Pregled po CROSBI profilu: Mile Šikić (CROSBI Profil: 27663, MBZ: 250972)
-
101.Škugor, LukaStablo Bloomovih filtara za spremanje sljedova, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
102.Krpelnik, IvanPoravnanje RNA očitanja na poznate gene, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
103.Jurić, AntonioPoravnanje dugačkih RNA očitanja, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
104.Vujević, IvanReal-Time Analysis of a Metagenomic Sample Obtained by Nanopore Based Sequencing Technology, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
105.Miholić, IvaDetectability of Patient Zero Depending on its Position in the Network, 2016., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
106.Sović, Ivan; Križanović, Krešimir; Skala, Karolj; Šikić, MileEvaluation of hybrid and non-hybrid methods for de novo assembly of nanopore reads // Bioinformatics, 32 (2016), 17; 2582-2589 doi:10.1093/bioinformatics/btw237 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
107.Sović, Ivan; Šikić, Mile; Wilm Andreas; Fenlon, Shannon Nicole; Chen, SwaineFast and sensitive mapping of nanopore sequencing reads with GraphMap // Nature Communications, 7 (2016), 11307-1 doi:10.1038/ncomms11307 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
108.Vaser, Robert; Adusumalli, Swarnaseetha; Ngak Leng, Sim; Šikić, Mile; Ng, Pauline C.SIFT missense predictions for genomes // Nature Protocols, 11 (2016), 1-9 doi:10.1038/nprot.2015.123 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
109.Šebrek, TomislavSufiksno stablo, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
110.Megla, LucijaREKONSTRUKCIJA FILOGENETSKOG STABLA KORISTEĆI METODU UDRUŽIVANJA SUSJEDA, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
111.Žužić, GoranGlobal sequence alignment tool, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
112.Ratković, MarkoAlat za poravnanje dugackih očitanja, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
113.Baćac, AdrianoGeneriranje konsenzusnog slijeda iz grafova djelomicno uređenih višestrukih poravnanja, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
114.Selak, Ana MarijaRekonstrukcija filogenetskog stabla metodom maksimalne uštede uz razgranaj-ograniči optimizaciju, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
115.Šterbić, LukaEAGLER - Eliminating Assembly Gaps by Long Extending Reads, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
116.Hadviger, AnteaPoboljšano sufiksno polje, 2015., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
117.Korpar, Matija; Šošić, Martin; Blažeka, Dino; Šikić, MileSW#db: GPU-Accelerated Exact Sequence Similarity Database Search // PLoS One, 10 (2015), 12. doi:10.1371/journal.pone.0145857 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
118.Novak, Andrej, Racz, Gabriela C.; Sedmak, Goran; Šikić, MileContinuum model of gene expression // Thirteenth International Seminar: Mathematical Models & Modeling in Laser Plasma Processes & Advanced Science Technologies
Petrovac na Moru, Crna Gora, 2015. str. 75-75 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni) -
119.Novak, Andrej; Križanović, Krešimir; Lančić, Alen; Šikić, MileSome new results on assessment of Q-gram filter efficiency // 9th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis (ISPA) 2015 . proceedings
Zagreb, Hrvatska: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2015. str. 294-297 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
120.Antulov-Fantulin, NinoStatistical inference algorithms for epidemic processes on complex networks, 2015., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
121.Pavlović, DarioSplice isoform identification from transcript graphs, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
122.Humski, DorijaA reduced gene database for precision species detection, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
123.Marić, JosipLong Read RNA-seq Mapper, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
124.Vaser, RobertDe novo transcriptome assembly, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
125.Čulinović, MarkoScaffolding using long error-prone reads, 2015., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
126.Antulov-Fantulin, Nino; Lančić, Alen; Šmuc, Tomislav; Štefančić, Hrvoje; Šikić, MileIdentification of Patient Zero in Static and Temporal Networks : Robustness and Limitations // Physical Review Letters, 114 (2015), 248701-1 doi:10.1103/PhysRevLett.114.248701 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
127.Antulov-Fantulin, Nino; Lančić, Alen; Štefančić, Hrvoje; Šikić, Mile; Šmuc, TomislavStatistical Inference Framework for Source Detection of Contagion Processes on Arbitrary Network Structures // Proceedings of 2014 IEEE Eighth International Conference on Self-Adaptive and Self-Organizing Systems Workshops
London, Ujedinjeno Kraljevstvo, 2015. str. 78-83 (ostalo, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
128.Žuljević, PetarAlat za poravnanje genoma, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
129.Vujević, IvanAlat za brzo pretraživanje baza bioloških sljedova, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
130.Miholić, IvaInformation propagation in online social networks, 2014., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
131.Osrečki, MatijaOtkrivanje preklapajućih DNA očitanja, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
132.Rahle, BrunoSimplification of the Overlap Graph, 2014., diplomski rad, diplomski, Sveučilište u Zagrebu, Zagreb
-
133.Jerković, IgorRNA-seq mapper, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
134.Dvorničić, MirtaDe novo metagenomic assembly using Bayesian model-based clustering, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
135.Županović, VanessaRačunalne metode za poboljšanje i validaciju sastavljenih genoma, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrorehnike i računarstva, Zagreb
-
136.Šošić, MatijaIdentify pathogen organisms from a stream of RNA sequences, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
137.Šošić, MartinAn SIMD dynamic programming C/C++ library, 2014., diplomski rad, diplomski, Fakultet Elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
138.Khoo, Aik-Aun; Ogrizek-Tomaš, Mario; Bulović, Ana; Korpar, Matija; Gurler, Ece; Slijepčević, Ivan; Šikić, Mile; Mihalek, IvanaExoLocator—an online view into genetic makeup of vertebrate proteins // Nucleic acids research, 42 (2014), D1; 879-881 doi:10.1093/nar/gkt1164 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
139.Sović, Ivan; Šikić, Mile; Skala, KaroljAspects of DNA Assembly Acceleration on Reconfigurable Platforms // PROCEEDINGS IT SYSTEMS 2013 / Žagar, Martin ; Knezović, Josip ; Mlinarić, Hrvoje ; Hofman Daniel, Kovač Mario (ur.).
Bol: Fakultet elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu, 2013. str. 289-292 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
140.Tomić, Sanja; Brkić, Hrvoje; Grabar Branilović, Marina; Tomić, Antonija; Branimir, Bertoša; Mile, ŠikićProteini i nukleinske kiseline u vremenu i prostoru // Bioinformatics and biological physics: proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 149-157 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
141.Pavetić, FilipTool for aligning long DNA reads, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
142.Šikić, Mile; Lančić, Alen; Antulov-Fantulin, Nino; Štefančić, HrvojeEpidemic centrality — is there an underestimated epidemic impact of network peripheral nodes? // European physical journal B : condensed matter physics, 86 (2013), 10; 440, 13 doi:10.1140/epjb/e2013-31025-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
143.Pavlović, Dario; Vaser, Robert; Korpar, Matija; Šikić, MileProtein database search optimization based on CUDA and MPI // The 36th international ICT convention MIPRO
Opatija, Hrvatska, 2013. (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
144.Korpar, Matija; Šikić, MileSW#–GPU-enabled exact alignments on genome scale // Bioinformatics, 29 (2013), 19; 2494-2495 doi:10.1093/bioinformatics/btt410 (međunarodna recenzija, kratko priopcenje, znanstveni)
-
145.Blažeka, DinoWeb sučelje za poravnanje sljedova, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
146.Mikulić, MarijaGPU implementacija vremenski i memorijski učinkovitoga paralelnog algoritma za poravnanje slijedova, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
147.Šterbić, LukaSastavljanje optičkih mapa: modul za korekciju grafa, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
148.Humski, DorijaAlternativno spajanje eksona, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
149.Vaser, RobertEvaluacija aplikacija za pretraživanje baze proteinskih sljedova, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
150.Pavlović, DarioEvaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb