Pregled po CROSBI profilu: Mile Šikić (CROSBI Profil: 27663, MBZ: 250972)
Pronađeno 213 radova
-
1.Facilitating genome structural variation analysis // Nature methods, 20 (2023), 491-492 doi:10.1038/s41592-023-01767-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
2.Asian Reference Genome Project // International Genome Graph Symposium 2022
Ascona, Švicarska, 2022. (pozvano predavanje, neobjavljeni rad, znanstveni) -
3.Direct identification of A-to-I editing sites with nanopore native RNA sequencing // Nature methods, 19 (2022), 833-844 doi:10.1038/s41592-022-01513-3 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
4.Genome assembly and chemogenomic profiling of National Flower of Singapore Papilionanthe Miss Joaquim ‘Agnes’ reveals metabolic pathways regulating floral traits // Communications biology, 5 (2022), 967, 9 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
5.Combining protein and RNA structures information in developing new scoring functions, 2022., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
6.Evaluation of RNA Atom Distance Prediction Models, 2022., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
7.Deep learning model of nanopore sequencing pore, 2021., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
8.Rapid overlapping of Single Molecule High-Fidelity Sequencing Data, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
9.DNA Nanopore Sequencing Basecaller, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
10.Rapid Microbe Detection Using Deep Learning, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
11.Detection of Modified Nucleotides Using Nanopore Sequencing and Deep Learning Methods, 2021., diplomski rad, diplomski, Zagreb
-
12.Deep Learning Model of Nanopore Sequencing Pore, 2021., diplomski rad, diplomski, Zargeb
-
13.Whole genome comparison of Vibrio harveyi strains from the Mediterranean Sea // EAFP 20th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish / Mladineo, Ivona (ur.).
Aberdeen (MD): EAFP, 2021. str. 64-64 (predavanje, sažetak, znanstveni) -
14.Time- and memory-efficient genome assembly with Raven // Nature Computational Science, 1 (2021), 332-336 doi:10.1038/s43588-021-00073-4 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
15.Detection of Modified Nucleotide Clusters in Nanopore Sequenced RNA Reads, 2021., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
16.Brzo poravnanje visoko pouzdanih dugačkih očitanja, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
17.Poopćenje algoritma za poravnanje parcijalnog uređaja, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
18.Struktura podataka za efikasno spremanje očitanja dobivenih sekvenciranjem genoma, 2021., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
19.Efficacy of next-generation sequencing in bacterial zoonoses diagnostics // Veterinarska stanica, 53 (2021), 1; 1-10 doi:10.46419/vs.53.1.9 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, ostalo)
-
20.Microbe Detection Using Deep Learning, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
21.Benchmarking metagenomic classification tools for long read sequencing data // 28th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2020
online;, 2020. doi:10.7490/f1000research.1118120.1 (poster, međunarodna recenzija, pp prezentacija, znanstveni) -
22.Deep learning approach to determining the type of long reads // International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology 2020
online; konferencija, 2020. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, ostalo) -
23.A step towards neural genome assembly // NeurIPS 2020 Learning Meets Combinatorial Algorithms Workshop
online; konferencija, 2020. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, ostalo) -
24.Detecting Base Modifications in DNA Sequences // Book of Abstracts of Fifth International Workshop on Data Science
Zagreb, Hrvatska, 2020. str. 58-60 (poster, prošireni sažetak, znanstveni) -
25.Popravljanje djelomično sastavljenoga genoma pomoći Hi-C očitanja, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
26.Pipeline for Detection Clusters of Modified Nucleotides in Nanopore Sequenced RNA Reads, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
27.De Novo Diploid Assembly Using Third-Generation Sequencing Data, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
28.De Novo Metagenome Assembly Using Third Generation Sequencing Dana, 2020., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
29.Sustav za praćenje ispitanika tijekom pretraživanja Google tražilicom, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
30.Microbe Detection Using Signal Processing and Locality Sensitive Hashing, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
31.Overlapping Single Molecule High-Fidelity Sequencing Data, 2020., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
32.Yet another de novo genome assembler // 11th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis (ISPA 2019)
Dubrovnik, Hrvatska, 2019. str. 147-151 doi:10.1109/ISPA.2019.8868909 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo) -
33.Algoritmi za de novo sastavljanje velikih genoma, 2019., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
34.Statističko zaključivanje o egzogenome i endogenome širenju informacija u društvenim mrežama, 2019., doktorska disertacija, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
35.Supervised learning approach to long read classification // Fourth International Workshop on Data Science Abstract Book
Zagreb, Hrvatska, 2019. str. 71-72 (poster, međunarodna recenzija, prošireni sažetak, znanstveni) -
36.RNA Splice Aware Mapper // 4rd International Workshop on Data Science (IWDS 2019)
Zagreb, Hrvatska, 2019. str. 72-74 (poster, recenziran, prošireni sažetak, znanstveni) -
37.Approaches to metagenomic classification and assembly // Biomedical Engineering
Opatija, Hrvatska: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2019. str. 367-375 doi:10.23919/mipro.2019.8756644 (predavanje, recenziran, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni) -
38.Disentangling Sources of Influence in Online Social Networks // IEEE access, 7 (2019), 131692-131704 doi:10.1109/access.2019.2940762 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
39.Hybrid metagenomic assembly enables high- resolution analysis of resistance determinants and mobile elements in human microbiomes // Nature biotechnology, 37 (2019), 8; 937-944 doi:10.1038/s41587-019-0191-2 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
-
40.Early Screening for Preeclampsia, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
41.Classification of 1D-Signal Types Using Deep Learning, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
42.Ocjena alata za identifikaciju vrsta u metagenomskim uzorcima, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
43.Mapiranje slijeda na graf, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
44.Mapiranje dugačkih očitanja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
45.Mapiranje kratkih očitanja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
46.Izgradnja biblioteke za poravnavanje parova dugačkih RNA o čitanja, 2019., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
47.Using Reference Database for Plasmid Prediction, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
48.Pronalaženje varijanti gena iz podataka dobivenih sekvenciranjem, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
49.Klasifikacija očitanja koristeći metode dubokog učenja, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
-
50.De novo sastavljanje genoma vođeno referencom, 2019., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
