Pregled po CROSBI profilu: Sanja Tomić (CROSBI Profil: 28532, MBZ: 113604)

1.

Tomić, Antonija; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja

Influence of Mutations of Conserved Arginines on Neuropeptide Binding in the DPP III Active Site // Molecules, 28 (2023), 4; 1976, 17 doi:10.3390/molecules28041976 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com fulir.irb.hr

2.

Matić, Antonia; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Tomić Sanja

Dipeptidyl peptidase iii inhibition tests by metal dications // Book of Abstracts of the Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2022. str. 105-105 (poster, sažetak, znanstveni)

congress2022.hdbmb.hr

3.

Kekez, Ivana; Matić, Sara; Tomić, Sanja; Matković-Čalogović, Dubravka

Binding of peptide mimicking the ETGE loop of dipeptidyl peptidase III to the Kelch domain of Keap1 // The twenty-eighth Croatian-Slovenian Crystallographic Meeting : Book of Abstracts
Zagreb, 2022. str. 8-8 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

cscm28.hazu.hr

4.

Matovina, Mihaela; Tomašić Paić, Ana; Barbarić, Lea; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja; Marinović, Ivana

Study of the interaction of dipeptidyl peptidase 3 and SH2 domain-containing protein 3C // Book of Abstracts of the Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Croatian Society of Biochemistry and Molecular, 2022. str. 107-107 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni)

congress2022.hdbmb.hr

5.

Karačić, Zrinka; Šupljika, Filip; Tomić, Antonija; Brkljačić, Lidija; Tomašić Paić, Ana; Ćehić, Mirsada; Tomić, Sanja

Neuropeptides, substrates and inhibitors of human dipeptidyl peptidase III, experimental and computational study — A new substrate identified // International journal of biological macromolecules, 220 (2022), 1390-1401 doi:10.1016/j.ijbiomac.2022.09.119 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com

6.

Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkljačić, Lidija; Šupljika, Filip

Neuropeptides - substrates of dipeptidyl peptidase III // From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: Hrvatsko Društvo za Biotehnologiju, 2022. str. 151-151 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

congress2022.hdbmb.hr

7.

Tomić, Antonija; Karačić, Zrinka; Šupljika, Filip; Tomić, Sanja

Computational modelling an aid to understand binding and hydrolysis of neuropeptides in the active site of human DPP III // Book of abstracts of the 1st Central and Eastern European Conference on Physical Chemistry and Materials Science (CEEC-PCMS1) / Erceg, Matko ; Rotaru, Andrei ; Vrsalović, Ladislav (ur.).
Split, Hrvatska: Central and Eastern European Committee for Thermal Analysis and Calorimetry (CEEC-TAC), 2022. str. 196-196 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

www.ceec-physchem.org

8.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Computational study of the human DPP III catalyzed peptide hydrolysis - difference between „good“ and „slow“ substrate // Math/Chem/Comp 2022 and 33rd MC2 Conference : Book of Abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy ; Namjesnik, Danijel (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2022. str. 24-24 (predavanje, sažetak, znanstveni)

mcc.hkd.hr

9.

Matić, Sara; Tomašić Paić, Ana; Sobočanec, Sandra; Pinterić, Marija; Pipalović, Goran; Martinčić, Monika; Matovina, Mihaela; Tomić, Sanja

Interdisciplinary study of the effects of dipeptidyl-peptidase III cancer mutations on the KEAP1-NRF2 signaling pathway // International journal of molecular sciences, 23 (2022), 4; 1994, 15 doi:10.3390/ijms23041994 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com www.ncbi.nlm.nih.gov fulir.irb.hr

10.

Zonjić, Iva; Tumir, Lidija-Marija; Crnolatac, Ivo; Šupljika, Filip; Racané, Livio; Tomić, Sanja; Radić Stojković, Marijana

Recognition of ATT Triplex and DNA:RNA Hybrid Structures by Benzothiazole Ligands // Biomolecules, 12 (2022), 3; 1600173, 20 doi:10.3390/biom12030374 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi www.mdpi.com doi.org fulir.irb.hr

11.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Demystifying DPP III Catalyzed Peptide Hydrolysis— Computational Study of the Complete Catalytic Cycle of Human DPP III Catalyzed Tynorphin Hydrolysis // International journal of molecular sciences, 23 (2022), 3; 1858, 24 doi:10.3390/ijms23031858 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com doi.org fulir.irb.hr

12.

Karačić, Zrinka; Šupljika, Filip; Tomašić Paić, Ana; Brkljačić, Lidija; Tomić, Sanja

Role of dipeptidyl peptidase III in pain regulation through cleavage of neuropeptides // 7th Croatian Meeting of Chemists and Chemical Engineers and 5th Symposium Vladimir Prelog : Book of Abstracts / Marković, Dean ; Meštrović, Ernest ; Namjesnik, Danijel ; Tomašić, Vesna (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2021. str. 234-234 (poster, neobjavljeni rad, znanstveni)

27hskiki.hkd.hr

13.

Zonjić, Iva; Tumir, Lidija-Marija; Šupljika, Filip; Crnolatac, Ivo; Racane, livio; Tomić, Sanja; Radić Stojković, Marijana

Recognition of DNA:RNA hybrid and triplex structures by a series of benzothiazole ligands // 5th Mini Symposium of Section of Medicinal and Pharmaceutical Chemistry
Zagreb, Hrvatska, 2021. str. 1-1 (predavanje, sažetak, znanstveni)

14.

Zonjić, Iva; Tumir, Lidija Marija; Šupljika, Filip; Crnolatac, Ivo; Racané, Livio; Tomić, Sanja; Radić Stojković Marijana

Recognition of DNA:RNA hybrid and triplex structure by a series of benzothiazole ligands // 27th Croatian Meeting of Chemists and Chemical Engineers / Marković, Dean ; Meštrović, Ernest ; Namjesnik, Danijel ; Tomašić, Vesna (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2021. str. 44-44 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

15.

Zonjić, Iva; Tumir, Lidija Marija; Šupljika, Filip; Crnolatac, Ivo; Racane, Livio; Tomić, Sanja; Radić Stojković, Marijana

Interactions of benzothiazole ligands with DNA:RNA hybrids and triplex structures // IV. SIMPOZIJ SUPRAMOLEKULSKE KEMIJE Supramolecular Chemistry 2021
Zagreb, 2021. str. 1-1 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

16.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Understanding the human DPP iii substrate specificity : QM/MM and MD calculations // Math/Chem/Comp 2021 : 32nd MC2 Conference : book of abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy ; Namjesnik, Danijel (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2021. str. 42-42 (poster, sažetak, znanstveni)

mcc.hkd.hr

17.

Agić, Dejan; Šubarić, Domagoj; Karnaš, Maja; Komar, Mario; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja; Bešlo, Drago; Rastija, Vesna; Molnar, Maja

Interactions of human dipeptidyl petidase III with coumarinyl Schiff bases // 27th Croatian Meeting of Chemists and Chemical Engineers and 5th Symposium Vladimir Prelog : Book of Abstracts / Marković, Dean ; Meštrović, Ernest ; Namjesnik, Danijel ; Tomašić, Vesna (ur.).
Zagreb: Hrvatsko kemijsko društvo, 2021. str. 157-157 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

27hskiki.hkd.hr

18.

Ban, Željka; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja; Amini, Hashem; Marder, Todd B.; Piantanida, Ivo

Triarylborane Dyes as a Novel Non‐Covalent and Non‐Inhibitive Fluorimetric Markers for DPP III Enzyme // Molecules, 26 (2021), 4816, 20 doi:10.3390/molecules26164816 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com doi.org fulir.irb.hr

19.

Trnski, Diana; Sabol, Maja; Tomić, Sanja; Štefanac, Ivan; Mrčela, Milanka; Musani, Vesna; Rinčić, Nikolina; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Levanat, Sonja; Ozretić, Petar

SHH-N non-canonically sustains androgen receptor activity in androgen-independent prostate cancer cells // Scientific reports, 11 (2021), 1; 14880, 11 doi:10.1038/s41598-021-93971-6 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi www.nature.com doi.org fulir.irb.hr

20.

Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Matić, Antonia; Tomić, Sanja

Unravelling the inhibitory zinc ion binding site and the metal exchange mechanism in human DPP III // PCCP. Physical chemistry chemical physics, 23 (2021), 13267-13275 doi:10.1039/D1CP01302E (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org doi.org

21.

Agić, Dejan; Karnaš, Maja; Šubarić, Domagoj; Lončarić, Melita; Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Bešlo, Drago; Rastija, Vesna; Molnar, Maja; Popović, Boris M.; Lisjak, Miroslav

Coumarin derivatives act as novel inhibitors of human dipeptidyl peptidase III: combined in vitro and in silico study // Pharmaceuticals, 14 (2021), 6; 540, 19 doi:10.3390/ph14060540 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com fulir.irb.hr

22.

Lončar, Borka; Perin, Nataša; Mioč, Marija; Boček, Ida; Grgić, Lea; Kralj, Marijeta; Tomić, Sanja; Radić Stojković, Marijana; Hranjec, Marijana

Novel amino substituted tetracyclic imidazo[4,5-b]pyridine derivatives: Design, synthesis, antiproliferative activity and DNA/RNA binding study // European journal of medicinal chemistry, 217 (2021), 113342, 18 doi:10.1016/j.ejmech.2021.113342 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi www.sciencedirect.com dx.doi.org

23.

Ferger, Matthias; Ban, Željka; Krošl, Ivona; Tomić, Sanja; Dietrich, Lena; Lorenzen, Sabine; Rauch, Florian; Sieh, Daniel; Friedrich, Alexandra; Griesbeck, Stefaine et al.

Aryl-diyne linkers in bis-triarylborane cations control fluorimetric and Raman sensing of various DNA and RNA // Chemistry : a European journal, 27 (2021), 5142-5159 doi:10.1002/chem.202005141 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com doi.org fulir.irb.hr

24.

Matić, Sara; Kekez, Ivana; Tomin, Marko; Bogár, Ferenc; Šupljika, Filip; Kazazić, Saša; Hanić, Maja; Jha, Shalinee; Brkić, Hrvoje; Bourgeois, Benjamin et al.

Binding of dipeptidyl peptidase III to the oxidative stress cell sensor Kelch-like ECH-associated protein 1 is a two-step process // Journal of biomolecular structure & dynamics, 39 (2021), 18; 6870-6881 doi:10.1080/07391102.2020.1804455 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.tandfonline.com

25.

Matić, Antonia; Karačić, Zrinka; Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja

Ispitivanja inhibicije dipeptidil peptidaze III metalnim dikationima // Knjiga sažetaka - 18. Ružičkini dani: Danas znanost - Sutra industrija / Jukić, Ante (ur.).
Zagreb : Osijek: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI) Prehrambeno-tehnološki fakultet Osijek Sveučilišta J. J. Strosssmayera u Osijeku, 2020. str. 78-78 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

www.hdki.hr

26.

Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Brkljačić, Lidija; Tomašić Paić, Ana; Ćehić, Mirsada; Matovina, Mihaela

Uloga dipeptidil peptidaze III u regulaciji boli // Knjiga sažetaka - 18. Ružičkini dani: Danas znanost - Sutra industrija / Jukić, Ante (ur.).
Zagreb : Osijek: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI) Prehrambeno-tehnološki fakultet Osijek Sveučilišta J. J. Strosssmayera u Osijeku, 2020. str. 134-134 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

www.hdki.hr

27.

Hanić, Maja

Interdisciplinarno istraživanje mutanata R620C, R623W i R623L ljudske dipeptidil-peptidaze III, 2020., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

zir.nsk.hr

28.

Agić, Dejan; Karnaš, Maja; Šubarić, Domagoj; Komar, Mario; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja; Molnar, Maja

Inaktivacija ljudske dipeptidil peptidaze III derivatima kinazolinona // Book of abstracts - 18th Ružička days / Jukić, Ante (ur.).
Zagreb : Osijek: Croatian Society of Chemical Engineers (CSCE) ; Faculty of Food Technology Osijek, 2020. str. 124-124 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

www.hdki.hr

29.

Ban, Željka; Griesbeck, Stefanie; Tomić, Sanja; Nitsch, Jörn; Marder, Todd; Piantanida, Ivo

A quadrupolar bis‐triarylborane chromophore as a fluorimetric and chirooptic probe for simultaneous and selective sensing of DNA, RNA and proteins // Chemistry : a European journal, 26 (2020), 2195-2203 doi:10.1002/chem.201903936 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi onlinelibrary.wiley.com doi.org fulir.irb.hr

30.

Ćehić, Mirsada; Suć Sajko, Josipa; Karačić, Zrinka; Piotrowski, Patryciusz; Šmidlehner, Tamara; Jerić, Ivanka; Schmuck, Carsten; Piantanida, Ivo; Tomić, Sanja

The guanidiniocarbonylpyrrole - fluorophore conjugates as theragnostic tools for DPP III monitoring and inhibition // Journal of biomolecular structure & dynamics, 38 (2020), 13; 3790-3800 doi:10.1080/07391102.2019.1664936 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.tandfonline.com doi.org

31.

Tomić, Antonija; Horvat, Gordan; Ramek, Michael; Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja

Development of new zinc ion parameters suitable for classical MD simulations of zinc metallo-peptidases // Computational Chemistry Day 2019 :Book of abstracts
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2019. str. 3-3 (predavanje, sažetak, znanstveni)

ccd19.pharma.hr

32.

Ćehić, Mirsada

Eksperimentalno i računalno istraživanje novih konjugata gvanidina s različitim fluoroforima kao liganada humane dipeptidil-peptidaze III, 2019., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

dr.nsk.hr

33.

Tomić, Antonija; Horvat, Gordan; Ramek, Michael; Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja

New zinc ion parameters suitable for classical MD simulations of zinc metallo-peptidases // Journal of chemical information and modeling, 59 (2019), 8; 3437-3453 doi:10.1021/acs.jcim.9b00235 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.acs.org doi.org

34.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Human DPP III - Keap1 interactions // Computational Chemistry Day 2019 Book of Abstracts
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2019. str. 24-24 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

ccd19.pharma.hr

35.

Bistrović, Andrea; Stolić, Ivana; Krstulović, Luka; Taylor, C. Martin; Kelly, M. John; Tomić, Sanja; Bajić, Miroslav; Raić-Malić, Silvana

Novel symmetric bis-benzimidazoles: synthesis, DNA/RNA binding and antitrypanosomal activity // Knjiga sažetaka / Galić, Nives ; Rogošić, Marko (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2019. str. 145-145 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada

36.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Human DPP III - Keap1 interactions // The 3rd COST-sponsored ARBRE-MOBIEU plenary meeting Book of Abstracts / Ivošević DeNardis, Nadica ; Campos-Olivas, Ramon ; Miele, Adriana E. ; England, Patrick ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Ruđer Bošković Institute and Croatian Biophysical Society, 2019. str. 134-135 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

arbre-mobieu.eu

37.

Bistrović Popov, Andrea; Stolić, Ivana; Krstulović, Luka; Taylor, Martin C.; Kelly, John M.; Tomić, Sanja; Tumir, Lidija-Marija; Bajić, Miroslav; Raić-Malić, Silvana

Novel symmetric bis-benzimidazoles: Synthesis, DNA/RNA binding and antitrypanosomal activity // European journal of medicinal chemistry, 173 (2019), 63-75 doi:10.1016/j.ejmech.2019.04.007 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com doi.org

38.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Oxidase or peptidase? A computational insight into a putative aflatoxin oxidase from Armillariella tabescens // Proteins, 87 (2019), 5; 390-400 doi:10.1002/prot.25661 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi onlinelibrary.wiley.com

39.

Čavka, Ivana

Računalne simulacije kompleksa ljudske dipeptidil-peptidaze III s angiotenzinom-(1-7) i njegovim stabilnim analogom, 2018., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

urn.nsk.hr

40.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Dipeptidyl peptidase III from a mesophilic and thermophilic bacterium – similarities and differences // The 14th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics, ABC of Physics of Life: Book of abstracts / Delač Marion, Ida ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković ; Hrvatsko biofizičko društvo, 2018. str. 122-122 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

41.

Tomin, Marko; Tomić, Antonija; Kovačević, Borislav; Tomić, Sanja

The Mechanism of Peptide Hydrolysis Catalysed by Dipeptidyl Peptidase III from Bacteroides thetaiotaomicron // Croatica chemica acta, 91 (2018), 2; 187-193 doi:10.5562/cca3343 (recenziran, članak, znanstveni)

doi hrcak.srce.hr fulir.irb.hr

42.

Tomić, Antonija; Ramek, Michael; Tomić, Sanja

Development of new parameters for the Zn2+ ion for the specific environment of the DPP III enzyme catalytic site // Computational Chemistry Day Book of abstracts
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2018. str. 15-15 (poster, sažetak, znanstveni)

43.

Kazazić, Saša; Karačić, Zrinka; Sabljić, Igor; Agić, Dejan; Tomin, Marko; Abramić, Marija; Dadlez, Michal; Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Conservation of the conformational dynamics and ligand binding within M49 enzyme family // RSC Advances, 8 (2018), 24; 13310-13322 doi:10.1039/c7ra13059g (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org pubs.rsc.org fulir.irb.hr

44.

Šmidlehner, Tamara; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja; Schmuck, Carsten; Piantanida, Ivo

Fluorescent cyanine-guanidiniocarbonyl-pyrrole conjugate with pH-dependent DNA/RNA recognition and DPP III fluorescent labelling and inhibition properties // Monatshefte für Chemie, 149 (2018), 7; 1307-1313 doi:10.1007/s00706-018-2192-0 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi link.springer.com

45.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Mehanizam hidrolize peptidne veze na modelnom sustavu DPP III iz Bacteroides thetaiotaomicron // Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : knjiga sažetaka / Primožič, Ines (ur.).
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Zagrebu, 2018. str. 36-36 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

www.pmf.unizg.hr

46.

Sabljić, Igor; Tomin, Marko; Matovina, Mihaela; Sučec, Iva; Tomašić Paić, Ana; Tomić, Antonija; Abramić, Marija; Tomić, Sanja

The first dipeptidyl peptidase III from a thermophile: Structural basis for thermal stability and reduced activity // PLoS One, 13 (2018), 2; e0192488, 25 doi:10.1371/journal.pone.0192488 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi fulir.irb.hr fulir.irb.hr journals.plos.org doi.org

47.

Ćehić, Mirsada; Suć, Josipa; Jerić, Ivanka; Piantanida, Ivo; Tomić, Sanja; Schmuck, Carsten

Experimental study of new guanidiniocarbonyl-pyrrole-aryl conjugates as potential inhibitors of human dipeptidyl peptidase III // 4th Young Medicinal Chemist Symposium (EFMC-YMCS 2017) : Book of Abstracts
Beč: EFMC-YMCS, 2017. str. 141-141 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni)

www.ldorganisation.com

48.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, Igor

Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III complexes with synthetic substrates // Thrid DPP III Minisymposium
Graz, Austrija, 2017. (poster, neobjavljeni rad, znanstveni)

www.irb.hr

49.

Hromić-Jahjefendić, Altijana; Jajčanin Jozić, Nina; Kazazić, Saša; Grabar Branilović, Marina; Karačić, Zrinka; Schrittwieser, Jörg H.; Das, Krishna Mohan Padmanabha; Tomin, Marko; Oberer, Monika; Gruber, Karl et al.

A novel Porphyromonas gingivalis enzyme: An atypical dipeptidyl peptidase III with an ARM repeat domain // PLoS One, 12 (2017), 11; e0188915, 27 doi:10.1371/journal.pone.0188915 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi fulir.irb.hr journals.plos.org

50.

Matić, Sara; Matovina, Mihaela; Tomić, Sanja

Exploring the effect of mutations on interactions between Keap1 and DPP III by MD simulations // Integrating genomics and biophysics to comprehend functional genetic variation
Torino, Italija, 2017. str. 36-36 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni)

www.iucr.org journals.iucr.org

51.

Matić, Sara; Karačić, Zrinka; Gruber, Karl; Tomić, Sanja

Combination of SAXS and molecular modeling in structure-function characterization of the plant DPP III orthologue // 7th Visegrad Symposium on Structural Systems Biology : Program & Abstracts
Nové Hrady, 2017. str. P6-P6 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni)

nh.cas.cz

52.

Tomić, Sanja; Kovačević, Borislav; Tomić, Antonija; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Matić, Sara; Abramić, Marija; Agić, Dejan

Understanding h.DPP III mechanism – an aid in rationalization of the mutants (in)activity // 19th IUPAB and 11th EBSA : Abstracts, European Biophysics Journal, Volume 46, Supplement 1
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S179-S179 doi:10.1007/s00249-017-1222-x (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

doi link.springer.com link.springer.com

53.

Tomić, Sanja; Kazazić, Saša; Abramić, Marija; Tomin, Marko; Agić, Dejan; Karačić, Zrinka; Grabar-Branilović, Marina

H/D exchange and MD simulation study of dipeptidyl peptidase III intrinsic dynamics and ligand binding // 19th IUPAB and 11th EBSA : Abstracts, European Biophysics Journal, Volume 46, Supplement 1
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S179-S179 doi:10.1007/s00249-017-1222-x (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

doi link.springer.com link.springer.com

54.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Dynamic properties of dipeptidyl peptidase III from Bacteroides thetaiotaomicron and the structural basis for its substrate specificity – a computational study // Molecular biosystems, 13 (2017), 2407-2417 doi:10.1039/c7mb00310b (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

55.

Matovina, Mihaela; Agić, Dejan; Abramić, Marija; Matić, Sara; Karačić, Zrinka; Tomić, Sanja

New findings about human dipeptidyl peptidase III based on mutations found in cancer // RSC Advances, 7 (2017), 58; 36326-36334 doi:10.1039/C7RA02642K (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org doi.org fulir.irb.hr

56.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Computational study of dipeptidyl peptidase III from thermophile Caldithrix abyssi // Math/Chem/Comp 2017, 29th MC2 Conference : Book of Abstracts / Vančik, Hrvoj ; Cioslowski, Jerzy (ur.).
Dubrovnik, Hrvatska, 2017. str. 16-16 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

www.pmf.unizg.hr

57.

Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Špoljarević, Marija; Lisjak, Miroslav; Bešlo, Drago; Abramić, Marija

Validation of flavonoids as potential dipeptidyl peptidase III inhibitors: experimental and computational approach // Chemical biology & drug design, 89 (2017), 4; 619-627 doi:10.1111/cbdd.12887 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi onlinelibrary.wiley.com doi.org

58.

Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Gundić, Mario

Influence of ligands and protein binding to structure and flexybility of human dipeptidyl peptidase III // Conference proceedings of ICBMB 2016, International Conference on Biochemistry and Molecular Biology
Venecija, Italija, 2016. str. 9-9 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

biochem.conference-site.com

59.

Gundić, Mario; Tomić, Antonija; Wade, Rebecca C.; Matovina, Mihaela; Karačić, Zrinka; Kazazić, Saša; Tomić, Sanja

Human DPP III – Keap1 Interactions : A Combined Experimental And Computational study // Croatica chemica acta, 89 (2016), 2; 217-228 doi:10.5562/cca2916 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi

60.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, Igor

Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III complexes with synthetic substrates // ECS3 Book of Abstracts / Jasminka Popović, Aleksandar Višnjevac (ur.).
Zagreb: Croatian Association of Crystallographers, Bijenička 54, HR - 10000 Zagreb, Croatia, VAT: HR47378791658, 2016. str. 14-14 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

ecs3.ecanews.org

61.

Tomić, Sanja

Understanding substrate recognition and function of human dipeptidyl peptidase III // Regional Biophysics Conference (RBC2016). Book of Abstracts
Trst, 2016. str. 9-9 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)

62.

Tomić, Antonija; Kovačević, Borislav; Tomić, Sanja

Concerted nitrogen inversion and hydrogen bonding to Glu451 are responsible for protein-controlled suppression of the reverse reaction in the human DPP III // Physical Chemistry Chemical Physics, 18 (2016), 39; 27245-27256 doi:10.1039/C6CP04580D (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

63.

Matić, Josipa; Šupljika, Filip; Tir, Nora; Piotrowski, Patryciusz; Schmuck, Carsten; Abramić, Marija; Piantanida, Ivo; Tomić, Sanja

Guanidiniocarbonyl-pyrrole -aryl conjugates as inhibitors of human dipeptidyl peptidase III: combined experimental and computational study // RSC Advances, 6 (2016), 83044-83052 doi:10.1039/c6ra16966j (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org pubs.rsc.org

64.

Crnolatac, Ivo; Rogan, Iva; Majić, Boris; Tomić, Sanja; Deligeorgiev, Todor; Horvat, Gordan; Makuc, Damjan; Plavec, Janez; Pescitelli, Gennaro; Piantanida, Ivo

Small molecule probes finely differentiate between various ds- and ss-DNA and RNA by fluorescence, CD and NMR response // Analytica chimica acta, 940 (2016), 128-135 doi:10.1016/j.aca.2016.08.021 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.journals.elsevier.com

65.

Tir, Nora

Simulacije molekulske dinamike kompleksa ljudske dipeptidil-peptidaze III s inhibitorima, 2016., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

repozitorij.pmf.unizg.hr

66.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja

Conformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // Conference proceedings, ICBMB 2016
Venecija, Italija, 2016. str. 23-23 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

biochem.conference-site.com

67.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, Igor

Conformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // Simpozij studenata doktorskih studija PMF : Knjiga sažetaka / Primožič, Ines ; Hranilović, Dubravka (ur.).
Zagreb, 2016. str. 40-40 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

drive.google.com

68.

Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Martinčić, Jelena; Jajčanin-Jozić, Nina; Grabar- Branilović, Marina; Tomić, Sanja; Ludwig- Müller, Jutta; Piantanida, Ivo; Salopek- Sondi, Branka

The role of conserved Cys residues in Brassica rapa auxin amidohydrolase: the Cys139 is crucial for the enzyme activity and the Cys320 regulates enzyme stability // Physical Chemistry Chemical Physics, 18 (2016), 13; 8890-8900 doi:10.1039/c5cp06301a (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

69.

Tomić, Sanja; Tomić, Antonija

Ligand binding to the flexible metaloenzymes: protein dynamics and the active enzyme conformation // European Biophysics Journal 2015, Volume 44, Supplement 1
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. 243-243 doi:10.1007/s00249-015-1045-6 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)

doi link.springer.com

70.

Tomin, Marko; Tomić, Sanja; Sabljić, Igor

Conformational study of Bacteroides thetaiotaomicron dipeptidyl peptidase III // 29th European Crystallographic Meeting, Book of Abstracts, Acta Crystallographica A, 71
Rovinj, Hrvatska, 2015. str. 209-209 doi:10.1107/S2053273315096850 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

doi ecm29.ecanews.org

71.

Bertoša, Branimir; Kazizić, Saša; Mikleušević, Goran; Štefanić, Zoran; Narczyk, Marta; Wielgus- Kutrowska, Beata; Hajnić, Matea; Leščić Ašler, Ivana; Tomić, Sanja; Tarnowski, Krzysztof et al.

Role of subunit-subunit interactions in the catalysis conducted by hexameric purine nucleoside phosphorylase // 22nd International Conference on Analytical Ultracentrifugation
Melbourne, Australija, 2015. str. 1-1 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

72.

Tomić, Antonija

Primjena računalnih pristupa različitih stupnjeva složenosti u svrhu razumijevanja strukture, dinamike i aktivnosti ljudske dipeptidil-peptidaze III, 2015., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

repozitorij.pmf.unizg.hr

73.

Rastija, Vesna; Agić, Dejan; Tomić, Sanja; Nikolić, Sonja; Hranjec, Marijana; Karminski-Zamola, Grace; Abramić, Marija

Synthesis, QSAR, and molecular dynamics simulation of amidino-substituted benzimidazoles as dipeptidyl peptidase III inhibitors // Acta chimica Slovenica, 62 (2015), 4; 867-878 doi:10.17344/acsi.2015.1605 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi fulir.irb.hr fulir.irb.hr journals.matheo.si dx.doi.org

74.

Grabar Branilović, Marina; Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Salopek-Sondi, Branka; Piantanida, Ivo; Tomić, Sanja

The active site structure of manganese-containing Brassica rapa auxin-amidohydrolase BrILL2 // 29th European Crystallographic Meeting, Book of Abstracts, Acta Crystallographica A, 71
Rovinj, Hrvatska, 2015. str. 210-210 doi:10.1107/S2053273315096849 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

doi

75.

Grabar Branilović, Marina; Smolko, Ana; Šupljika, Filip; Salopek-Sondi, Branka; Piantanida, Ivo; Tomić, Sanja

Brassica rapa auxin-amidohydrolase: the Mn2+ binding affinities and the active site structure // European Biophysics Journal, Volume 44, Issue 1 Supplement :S43–S248
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. 166-166 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

76.

Tomić, Antonija; Berynskyy, Mykhaylo; Wade, Rebecca C.; Tomić, Sanja

Molecular simulations reveal that the long range fluctuations of human DPP III change upon ligand binding // Molecular biosystems, 11 (2015), 3068-3080 doi:10.1039/c5mb00465a (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

77.

Gershberg, Jana; Radić Stojković, Marijana; Škugor, Marko; Tomić, Sanja; Rehm, Thomas H.; Rehm, Stephanie; Saha-Möller, Chantu R.; Piantanida, Ivo; Würthner, Frank

Sensing of Double-Stranded DNA/RNA Secondary Structures by Water Soluble Homochiral Perylene Bisimide Dyes // Chemistry - A European Journal, 21 (2015), 21; 7886-7895 doi:10.1002/chem.201500184 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi onlinelibrary.wiley.com

78.

González-García, Jorge; Tomić, Sanja; Lopera, Alberto; Guijarro, Lluís; Piantanida, Ivo; García-España, Enrique

Aryl-bis-(scorpiand)-aza receptors differentiate between nucleotide monophosphates by combination of aromatic, hydrogen bond and electrostatic interactions // Organic & biomolecular chemistry, 13 (2015), 1732-1740 doi:10.1039/c4ob02084g (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org pubs.rsc.org

79.

Brkić, Hrvoje; Kovačević, Borislav; Tomić, Sanja

Human 3-hydroxyanthranilate 3, 4-dioxygenase (3HAO) dynamics and reaction, a multilevel computational study // Molecular biosystems, 11 (2015), 3; 898-907 doi:10.1039/C4MB00668B (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org pubs.rsc.org

80.

Grabar Branilović, Marina; Tomić, Sanja

Computational study of the IRES subdomain IIa structural plasticity and the ligand binding affinity // Chemistry towards Biology 7th Central European Conference - Book of Abstracts / Jarzembek, Krystyna (ur.) (ur.).
Katovice, 2014. str. P10-P10 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

81.

Grabar Branilović, Marina

Eksperimentalno utemeljeno modeliranje interakcija nukleinskih kiselina i malih molekula, 2014., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

82.

Grabar Branilović, Marina; Tomić, Sanja

Computational study of the structural plasticity and the ligand binding affinity of the IRES subdomain IIa // Molecular biosystems, 10 (2014), 12; 3272-3279 doi:10.1039/c4mb00469h (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

83.

Maršavelski, Aleksandra; Lesjak, Sonja; Močibob, Marko; Weygand-Đurašević, Ivana; Tomić, Sanja

A single amino acid substitution affects the substrate specificity of the seryl-tRNA synthetase homologue // Molecular biosystems, 10 (2014), 12; 3207-3216 doi:10.1039/C4MB00416G (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

84.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Hunting the human DPP III active conformation : combined thermodynamic and QM/MM calculations // Dalton transactions, 43 (2014), 15503-15514 doi:10.1039/C4DT02003K (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

85.

Brkić, Hrvoje

Proučavanje o željezu ovisnih dioksigenaza računalnim metodama, 2014., doktorska disertacija, Prirodoslovno matematički Fakultet, Fizički odsjek, Zagreb

86.

Bertoša, Branimir; Mikleušević, Goran; Wielgus-Kutrowska, Beata; Narczyk, Marta; Hajnić, Matea; Leščić Ašler, Ivana; Tomić, Sanja; Luić, Marija; Bzowska, Agnieszka

Homooligomerization is needed for stability: a molecular modelling and solution study of E. coli purine nucleoside phosphorylase // The FEBS journal, 281 (2014), 7; 1860-1871 doi:10.1111/febs.12746 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi

87.

Jajčanin Jozić, Nina; Tomić, Sanja; Abramić, Marija

Importance of the three basic residues in the vicinity of the zinc-binding motives for the activity of the yeast dipeptidyl peptidase III // Journal of biochemistry, 155 (2014), 1; 43-50 doi:10.1093/jb/mvt093 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi jb.oxfordjournals.org jb.oxfordjournals.org

88.

Aleksić, Maja; Bertoša, Branimir; Nhili, Raja; Depauw, Sabine; Martin-Kleiner, Irena; David-Cordonnier, Marie-Helene; Tomić, Sanja; Kralj, Marijeta; Karminski-Zamola, Grace

Anilides and quinolones with nitrogen-bearing substituents from benzothiophene- and thienothiophene- series: synthesis, photochemical synthesis, cytostatic evaluation, 3D-derived QSAR analysis and DNA-binding properties // European journal of medicinal chemistry, 71 (2014), 267-281 doi:10.1016/j.ejmech.2013.11.010 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com ac.els-cdn.com

89.

Tomić, Sanja; Brkić, Hrvoje; Grabar Branilović, Marina; Tomić, Antonija; Branimir, Bertoša; Mile, Šikić

Proteini i nukleinske kiseline u vremenu i prostoru // Bioinformatics and biological physics: proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 149-157 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada

90.

Grabar Branilović, Marina; Maršavelski, Aleksandra; Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Nobelova nagrada za kemiju za 2013. godinu // Kemija u industriji : časopis kemičara i tehnologa Hrvatske, 62 (2013), 11-12; 468-471 (podatak o recenziji nije dostupan, osvrt, stručni)

fulir.irb.hr

91.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Najnovija saznanja o koordinaciji cinka i o vezanju liganda u aktivno mjesto humane DPP III – implikacije na mehanizam kemijske reakcije // XXIII. hrvatski skup kemičara i kemijskih inženjera, knjiga sažetaka / Hadžiev, Andrea ; Blažeković, Zdenko (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2013. str. 177-177 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

92.

Tomić, Sanja; Brkić, Hrvoje; Straganz, Grit; Buongiorno, daniela

Non-heme iron dependent enzymes – understanding transport of iron cation in acetylacetone dioxygenase from Acinetobacter johnsoii // European Biophys. J. Volume 42 Supplement 1, '9th European Biophysics Congress Abstracts' / Watts, A. (ur.).
Heidelberg: Springer, 2013. str. S184-S184 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

93.

Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Brkić, Hrvoje

Elucidation of metal ion-binding sites in proteins // 6th Central Europe Conference - Abstracts of scientific contributions / Roberto Rizzo (ur.).
Trst: Universita degli studi di Trieste, 2013. str. oc15-oc15 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

94.

Tomić, Antonija; Tomić, Sanja

Molecular Mechanics - Poisson Boltzmann Surface Area calculations using AMBER program package - application to the human dipeptidyl petidase III // Computational Electrostatics for Biological Applications - Book of Abstract
Genova, Italija, 2013. str. 39-39 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

95.

Grabar Branilović, Marina; Tomić, Sanja; Tumir, Lidija-Marija; Piantanida, Ivo

The bis-phenanthridinium system flexibility and position of covalently bound uracil finely tunes the interaction with polynucleotides // Molecular biosystems, 9 (2013), 8; 2051-2062 doi:10.1039/C3MB25578F (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

96.

Radić Stojković, Marijana; Škugor, Marko; Tomić, Sanja; Grabar, Marina; Smrečki, Vilko; Dudek, Łukasz; Grolik, Jarosław; Eilmes, Julita; Piantanida, Ivo

Dibenzotetraaza[14]annulene – adenine conjugate recognizes complementary poly dT among ss-DNA / ss-RNA sequences // Organic & biomolecular chemistry, 11 (2013), 24; 4077-4085 doi:10.1039/c3ob40519b (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.rsc.org

97.

Tomić, Sanja; Abramić, Marija; Brkić, Hrvoje; Tomić, Antonija

Sprega kristalografije i modeliranja u proučavanju bioloških makromolekula // Kristalografija u Hrvatskoj / Popović Stanko (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 129-137 (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo)

98.

Maršavelski, Aleksandra; Tomić, Sanja

Substrate selectivity of atypical methanogenic-type Seryl-tRNA synthetases-computational approach // The 11th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics
Primošten, Hrvatska, 2012. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)

99.

Tomić, Sanja; Tomić, Antonija; Gonzalez, Miguel

Molecular dynamics based studies on human DPP III revealed determinants for its broad substrate selectivity // IRENE – 'In Silico Enzyme Sesign and Screening'
Trst, Italija, 2012. (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

100.

Tomić, Sanja; Grabar, Marina; Piantanida, Ivo

Molecular modeling of nucleic acid - small molecule interactions // Book of Abstracts Regional Biophysical Conference 2012 / Zakrzewska, Joanna, Živić, Miroslav, Andjus, Pavle (ur.).
Beograd: Društvo biofizičara Srbije, 2012. str. 13-13 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)