Pregled po CROSBI profilu: Mile Šikić (CROSBI Profil: 27663, MBZ: 250972)
-
76.Vaser, Robert; Šikić, MileRa – Rapid de novo genome assembler // ISMB/ECCB 2017
Prag, Češka Republika, 2017. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
77.Vaser, Robert; Šikić, MileRala - Rapid layout module for de novo genome assembly // ISMB/ECCB 2017
Prag, Češka Republika, 2017. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
78.Križanović, Krešimir; Echchiki, Amina; Roux, Julien; Šikić, MileEvaluation of tools for long read RNA-seq splice- aware alignment // Bioinformatics, btx668 (2017), btx668, 7 doi:10.1093/bioinformatics/btx668 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
79.Gebavi, Hrvoje; Mikac, Lara; Marciuš, Marijan; Šikić, Mile; Mohaček-Grošev, Vlasta; Janči, Tibor; Vidaček, Sanja; Hasanspahić, Emina; Omanović Miklićanin, Enisa; Ivanda, MileSilicon Nanowires Substrates Fabrication for Ultra-Sensitive Surface Enhanced Raman Spectroscopy Sensors // Croatica chemica acta, 90 (2017), 2; 259-262 doi:10.5562/cca3127 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
80.Ristov, Strahil; Vaser, Robert; Šikić, MileTrade-offs in query and target indexing for the selection of candidates in protein homology searches // Proceedings of The Prague Stringology Conference 2017 / Jan Holub and Jan Ždarek (ur.).
Prag: Czech technical university in Prague, 2017. str. 118-125 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
81.Megla, LucijaComputing the Error Profiles of Third Generation Sequencing Technologies, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
82.Šebrek, TomislavClassification of 1D-Signal Types Using Semi- Supervised Deep Learning, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
83.Ratković, MarkoDeep Learning Model for Base Calling of MinION Nanopore Reads, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
84.Tomljanović, JanIdentification of 1D-Signal Types Using Unsupervised Deep Learning, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
85.Baćac, AdrianoClassification of Large-Scale Biological Annotations Using Word Embeddings Derived from Corpora of Biomedical Research Literature, 2017., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
86.Rupe, MarinaAnaliza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
87.Kutnjak, Mateodna2vec: vektorska reprezentacija k-torki različite duljine, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
88.Floreani, FilipRučno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
89.Bradač, MislavAlgoritam za određivanje ukupnog poravnanja dva grafa poravnanja parcijalnog uređaja, 2017., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb
-
90.Matija Piškorec, Nino Antulov-Fantulin, Iva Miholić, Tomislav Šmuc, Mile ŠikićInference of influence in social networks // CompleNet'17 : Programme with Abstracts
Dubrovnik, Hrvatska, 2017. str. 93-93 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
91.Križanović, Krešimir; Sović, Ivan; Krpelnik, Ivan; Šikić, MileRNA Transcriptome Mapping with GraphMap // Bioinformatics Research and Applications 13th International Symposium, ISBRA 2017 / Cai, Zhipeng ; Daescu, Ovidiu ; Li, Min (ur.).
Honolulu (HI), Sjedinjene Američke Države: Springer, 2017. str. XXIX-XXX (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
92.Vaser, Robert; Sović, Ivan; Nagaranjan, Niranjan; Šikić, MileFast and accurate de novo genome assembly from long uncorrected reads // Genome research, 27 (2017), 737-746 doi:10.1101/gr.214270.116 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
93.Šošić, Martin; Šikić, MileEdlib: a C/C ++ library for fast, exact sequence alignment using edit distance // Bioinformatics, 33 (2017), 9; 1394-1395 doi:10.1093/bioinformatics/btw753 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
94.Vaser, Robert; Sović, Ivan; Nagarajan, Niranjan; Šikić, MileRacon - Rapid consensus module for raw de novo genome assembly of long uncorrected reads // London calling conference 2016
London, Ujedinjeno Kraljevstvo, 2016. 1294720741, 1 (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni) -
95.Vaser, Robert; Pavlović, Dario; Šikić, MileSWORD—a highly efficient protein database search // ECCB 2016: THE 15TH EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY
Den Haag, Nizozemska, 2016. str. 680-684 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
96.Šikić, MileBig data in the age of genomics // Data Science Monetization 2016 Conference
Zagreb, Hrvatska, 2016. (pozvano predavanje, pp prezentacija, ostalo) -
97.Sović, IvanALGORITHMS FOR DE NOVO GENOME ASSEMBLY FROM THIRD GENERATION SEQUENCING DATA, 2016., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
98.Kostelac, MarioDe novo assembly using long error-prone reads, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
99.Vaser, Robert; Pavlović, Dario; Šikić, MileSWORD—a highly efficient protein database search // Bioinformatics, 32 (2016), 17; 680-684 doi:10.1093/bioinformatics/btw445 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
100.Križanović, Krešimir; Marinović, Mladen; Bulović, Ana; Vaser, Robert; Šikić, MileTGTP-DB – a database for extracting genome, transcriptome and proteome data using taxonomy // Proceedings of the 39th International Convention Mipro 2016, Distributed Computing, Visualization and Biomedical Engineering /DC VIS / Biljanović, Petar (ur.).
Rijeka: Hrvatska udruga za informacijsku i komunikacijsku tehnologiju, elektroniku i mikroelektroniku - MIPRO, 2016. str. 472-476 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)