Pregled po CROSBI profilu: Mile Šikić (CROSBI Profil: 27663, MBZ: 250972)

151.

Korpar, Matija

SW# - Biblioteka za poravnanje sljedova korištenjem grafičkih procesora, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

152.

Kušević, Katarina

Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

153.

Sović, Ivan; Skala, Karolj; Šikić, Mile

From Short to Long Reads: Benchmarking Assembly Tools // ISMB/ECCB 2013
Berlin, Njemačka, 2013. str. 1-1 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

154.

Sović, Ivan; Skala, Karolj; Šikić, Mile

Approaches to DNA de novo Assembly // Mipro 2013, Proceedings of the 36th International Convention
Opatija, Hrvatska, 2013. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

155.

Antulov-Fantulin, Nino; Lančić, Alen; Štefančić, Hrvoje; Šikić, Mile

FastSIR algorithm : A fast algorithm for the simulation of the epidemic spread in large networks by using the susceptible–infected–recovered compartment model // Information sciences, 239 (2013), 226-240 doi:10.1016/j.ins.2013.03.036 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com dx.doi.org

156.

Žužić, Goran

GPU implementacija vremenski učinkovitog algoritma za lokalno poravnavanje s linearnom memorijskom složenosti, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

157.

Bulović, Ana

Program za automatsku analizu protein kodirajućih gena, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

158.

Ogrizek-Tomaš, Mario

Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

159.

Sandhu, Kuljeet Singh; Li, Guoliang; Poh, Huay Mei; Quek , Yu Ling Kelly; Sia , Yee Yen; Peh, Su Qin; Mulawadi, Fabianus Hendriyan; Lim , Joanne; Šikić, Mile; Menghi, Francesca et al.

Large-Scale Functional Organization of Long-Range Chromatin Interaction Networks // Cell Reports, 2 (2012), 5; P1207-1219 doi:10.1016/j.celrep.2012.09.022 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.cell.com

160.

Slijepčević, Ivan

Orthobalancer: aplikacija za kreiranje skupova bioloških vrsta usporedive taksonomske širine, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

161.

Hucaljuk, Josip

GPU implementacija vremenski efikasnog algoritma za lokalno poravnavanje s linearnom memorijskom složenosti, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

162.

Jerković, Igor

Make Me Move - didaktička računalna igra za učenje strukturne molekularne biologije, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

163.

Županović, Vanessa

Program za simulaciju pročitanih nizova nukleotida, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i Računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

164.

Tus, Alan; Rakipović, Alen; Peretin, Goran; Tomić, Sanja; Šikić, Mile

BioMe : biologically relevant metals // Nucleic acids research, 40 (2012), W352-W357 doi:10.1093/nar/gks514 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi nar.oxfordjournals.org nar.oxfordjournals.org

165.

Šošić, Matija; Šikić, Mile

CUDA implementation of the algorithm for simulating the epidemic spreading over large networks // 35. međunarodni skup MIPRO
Opatija, Hrvatska, 2012. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada

166.

Šošić, Matija

Implementacija FM indeksa, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

167.

Rahle, Bruno

SWIG - Poravnanje struktura korištenjem iterativne primjene Smith-Waterman algoritma, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

168.

Šošić, Martin

Implementacija komprimirane podatkovne strukture za pretraživanje teksta temeljene na FMindeksu, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

169.

Rakipović, Alen

BioMe - web sučelje baze biološki važnih metala, 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

170.

Franke, Vedran; Šikić, Mile; Vlahoviček, Kristian

Prediction of interacting protein residues using sequence and structure data. // Computational Drug Discovery and Design / Riccardo Baron (ur.).
New York (NY) : Dordrecht : Heidelberg : London: Springer, 2012. str. 233-251

link.springer.com

171.

Katić, Tihomir

Optimiranje sigurnosnih pravila vatrozida, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

172.

Popović, Irena

Predviđanje površine dostupne otapalu iz slijeda aminokiselinskih ostataka, 2011., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

complex.zesoi.fer.hr

173.

Osrečki, Matija

Adaptivna valićna transformacija ostvarena na CUDA arhitekturi, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

174.

Šikić, Mile; Lančić, Alen; Antulov-Fantulin, Nino; Štefančić, Hrvoje

Epidemic centrality – identifying “superspreaders” in complex networks // Book of Abstracts ECCS'11 Vienna / Thurner, Stefan ; Szell, Michael (ur.).
Beč, 2011. str. 124-125 (poster, sažetak, znanstveni)

eccs2011.eu

175.

Sović, Ivan

Alat za prianjanje proteina: modul za vizualizaciju, 2011., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

176.

Pavetić, Filip

CUDA implementacija računanja elektrostatske raspodjele naboja, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

177.

Papeš Šokčević, Lidija

Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

urn.nsk.hr

178.

Blažeka, Dino

Pronalaženje epistatskih interakcija pomoću algoritma kolonije mrava, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

179.

Korpar, Matija

Implementacija Smith Waterman algoritma koristeći grafičke kartice s CUDA arhitekturom, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

180.

Kušević, Katarina

Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

181.

Lančić, Alen; Antulov-Fantulin, Nino; Šikić, Mile; Štefančić, Hrvoje

Phase diagram of epidemic spreading — unimodal vs. bimodal probability distributions // Physica. A, Statistical mechanics and its applications, 390 (2011), 1; 65-76 doi:10.1016/j.physa.2010.06.024 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com www.sciencedirect.com

182.

Janjić, Saša

Predviđanje mjesta sekundarne strukture protein iz slijeda aminokiselinskih ostataka, 2010., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

complex.zesoi.fer.hr

183.

Čanadi, Igor

Alat za prianjanje proteina: modul za pripremu prianjanja, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

184.

Bilić, Ivan

Sustav za pristup poslužiteljima u pokretnim mrežama, 2010., diplomski rad, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

185.

Tus, Alan

Baza podataka metala u proteinima, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

complex.zesoi.fer.hr

186.

Ogrizek-Tomaš, Mario

Simulacija utjecaja karantena na smanjenje širenja epidemije, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

187.

Petrović, Juraj

Predviđanje mjesta proteinskih interakcija koristeći algoritam slučajnih šuma, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada complex.zesoi.fer.hr

188.

Matija Piškorec

Multiresolution analysis of macromolecular structures, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada complex.zesoi.fer.hr

189.

Rakipović, Alen

Simulacija utjecaja okupljanja zaraženih gripom na širenje epidemije, 2010., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

190.

Peretin, Goran

Baza zastupljenosti metala u proteinima, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

191.

Ćurić, Jura

Analiza sekundarne strukture proteina metodom obrade signala, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

192.

Antulov-Fantulin, Nino

Alat za prianjanje proteina: moduli za rotaciju i vrednovanje rezultata, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehike i računarstva, Zagreb

complex.zesoi.fer.hr

193.

Čolić, Dragana

Alat za prianjanje proteina: modul za utvrđivanje interakcija, 2010., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

194.

Sović, Ivan; Antulov-Fantulin, Nino; Čanadi, Igor; Piškorec, Matija; Šikić, Mile

Parallel Protein Docking Tool // 33rd International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO 2010) : Proceedings
Opatija, 2010. str. 1333-1338 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

ieeexplore.ieee.org

195.

Štimac, Maja

Klasifikacija kodirajućih regija u genomu, 2009., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

196.

Bokšić, Mirna

Analiza kodirajućih regija u genomu, 2009., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

197.

Šikić, Mile; Tomić, Sanja; Vlahoviček, Kristian

Prediction of Protein-Protein Interaction Sites in Sequences and 3D Structures by Random Forests // Plos computational biology, 5 (2009), 1; e1000278-1 doi:10.1371/journal.pcbi.1000278 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi fulir.irb.hr journals.plos.org

198.

Sović, Ivan

Vizualizacija makromolekula, 2008., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada

199.

Piškorec, Matija

Identifikacija ključnih igrača u kompleksnim mrežama blogova, 2008., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada complex.zesoi.fer.hr

200.

Petrović, Juraj

Automatska izrada testnog skupa za predvidanje proteinskih interakcija, 2008., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Pristup cjelovitom tekstu rada complex.zesoi.fer.hr