjaA single amino acid substitution affects the substrate specificity of the seryl-tRNA synthetase homologue // Molecular biosystems, 10 (2014), 12; 3207-3216 doi:10.1039/C4MB00416G (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
84.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaHunting the human DPP III active conformation : combined thermodynamic and QM/MM calculations // Dalton transactions, 43 (2014), 15503-15514 doi:10.1039/C4DT02003K (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
85.Brkić, HrvojeProučavanje o željezu ovisnih dioksigenaza računalnim metodama, 2014., doktorska disertacija, Prirodoslovno matematički Fakultet, Fizički odsjek, Zagreb
-
86.Bertoša, Branimir; Mikleušević, Goran; Wielgus-Kutrowska, Beata; Narczyk, Marta; Hajnić, Matea; Leščić Ašler, Ivana; Tomić, Sanja; Luić, Marija; Bzowska, AgnieszkaHomooligomerization is needed for stability: a molecular modelling and solution study of E. coli purine nucleoside phosphorylase // The FEBS journal, 281 (2014), 7; 1860-1871 doi:10.1111/febs.12746 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
87.Jajčanin Jozić, Nina; Tomić, Sanja; Abramić, MarijaImportance of the three basic residues in the vicinity of the zinc-binding motives for the activity of the yeast dipeptidyl peptidase III // Journal of biochemistry, 155 (2014), 1; 43-50 doi:10.1093/jb/mvt093 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
88.Aleksić, Maja; Bertoša, Branimir; Nhili, Raja; Depauw, Sabine; Martin-Kleiner, Irena; David-Cordonnier, Marie-Helene; Tomić, Sanja; Kralj, Marijeta; Karminski-Zamola, GraceAnilides and quinolones with nitrogen-bearing substituents from benzothiophene- and thienothiophene- series: synthesis, photochemical synthesis, cytostatic evaluation, 3D-derived QSAR analysis and DNA-binding properties // European journal of medicinal chemistry, 71 (2014), 267-281 doi:10.1016/j.ejmech.2013.11.010 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
89.Tomić, Sanja; Brkić, Hrvoje; Grabar Branilović, Marina; Tomić, Antonija; Branimir, Bertoša; Mile, ŠikićProteini i nukleinske kiseline u vremenu i prostoru // Bioinformatics and biological physics: proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 149-157 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
90.Grabar Branilović, Marina; Maršavelski, Aleksandra; Tomić, Antonija; Tomić, SanjaNobelova nagrada za kemiju za 2013. godinu // Kemija u industriji : časopis kemičara i tehnologa Hrvatske, 62 (2013), 11-12; 468-471 (podatak o recenziji nije dostupan, osvrt, stručni)
-
91.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaNajnovija saznanja o koordinaciji cinka i o vezanju liganda u aktivno mjesto humane DPP III – implikacije na mehanizam kemijske reakcije // XXIII. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera, knjiga sažetaka / Hadžiev, Andrea ; Blažeković, Zdenko (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2013. str. 177-177 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni) -
92.Tomić, Sanja; Brkić, Hrvoje; Straganz, Grit; Buongiorno, danielaNon-heme iron dependent enzymes – understanding transport of iron cation in acetylacetone dioxygenase from Acinetobacter johnsoii // European Biophys. J. Volume 42 Supplement 1, '9th European Biophysics Congress Abstracts' / Watts, A. (ur.).
Heidelberg: Springer, 2013. str. S184-S184 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
93.Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Brkić, HrvojeElucidation of metal ion-binding sites in proteins // 6th Central Europe Conference - Abstracts of scientific contributions / Roberto Rizzo (ur.).
Trst: Universita degli studi di Trieste, 2013. str. oc15-oc15 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
94.Tomić, Antonija; Tomić, SanjaMolecular Mechanics - Poisson Boltzmann Surface Area calculations using AMBER program package - application to the human dipeptidyl petidase III // Computational Electrostatics for Biological Applications - Book of Abstract
Genova, Italija, 2013. str. 39-39 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
95.Grabar Branilović, Marina; Tomić, Sanja; Tumir, Lidija-Marija; Piantanida, IvoThe bis-phenanthridinium system flexibility and position of covalently bound uracil finely tunes the interaction with polynucleotides // Molecular biosystems, 9 (2013), 8; 2051-2062 doi:10.1039/C3MB25578F (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
96.Radić Stojković, Marijana; Škugor, Marko; Tomić, Sanja; Grabar, Marina; Smrečki, Vilko; Dudek, Łukasz; Grolik, Jarosław; Eilmes, Julita; Piantanida, IvoDibenzotetraaza[14]annulene – adenine conjugate recognizes complementary poly dT among ss-DNA / ss-RNA sequences // Organic & biomolecular chemistry, 11 (2013), 24; 4077-4085 doi:10.1039/c3ob40519b (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
97.Tomić, Sanja; Abramić, Marija; Brkić, Hrvoje; Tomić, AntonijaSprega kristalografije i modeliranja u proučavanju bioloških makromolekula // Kristalografija u Hrvatskoj / Popović Stanko (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 129-137 (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo) -
98.Maršavelski, Aleksandra; Tomić, SanjaSubstrate selectivity of atypical methanogenic-type Seryl-tRNA synthetases-computational approach // The 11th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics
Primošten, Hrvatska, 2012. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo) -
99.Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Gonzalez, MiguelMolecular dynamics based studies on human DPP III revealed determinants for its broad substrate selectivity // IRENE – 'In Silico Enzyme Sesign and Screening'
Trst, Italija, 2012. (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
100.Tomić, Sanja; Grabar, Marina; Piantanida, IvoMolecular modeling of nucleic acid - small molecule interactions // Book of Abstracts Regional Biophysical Conference 2012 / Zakrzewska, Joanna, Živić, Miroslav, Andjus, Pavle (ur.).
Beograd: Društvo biofizičara Srbije, 2012. str. 13-13 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)
