Pregled po CROSBI profilu: Mile Šikić (CROSBI Profil: 27663, MBZ: 250972)
Pronađeno 213 radova
Prikaz po CROSBI kategorijama
-
1.Prediction of interacting protein residues using sequence and structure data. // Computational Drug Discovery and Design / Riccardo Baron (ur.).
New York (NY) : Dordrecht : Heidelberg : London: Springer, 2012. str. 233-251 -
1.Informatika - materijali za predavanja na Vojnom studijskom programu / Džapo, Hrvoje ; Podobnik, Vedran ; Pribanić, Tomislav ; Seder, Marija ; Šikić, Mile (ur.).
Zagreb: Fakultet elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu, 2017 -
1.Facilitating genome structural variation analysis // Nature methods, 20 (2023), 491-492 doi:10.1038/s41592-023-01767-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.Direct identification of A-to-I editing sites with nanopore native RNA sequencing // Nature methods, 19 (2022), 833-844 doi:10.1038/s41592-022-01513-3 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
3.Genome assembly and chemogenomic profiling of National Flower of Singapore Papilionanthe Miss Joaquim ‘Agnes’ reveals metabolic pathways regulating floral traits // Communications biology, 5 (2022), 967, 9 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.Time- and memory-efficient genome assembly with Raven // Nature Computational Science, 1 (2021), 332-336 doi:10.1038/s43588-021-00073-4 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
5.Disentangling Sources of Influence in Online Social Networks // IEEE access, 7 (2019), 131692-131704 doi:10.1109/access.2019.2940762 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
6.Hybrid metagenomic assembly enables high- resolution analysis of resistance determinants and mobile elements in human microbiomes // Nature biotechnology, 37 (2019), 8; 937-944 doi:10.1038/s41587-019-0191-2 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
7.Horizontal silicon nanowires for surface-enhanced Raman spectroscopy // Materials research express, 5 (2018), 1; 015015, 8 doi:10.1088/2053-1591/aaa152 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
8.Evaluation of tools for long read RNA-seq splice- aware alignment // Bioinformatics, btx668 (2017), btx668, 7 doi:10.1093/bioinformatics/btx668 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
9.Silicon Nanowires Substrates Fabrication for Ultra-Sensitive Surface Enhanced Raman Spectroscopy Sensors // Croatica chemica acta, 90 (2017), 2; 259-262 doi:10.5562/cca3127 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
10.Fast and accurate de novo genome assembly from long uncorrected reads // Genome research, 27 (2017), 737-746 doi:10.1101/gr.214270.116 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
11.Edlib: a C/C ++ library for fast, exact sequence alignment using edit distance // Bioinformatics, 33 (2017), 9; 1394-1395 doi:10.1093/bioinformatics/btw753 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
12.SWORD—a highly efficient protein database search // Bioinformatics, 32 (2016), 17; 680-684 doi:10.1093/bioinformatics/btw445 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
13.Evaluation of hybrid and non-hybrid methods for de novo assembly of nanopore reads // Bioinformatics, 32 (2016), 17; 2582-2589 doi:10.1093/bioinformatics/btw237 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
14.Fast and sensitive mapping of nanopore sequencing reads with GraphMap // Nature Communications, 7 (2016), 11307-1 doi:10.1038/ncomms11307 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
15.SIFT missense predictions for genomes // Nature Protocols, 11 (2016), 1-9 doi:10.1038/nprot.2015.123 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
16.SW#db: GPU-Accelerated Exact Sequence Similarity Database Search // PLoS One, 10 (2015), 12. doi:10.1371/journal.pone.0145857 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
17.Identification of Patient Zero in Static and Temporal Networks : Robustness and Limitations // Physical Review Letters, 114 (2015), 248701-1 doi:10.1103/PhysRevLett.114.248701 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
18.ExoLocator—an online view into genetic makeup of vertebrate proteins // Nucleic acids research, 42 (2014), D1; 879-881 doi:10.1093/nar/gkt1164 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
19.Epidemic centrality — is there an underestimated epidemic impact of network peripheral nodes? // European physical journal B : condensed matter physics, 86 (2013), 10; 440, 13 doi:10.1140/epjb/e2013-31025-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
20.SW#–GPU-enabled exact alignments on genome scale // Bioinformatics, 29 (2013), 19; 2494-2495 doi:10.1093/bioinformatics/btt410 (međunarodna recenzija, kratko priopcenje, znanstveni)
-
21.FastSIR algorithm : A fast algorithm for the simulation of the epidemic spread in large networks by using the susceptible–infected–recovered compartment model // Information sciences, 239 (2013), 226-240 doi:10.1016/j.ins.2013.03.036 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
22.Large-Scale Functional Organization of Long-Range Chromatin Interaction Networks // Cell Reports, 2 (2012), 5; P1207-1219 doi:10.1016/j.celrep.2012.09.022 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
23.BioMe : biologically relevant metals // Nucleic acids research, 40 (2012), W352-W357 doi:10.1093/nar/gks514 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
24.Phase diagram of epidemic spreading — unimodal vs. bimodal probability distributions // Physica. A, Statistical mechanics and its applications, 390 (2011), 1; 65-76 doi:10.1016/j.physa.2010.06.024 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
25.Prediction of Protein-Protein Interaction Sites in Sequences and 3D Structures by Random Forests // Plos computational biology, 5 (2009), 1; e1000278-1 doi:10.1371/journal.pcbi.1000278 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
26.PSAIA - Protein Structure and Interaction Analyzer // BMC structural biology, 8 (2008), 21, 11 doi:10.1186/1472-6807-8-21 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
27.Metals in proteins: correlation between the metal- ion type, coordination number and the amino-acid residues involved in the coordination // Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography, 64 (2008), 3; 257-263 doi:10.1107/S090744490706595X (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
1.Efficacy of next-generation sequencing in bacterial zoonoses diagnostics // Veterinarska stanica, 53 (2021), 1; 1-10 doi:10.46419/vs.53.1.9 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, ostalo)
-
1.Approaches to metagenomic classification and assembly // Biomedical Engineering
Opatija, Hrvatska: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2019. str. 367-375 doi:10.23919/mipro.2019.8756644 (predavanje, recenziran, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
2.Modeling Peer and External Influence in Online Social Networks: Case of 2013 Referendum in Croatia // Complex Networks and Their Applications VI: Proceedings of Complex Networks 2017 (The Sixth International Conference on Complex Networks and Their Applications) / Cherifi, Chantal ; Cherifi, Hocine ; Karsai, Marton ; Musolesi, Mirco (ur.).
Lyon, Francuska: Springer, 2017. str. 1015-1027 doi:10.1007/978-3-319-72150-7_82 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
3.Unsupervised Learning of Sequencing Read Types // Proceedings of the 2017 International Conference on Computational Biology and Bioinformatics
Newark (DE), Sjedinjene Američke Države, 2017. str. 12-17 doi:10.1145/3155077.3155080 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
4.Trade-offs in query and target indexing for the selection of candidates in protein homology searches // Proceedings of The Prague Stringology Conference 2017 / Jan Holub and Jan Ždarek (ur.).
Prag: Czech technical university in Prague, 2017. str. 118-125 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
5.SWORD—a highly efficient protein database search // ECCB 2016: THE 15TH EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY
Den Haag, Nizozemska, 2016. str. 680-684 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
6.TGTP-DB – a database for extracting genome, transcriptome and proteome data using taxonomy // Proceedings of the 39th International Convention Mipro 2016, Distributed Computing, Visualization and Biomedical Engineering /DC VIS / Biljanović, Petar (ur.).
Rijeka: Hrvatska udruga za informacijsku i komunikacijsku tehnologiju, elektroniku i mikroelektroniku - MIPRO, 2016. str. 472-476 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
7.Some new results on assessment of Q-gram filter efficiency // 9th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis (ISPA) 2015 . proceedings
Zagreb, Hrvatska: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2015. str. 294-297 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
8.Statistical Inference Framework for Source Detection of Contagion Processes on Arbitrary Network Structures // Proceedings of 2014 IEEE Eighth International Conference on Self-Adaptive and Self-Organizing Systems Workshops
London, Ujedinjeno Kraljevstvo, 2015. str. 78-83 (ostalo, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
9.Aspects of DNA Assembly Acceleration on Reconfigurable Platforms // PROCEEDINGS IT SYSTEMS 2013 / Žagar, Martin ; Knezović, Josip ; Mlinarić, Hrvoje ; Hofman Daniel, Kovač Mario (ur.).
Bol: Fakultet elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu, 2013. str. 289-292 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
10.Proteini i nukleinske kiseline u vremenu i prostoru // Bioinformatics and biological physics: proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 149-157 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
11.Protein database search optimization based on CUDA and MPI // The 36th international ICT convention MIPRO
Opatija, Hrvatska, 2013. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
12.Approaches to DNA de novo Assembly // Mipro 2013, Proceedings of the 36th International Convention
Opatija, Hrvatska, 2013. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
13.CUDA implementation of the algorithm for simulating the epidemic spreading over large networks // 35. međunarodni skup MIPRO
Opatija, Hrvatska, 2012. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
14.Parallel Protein Docking Tool // 33rd International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO 2010) : Proceedings
Opatija, 2010. str. 1333-1338 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
15.Comparison of the RADIUS and Diameter Protocols // Information Technology Interfaces, 2008. ITI 2008. 30th International Conference on
Dubrovnik, 2008. str. 893-898 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
16.Protecting and controlling Virtual LANs by Linux router-firewall // Proceedings of the 27th International Conference on Information Technology Interfaces / Lužar - Stiffler, Vesna ; Hljuz Dobrić, Vesna ; Dobrenić, Nataša (ur.).
Zagreb: Sveučilišni računski centar Sveučilišta u Zagrebu (Srce), 2005. str. 549-554 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
17.Model naplate sadržaja i usluga u mobilnim paketskim mrežama // Computer in telecommunications
Zagreb, 2003. str. 68-73 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
1.Efikasno upravljanje e-mailom // E-biz 2004 / Mislav Polonijo (ur.).
Rijeka: Case Publishing, 2004. (predavanje, cjeloviti rad (in extenso), stručni) -
2.Sigurnost bežičnih LAN-ova // KOM 2003, Komunikacijske tehnologije i norme u informatici / Polonijo, Mislav (ur.).
Rijeka: CASE d.o.o., 2003. (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), stručni) -
1.Yet another de novo genome assembler // 11th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis (ISPA 2019)
Dubrovnik, Hrvatska, 2019. str. 147-151 doi:10.1109/ISPA.2019.8868909 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo) -
2.Mobile content efficiency and business model // Major Cities of Europe IT User's Group, Zagreb 2003
Zagreb, Hrvatska, 2003. (pozvano predavanje, cjeloviti rad (in extenso), ostalo) -
1.Whole genome comparison of Vibrio harveyi strains from the Mediterranean Sea // EAFP 20th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish / Mladineo, Ivona (ur.).
Aberdeen (MD): EAFP, 2021. str. 64-64 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
2.Differentiating between Exogenous and Endogenous Information Propagation in Social Networks // Second International Workshop on Data Science : Abstract Book
Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 39-41 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
3.Ra – Rapid de novo genome assembler // ISMB/ECCB 2017
Prag, Češka Republika, 2017. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
4.Rala - Rapid layout module for de novo genome assembly // ISMB/ECCB 2017
Prag, Češka Republika, 2017. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
5.Inference of influence in social networks // CompleNet'17 : Programme with Abstracts
Dubrovnik, Hrvatska, 2017. str. 93-93 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
6.RNA Transcriptome Mapping with GraphMap // Bioinformatics Research and Applications 13th International Symposium, ISBRA 2017 / Cai, Zhipeng ; Daescu, Ovidiu ; Li, Min (ur.).
Honolulu (HI), Sjedinjene Američke Države: Springer, 2017. str. XXIX-XXX (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
7.Continuum model of gene expression // Thirteenth International Seminar: Mathematical Models & Modeling in Laser Plasma Processes & Advanced Science Technologies
Petrovac na Moru, Crna Gora, 2015. str. 75-75 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
8.From Short to Long Reads: Benchmarking Assembly Tools // ISMB/ECCB 2013
Berlin, Njemačka, 2013. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
9.Epidemic centrality – identifying “superspreaders” in complex networks // Book of Abstracts ECCS'11 Vienna / Thurner, Stefan ; Szell, Michael (ur.).
Beč, 2011. str. 124-125 (poster, sažetak, znanstveni) -
10.Prediction of protein-protein hetero interaction sites from local sequence information using Random Forest // Book of abstracts, The 2nd Opatija Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Babić, Darko ; Došlić, Nađa ; Smith, David ; Tomić, Sanja, Vlahoviček, Kristian (ur.).
Opatija: Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, IRB, 2007. str. 87-87 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
11.Koreliranje oblika površine i hidrofobnosti proteina korištenjem razvoja u kugline funkcije // Book of abstracts, The 2nd Opatija Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Babić, Darko ; Došlić, Nađa ; Smith, David ; Tomić, Sanja ; Vlahoviček, Kristian (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković, 2007. str. 69-69 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
1.Asian Reference Genome Project // International Genome Graph Symposium 2022
Ascona, Švicarska, 2022. (pozvano predavanje, neobjavljeni rad, znanstveni) -
2.Benchmarking metagenomic classification tools for long read sequencing data // 28th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2020
online;, 2020. doi:10.7490/f1000research.1118120.1 (poster, međunarodna recenzija, pp prezentacija, znanstveni) -
3.Deep learning approach to determining the type of long reads // International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology 2020
online; konferencija, 2020. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, ostalo) -
4.A step towards neural genome assembly // NeurIPS 2020 Learning Meets Combinatorial Algorithms Workshop
online; konferencija, 2020. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, ostalo) -
5.RNA Splice Aware Mapper // 4rd International Workshop on Data Science (IWDS 2019)
Zagreb, Hrvatska, 2019. str. 72-74 (poster, recenziran, prošireni sažetak, znanstveni) -
6.MinCall | MinION end2end convolutional deep learning basecaller // 2nd International workshop on deep learning for precision medicine, ECML-PKDD 2017
Skopje, Sjeverna Makedonija, 2017. str. 1-8 (predavanje, međunarodna recenzija, ostalo, znanstveni) -
7.Read classification using semi-supervised deep learning // 2nd International workshop on deep learning for precision medicine, ECML-PKDD 2017
Skopje, Sjeverna Makedonija, 2017. str. 1-8 (predavanje, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni) -
8.Racon - Rapid consensus module for raw de novo genome assembly of long uncorrected reads // London calling conference 2016
London, Ujedinjeno Kraljevstvo, 2016. 1294720741, 1 (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni) -
9.Big data in the age of genomics // Data Science Monetization 2016 Conference
Zagreb, Hrvatska, 2016. (pozvano predavanje, pp prezentacija, ostalo) -
1.Detecting Base Modifications in DNA Sequences // Book of Abstracts of Fifth International Workshop on Data Science
Zagreb, Hrvatska, 2020. str. 58-60 (poster, prošireni sažetak, znanstveni) -
2.Supervised learning approach to long read classification // Fourth International Workshop on Data Science Abstract Book
Zagreb, Hrvatska, 2019. str. 71-72 (poster, međunarodna recenzija, prošireni sažetak, znanstveni) -
3.Algorithms for Layout Phase of De Novo Genome Assembly // Second International Workshop on Data Science
Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 86-87 (poster, međunarodna recenzija, prošireni sažetak, znanstveni) -
4.De Novo Assembly using Semi-Supervised Read Categorization // Second International Workshop on Data Science / Lončarić, Sven ; Šmuc, Tomislav (ur.).
Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 73-75 (poster, međunarodna recenzija, prošireni sažetak, znanstveni) -
5.De Novo Assembly using Unsupervised Read Categorization // Second International Workshop on Data Science / Lončarić, Sven ; Šmuc, Tomislav (ur.).
Zagreb, 2017. str. 69-72 (poster, međunarodna recenzija, prošireni sažetak, znanstveni) -
1.Algoritmi za de novo sastavljanje velikih genoma, 2019., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
2.Statističko zaključivanje o egzogenome i endogenome širenju informacija u društvenim mrežama, 2019., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
3.ALGORITHMS FOR DE NOVO GENOME ASSEMBLY FROM THIRD GENERATION SEQUENCING DATA, 2016., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
4.Statistical inference algorithms for epidemic processes on complex networks, 2015., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
5.Računalna metoda za predviđanje mjesta proteinskih interakcija, 2008., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
1.Optimiranje sigurnosnih pravila vatrozida, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
2.Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
3.Modeli naplate sadržaja u mobilnim paketskim mrežama, 2002., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
1.Combining protein and RNA structures information in developing new scoring functions, 2022., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
2.Evaluation of RNA Atom Distance Prediction Models, 2022., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
3.Deep learning model of nanopore sequencing pore, 2021., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
4.Rapid overlapping of Single Molecule High-Fidelity Sequencing Data, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
5.DNA Nanopore Sequencing Basecaller, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
6.Rapid Microbe Detection Using Deep Learning, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
7.Detection of Modified Nucleotides Using Nanopore Sequencing and Deep Learning Methods, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
8.Deep Learning Model of Nanopore Sequencing Pore, 2021., diplomski rad, diplomski, Zargeb
-
9.Detection of Modified Nucleotide Clusters in Nanopore Sequenced RNA Reads, 2021., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
10.Brzo poravnanje visoko pouzdanih dugačkih očitanja, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
11.Poopćenje algoritma za poravnanje parcijalnog uređaja, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
12.Struktura podataka za efikasno spremanje očitanja dobivenih sekvenciranjem genoma, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
13.Microbe Detection Using Deep Learning, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
14.Popravljanje djelomično sastavljenoga genoma pomoći Hi-C očitanja, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
15.Pipeline for Detection Clusters of Modified Nucleotides in Nanopore Sequenced RNA Reads, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
16.De Novo Diploid Assembly Using Third-Generation Sequencing Data, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
17.De Novo Metagenome Assembly Using Third Generation Sequencing Dana, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
18.Sustav za praćenje ispitanika tijekom pretraživanja Google tražilicom, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
19.Microbe Detection Using Signal Processing and Locality Sensitive Hashing, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
20.Overlapping Single Molecule High-Fidelity Sequencing Data, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
21.Early Screening for Preeclampsia, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
22.Classification of 1D-Signal Types Using Deep Learning, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
23.Ocjena alata za identifikaciju vrsta u metagenomskim uzorcima, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
24.Mapiranje slijeda na graf, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
25.Mapiranje dugačkih očitanja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
26.Mapiranje kratkih očitanja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
27.Izgradnja biblioteke za poravnavanje parova dugačkih RNA o čitanja, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
28.Using Reference Database for Plasmid Prediction, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
29.Pronalaženje varijanti gena iz podataka dobivenih sekvenciranjem, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
30.Klasifikacija očitanja koristeći metode dubokog učenja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
31.De novo sastavljanje genoma vođeno referencom, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
32.Poliranje DNA slijeda koristeći metode dubokog učenja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
33.Gornja granica u sastavljanju genoma, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
34.Scaffolding Assembled Genomes with Long Reads, 2018., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
35.De Novo Metagenome Assembly Using Read Clustering, 2018., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
36.End-to-End Deep Learning Model for Base Calling of MinION Nanopore Reads, 2018., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
37.Scaffolding Assembled Genomes with Long Reads, 2018., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
38.Protein Database Search Using Partial Order Alignment, 2018., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
39.Mobilna aplikacija za prikupljanje podataka o korisničkoj aktivnosti, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
40.Naučene indeksne strukture, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
41.Sustav za pohranu DNA, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
42.Procjena očekivanog stupnja potpunosti genoma iz dostupnih očitanja, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
43.Približni algoritam za brzo računanje poravnanja dvaju dugačkih nizova, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
44.Landau-Vishkin-Nussinov algoritam za poravnanje dva niza, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
45.Brzo pretraživanje sličnih proteinskih sljedova, 2018., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
46.Hidden Markov Model for Base Calling of MinION Nanopore Reads, 2018., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
47.Computing the Error Profiles of Third Generation Sequencing Technologies, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
48.Classification of 1D-Signal Types Using Semi- Supervised Deep Learning, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
49.Deep Learning Model for Base Calling of MinION Nanopore Reads, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
50.Identification of 1D-Signal Types Using Unsupervised Deep Learning, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
51.Classification of Large-Scale Biological Annotations Using Word Embeddings Derived from Corpora of Biomedical Research Literature, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
52.Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
53.dna2vec: vektorska reprezentacija k-torki različite duljine, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
54.Ručno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
55.Algoritam za određivanje ukupnog poravnanja dva grafa poravnanja parcijalnog uređaja, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
56.De novo assembly using long error-prone reads, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
57.Stablo Bloomovih filtara za spremanje sljedova, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
58.Poravnanje RNA očitanja na poznate gene, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
59.Poravnanje dugačkih RNA očitanja, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
60.Real-Time Analysis of a Metagenomic Sample Obtained by Nanopore Based Sequencing Technology, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
61.Detectability of Patient Zero Depending on its Position in the Network, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
62.Sufiksno stablo, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
63.REKONSTRUKCIJA FILOGENETSKOG STABLA KORISTEĆI METODU UDRUŽIVANJA SUSJEDA, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
64.Global sequence alignment tool, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
65.Alat za poravnanje dugackih očitanja, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
66.Generiranje konsenzusnog slijeda iz grafova djelomicno uređenih višestrukih poravnanja, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
67.Rekonstrukcija filogenetskog stabla metodom maksimalne uštede uz razgranaj-ograniči optimizaciju, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
68.EAGLER - Eliminating Assembly Gaps by Long Extending Reads, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
69.Poboljšano sufiksno polje, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
70.Splice isoform identification from transcript graphs, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
71.A reduced gene database for precision species detection, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
72.Long Read RNA-seq Mapper, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
73.De novo transcriptome assembly, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
74.Scaffolding using long error-prone reads, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
75.Alat za poravnanje genoma, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
76.Alat za brzo pretraživanje baza bioloških sljedova, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
77.Information propagation in online social networks, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
78.Otkrivanje preklapajućih DNA očitanja, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
79.Simplification of the Overlap Graph, 2014., diplomski rad, diplomski, Sveučilište u Zagrebu, Zagreb
-
80.RNA-seq mapper, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
81.De novo metagenomic assembly using Bayesian model-based clustering, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
82.Računalne metode za poboljšanje i validaciju sastavljenih genoma, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrorehnike i računarstva, Zagreb
-
83.Identify pathogen organisms from a stream of RNA sequences, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
84.An SIMD dynamic programming C/C++ library, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
85.Tool for aligning long DNA reads, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
86.Web sučelje za poravnanje sljedova, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
87.GPU implementacija vremenski i memorijski učinkovitoga paralelnog algoritma za poravnanje slijedova, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
88.Sastavljanje optičkih mapa: modul za korekciju grafa, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
89.Alternativno spajanje eksona, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
90.Evaluacija aplikacija za pretraživanje baze proteinskih sljedova, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
91.Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
92.SW# - Biblioteka za poravnanje sljedova korištenjem grafičkih procesora, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
93.Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
94.GPU implementacija vremenski učinkovitog algoritma za lokalno poravnavanje s linearnom memorijskom složenosti, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
95.Program za automatsku analizu protein kodirajućih gena, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
96.Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
97.Orthobalancer: aplikacija za kreiranje skupova bioloških vrsta usporedive taksonomske širine, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
98.GPU implementacija vremenski efikasnog algoritma za lokalno poravnavanje s linearnom memorijskom složenosti, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
99.Make Me Move - didaktička računalna igra za učenje strukturne molekularne biologije, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
100.Program za simulaciju pročitanih nizova nukleotida, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
101.Implementacija FM indeksa, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
102.SWIG - Poravnanje struktura korištenjem iterativne primjene Smith-Waterman algoritma, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
103.Implementacija komprimirane podatkovne strukture za pretraživanje teksta temeljene na FMindeksu, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
104.BioMe - web sučelje baze biološki važnih metala, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
105.Predviđanje površine dostupne otapalu iz slijeda aminokiselinskih ostataka, 2011., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
106.Adaptivna valićna transformacija ostvarena na CUDA arhitekturi, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
107.Alat za prianjanje proteina: modul za vizualizaciju, 2011., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
108.CUDA implementacija računanja elektrostatske raspodjele naboja, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
109.Pronalaženje epistatskih interakcija pomoću algoritma kolonije mrava, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
110.Implementacija Smith Waterman algoritma koristeći grafičke kartice s CUDA arhitekturom, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
111.Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
112.Predviđanje mjesta sekundarne strukture protein iz slijeda aminokiselinskih ostataka, 2010., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
113.Alat za prianjanje proteina: modul za pripremu prianjanja, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
114.Sustav za pristup poslužiteljima u pokretnim mrežama, 2010., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
115.Baza podataka metala u proteinima, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
116.Simulacija utjecaja karantena na smanjenje širenja epidemije, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
