Pregled po CROSBI profilu: Matko Glunčić (CROSBI Profil: 21091, MBZ: 256133)

1.

Paar, Vladimir; Rosandić, Marija; Basar, Ivan; Glunčić, Matko; Pavin, Nenad
Key string algorithm - New computational method for identification and analysis of very long repeats in genomic sequences // Application of Genomics and Bioinformatics in Plants / Rao, G.P. ; Wagner, C. ; Singh, R.K. (ur.).
Houston (TX): Studium Press, 2008. str. 91-120

Obrazovni materijali

Ostalo

1.

Aviani, Ivica; Dukić, Ines; Erceg, Nataša; Glunčić, Matko; Halusek, Vlado; Hrlec, Anica; Jakopović, Željko; Jalušić, Anđelka; Kliček, Damir; Martinko, Sanja; Planinić, Maja
Prijedlog Nacionalnog kurikuluma nastavnog predmeta Fizika - Studeni 2017 / Aviani, Ivica (ur.).
Zagreb: Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta: Cjelovita kurikularna reforma, 2017
www.researchgate.net

Radovi u časopisima

Znanstveni i pregledni radovi

1.

Glunčić, Matko; Vlahović, Ines; Mršić, Leo; Paar, Vladimir
Global Repeat Map (GRM) Application: Finding All DNA Tandem Repeat Units // Algorithms, 15 (2022), 12; a15120458, 15 doi:10.3390/a15120458 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.mdpi.com
2.

Glunčić, Matko; Vlahović, Ines; Rosandić, Marija; Paar, Vladimir
Tandemly repeated NBPF HOR copies (Olduvai triplets): Possible impact on human brain evolution // Life science alliance, 6 (2022), 1; e202101306, 9 doi:10.26508/lsa.202101306 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.life-science-alliance.org
3.

Rosandić, Marija; Vlahović, Ines; Pilaš, Ivan; Glunčić, Matko; Paar, Vladimir
An Explanation of Exceptions from Chargaff’s Second Parity Rule/Strand Symmetry of DNA Molecules // Genes, 13 (2022), 11; 1929, 21 doi:10.3390/genes13111929 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.mdpi.com
4.

Paar, Vladimir; Vlahović, Ines; Rosandić, Marija; Glunčić, Matko
Global Repeat Map (GRM): advantageous method for discovery of largest Higher-Order Repeats (HORs) in Neuroblastoma Breakpoint Family (NBPF) genes, in hornerin exon and in chromosome 21 centromere // Progress in molecular and subcellular biology, 60 (2021), 203-234 doi:10.1007/978-3-030-74889-0_8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi link.springer.com
5.

Glunčić, Matko; Martinjak, Ivica; Paar, Vladimir
A Dual of Colored Tilings Terminating Sums // The Rocky Mountain journal of mathematics, 50 (2020), 2; 589-597 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
projecteuclid.org
6.

Glunčić, M; Vlahović, I; Paar, V
Discovery of 33mer in chromosome 21 – the largest alpha satellite higher order repeat unit among all human somatic chromosomes // Scientific Reports, 9 (2019), 12629, 11 doi:10.1038/s41598-019-49022-2 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.nature.com
7.

Glunčić, Matko; Martinjak, Ivica
A Class of S-Restricted Compositions // International Journal of Number Theory, 15 (2019), 2; 361-371 doi:10.1142/S1793042119500180 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.worldscientific.com doi.org
8.

Klemm, Anna H.; Bosilj, Agneza; Glunčić, Matko; Pavin, Nenad; Tolić, Iva Marija
Metaphase kinetochore movements are regulated by kinesin-8 motors and microtubule dynamic instability // Molecular biology of the cell, 29 (2018), 11; 1332-1345 doi:10.1091/mbc.E17-11-0667 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi doi.org www.molbiolcell.org
9.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Ugarković, Đurđica; Paar, Vladimir
Regular higher order repeat structures in beetle Tribolium castaneum genome // Genome Biology and Evolution, 9 (2017), 10; 2668-2680 doi:10.1093/gbe/evw174 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi academic.oup.com
10.

Erceg, Nataša; Aviani, Ivica; Mešić, Vanes; Glunčić, Matko; Žauhar, Gordana
Development of the kinetic molecular theory of gases concept inventory: Preliminary results on university students' misconceptions // Physical Review Special Topics-Physics Education Research, 12 (2016), 020139-1 doi:10.1103/PhysRevPhysEducRes.12.020139 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi https
11.

Rosandić, Marija; Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Paar, Vladimir
Trinucleotide’s quadruplet symmetries and natural symmetry law of DNA creation ensuing Chargaff’s second parity rule // Journal of biomolecular structure & dynamics, 34 (2016), 7; 1383-1394 doi:10.1080/07391102.2015.1080628 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.tandfonline.com
12.

Kajtez, Janko; Solomatina, Anastasia; Novak, Maja; Polak, Bruno; Vukušić, Kruno; Rüdiger, Jonas; Cojoc, Gheorge; Milas, Ana; Šumanovac Šestak, Ivana; Risteski, Patrik et al.
Overlap microtubules link sister k-fibres and balance the forces on bi-oriented kinetochores // Nature Communications, 7 (2016), 10298, 11 doi:10.1038/ncomms10298 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi doi.org www.nature.com fulir.irb.hr
13.

Glunčić, Matko; Maghelli, Nicola; Krull, Alexander; Krstić, Vladimir; Ramunno-Johnson, Damien; Pavin, Nenad; Tolić, Iva M.;
Kinesin-8 Motors Improve Nuclear Centering by Promoting Microtubule Catastrophe // Physical Review Letters, 114 (2015), 078103-1 doi:10.1103/PhysRevLett.114.078103 (međunarodna recenzija, pismo, znanstveni)
doi journals.aps.org dx.doi.org
14.

Rosandić, Marija; Paar, Vladimir; Glunčić, Matko
Fundamental role of start/stop regulators in whole DNA and new trinucleotide classification // Gene, 531 (2013), 2; 184-190 doi:10.1016/j.gene.2013.09.021 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.sciencedirect.com ac.els-cdn.com
15.

Glunčić, Matko; Paar, Vladimir
Direct mapping of symbolic DNA sequence into frequency domain in global repeat map algorithm // Nucleic acids research, 41 (2013), 1; e17-1 doi:10.1093/nar/gks721 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi nar.oxfordjournals.org nar.oxfordjournals.org
16.

Rosandić, Marija; Matko, Glunčić; Paar, Vladimir
Start/stop codon like trinucleotides extensions in primate alpha satellites // Journal of theoretical biology, 317 (2013), 301-309 doi:10.1016/j.jtbi.2012.09.022 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.sciencedirect.com dx.doi.org
17.

Vlahović, Sanja; Šindija, Branka; Aras, Ivana; Glunčić, Matko; Trotić, Robert
Differences between electrically evoked compound action potential (ECAP) and behavioral measures in children with cochlear implants operated in the school age vs. operated in the first years of life. // International journal of pediatric otorhinolaryngology, 76 (2012), 5; 731-739 doi:10.1016/j.ijporl.2012.02.037 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.sciencedirect.com ac.els-cdn.com dx.doi.org
18.

Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Jelovina, Denis; Dekanić, Krešimir; Vlahović, Ines; Paar, Vladimir
Global repeat map method for higher order repeat alpha satellites in human and chimpanzee genomes (build 37.2 assembly) // Croatica chemica acta, 85 (2012), 3; 327-351 doi:10.5562/cca1987 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi
19.

Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, Vladimir
Start/stop codon-like trinucleotides (CLTs) and extended clusters as new language of DNA // Croatica chemica acta, 84 (2011), 2; 331-341 doi:10.5562/cca1948 (podatak o recenziji nije dostupan, prethodno priopćenje, znanstveni)
doi
20.

Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Basar, Ivan; Vlahović, Ines
Intragene higher order repeats in neuroblastoma breakpoint family genes distinguish humans from chimpanzees // Molecular biology and evolution, 28 (2011), 6; 1877-1892 doi:10.1093/molbev/msr009 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi mbe.oxfordjournals.org
21.

Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Paar, Petar; Cvitković, Mislav
Large tandem, higher order repeats and regularly dispersed repeat units contribute substantially to divergence between human and chimpanzee Y chromosomes // Journal of molecular evolution, 72 (2011), 1; 34-55 doi:10.1007/s00239-010-9401-8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi arxiv.org www.springerlink.com
22.

Paar, Vladimir; Pavin, Nenad; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, Nils
Hierarchical structure of cascade of primary and secondary periodicities in Fourier power spectrum of alphoid higher order repeats // BMC bioinformatics, 9 (2008), 466-1 doi:10.1186/1471-2105-9-466 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi www.biomedcentral.com www.biomedcentral.com
23.

Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Paar, Vladimir; Basar, Ivan
The role of alphoid higher order repeats (HORs) in the centromere folding // Jounal of Theoretical Biology, 254 (2008), 3; 555-560 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
24.

Paar, Vladimir; Basar, Ivan; Rosandić, Marija; Glunčić, Matko
Consensus higher order repeats and frequency of string distributions in human genome // Current Genomics, 8 (2007), 93-111 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
25.

Rosandić, Marija; Paar, Vladimir; Basar, Ivan; Glunčić, Matko; Pavin, Nenad; Pilaš, Ivan
CENP-B box and pJα sequence distribution in human alpha satellite higher-order repeats (HOR) // Chromosome research, 14 (2006), 7; 735-753 doi:10.1007/s10577-006-1078-x (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
doi link.springer.com
26.

Paar, Vladimir; Pavin, Nenad; Rosandić, Marija; Glunčić, Matko; Basar, Ivan; Pezer, Robert; Durajlija-Žinić, Sonja
ColorHOR-novel graphical algorithm for fast scan of alpha satellite higher-order repeats and HOR annotation for GenBank sequence of human genome // Bioinformatics, 21 (2005), 7; 846-852 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)
27.

Rosandić, Marija; Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Basar, Ivan; Pavin, Nenad
Key-string Algorithm - Novel approach to computational analysis of repetitive sequences in human centromeric DNA // Croatian medical journal, 44 (2003), 4; 386-406 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Radovi u zbornicima skupova

Znanstveni radovi u zbornicima skupova

1.

Vlahovic, I.; Gluncic, M.; Dekanic, K.; Mrsic, L.; Jerkovic, H.; Martinjak, I.; Paar, V.
Global repeat map algorithm (GRM) reveals differences in alpha satellite number of tandem and higher order repeats (HORs) in human, Neanderthal and chimpanzee genomes – novel tandem repeat database // 43rd International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO 2020)
Opatija, Hrvatska: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2020. str. 237-242 doi:10.23919/mipro48935.2020.9245278 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)
doi ieeexplore.ieee.org
2.

Rosandić, Marija; Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Martinjak, Ivica; Paar, Vladimir
Hidden genomic symmetries-the third principle of evolution and genome function // Molekularna genetika-novosti u dijagnostici i terapiji / Sertić, Jadranka ; Gamulin, Stjepan ; Sedlić, Filip (ur.).
Zagreb: Medicinska naklada, 2018. str. 11-22 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)

Stručni radovi u zbornicima skupova

1.

Erceg, Nataša; Aviani, Ivica; Mešić, Vanes; Glunčić, Matko; Žauhar, Gordana
Konceptualni test molekularno-kinetičke teorije plina - suvremeni metodički alat za kreiranje učinkovite nastave fizike // Zbornik radova XIII. hrvatskog simpozija o nastavi fizike / Aviani, Ivica (ur.).
Zagreb: Hrvatsko fizikalno društvo, 2017. str. 47-53 (pozvano predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), stručni)
www.hfd.hr
2.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Paar Vladimir
Proučavanje Newtonovih jednadžbi gibanja pomoću animacija u programskom jeziku Python u osnovnom i srednjoškolskom obrazovanju // XIII.Hrvatski simpozij o nastavi fizike, Suvremeni kurikul i nastava fizike / Aviani, Ivica (ur.).
Zagreb: Hrvatsko fizikalno društvo, 2017. str. 150-156 (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), stručni)

Drugi radovi u zbornicima skupova

1.

Glunčić, M.; Paar, V.; Basar, I.; Vlahović, I.; Rosandić, M.; Dekanić, K.; Citković, M.; Jelovina D.; Paar, P.; Kelić, A.; Batista, J.
Direct mapping of symbolic DNA sequence into frequency domain and identification of higher order repeats // Bioinformatics and biological physics : proceedings of the scientific meeting / Vladimir Paar (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 17-46 (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo)
2.

Vlahović, I.; Glunčić, M.; Rosandić, M.; Dekanić, K.; Ugarković, Đ.; Paar, V.
Pronounced repeat and higher order repeat structure in genome of insect Tribolium castaneum. // Bioinformatics and biological physics : proceedings of the scientific meeting / Vladimir Paar (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 191-215 (predavanje, domaća recenzija, cjeloviti rad (in extenso), ostalo)
3.

Glunčić, M.; Vlahović, I.
Nastavne metode prikaza gibanja u gravitacijskom polju uz pomoć računalnih aplikacija // Nastava fizike - postignuća i izazovi : zbornik radova / Pećina, Planinka (ur.).
Zagreb: Hrvatsko fizikalno društvo, 2011. str. 144-149 (predavanje, cjeloviti rad (in extenso), ostalo)

Sažeci sa skupova

Sažeci u zbornicima i časopisima

1.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Martinjak, Ivica; Paar, Vladimir
. Periodičnosti višega reda u NBPF genima u kromosomu 1 čovjeka i neandertalca – sličnosti i različitosti u DUF1220 proteinskim domenama. // Knjiga sažetaka-Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fzikalnog društva
Zagreb: Hrvatsko fzikalno društvo, Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 65-65 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
2.

Glunčić, Matko; Vlahović, Ines; Martinjak, Ivica; Rosandić, Marija; Paar, Vladimir
Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze // Knjiga sažetaka - Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fzikalnog društva
Baška, Hrvatska: Hrvatsko zikalno društvo, Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 74-74 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
3.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Martinjak, Ivica; Paar, Vladimir
Human and Neanderthal HORs in NBPF genes chromosome 1-DNA sequence difference and similarities // 19th IUPAB and 11th EBSA Congress : Abstracts ; u: European biophysics journal 49 (2017) S1 ; 1-449
Edinburgh, Ujedinjeno Kraljevstvo: Springer, 2017. str. S275-S275 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)
link.springer.com
4.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Paar, Vladimir
Higher order repeats in genome of Tribolium castaneum identified with computational method GRM // 10th EBSA European Biophysics Congress : abstacts ; u: European Biophysics Journal with Biophysics Letters 44 (2015) (S1) ; 43-248 ; 11. New Methods for Computational Biophysics ; P-413 / Watts, A. (ur.).
Dresden, Njemačka: Springer, 2015. str. S150-S150 (poster, sažetak, znanstveni)
download.springer.com
5.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Paar, V ladimir
Usporedba periodičnih struktura višega reda u genomima čovjeka i neandertalca // 9.Znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva / Smolčić, Vernesa ; Bilušić, Ante ; Buljan, Maja ; Gašparić, Igor ; Horvatić, Vlasta ; Kumerički, Krešimir ; Kotnik-Karuza, Dubravka ; Milošević, Slobodan ; Planinić, Mirko ; Požek, Miroslav ; Stanić, Denis ; Tomić, Silvia (ur.).
Zagreb: Hrvatsko fizikalno društvo, 2015. str. 59-59 (predavanje, sažetak, znanstveni)
6.

Ines Vlahović, Matko Glunčić, Marija Rosandić, Vladimir Paar
Pronalaženje struktura repeticija višeg reda u genomu insekta Tribolium castaneum koristeći metodu Global Repeat Map // Knjiga sažetaka, 8. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva
Primošten, Hrvatska, 2013. str. 127-127 (poster, sažetak, znanstveni)
7.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Ugarković, Đurđica; Paar, Vladimir
Finding tandem repeats in Tribolium Castaneum using computational method Global Repeat Map // 11th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics : Biomolecular complexes and assemblies : : book of abstracts / Hozić, Amela ; Vuletić, Tomislav (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković ; Croatian Biophysical Society,, 2012. str. 75-75 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, ostalo)
8.

Matko Glunčić, Marija Rosandić, Ines Vlahović, Mislav Cvitković, Vladimir Paar
Direktno preslikavanje simboličke sekvence u frekventnu domenu i primjena na istraživanje korelacija u genomima eukariota // Knjiga sažetaka, 7. znanstveni sastanak Hrvatskogfizikalnog društva
Primošten, Hrvatska, 2011. (predavanje, sažetak, znanstveni)

Druga sudjelovanja na skupovima

1.

Vlahović, Ines; Glunčić, Matko; Rosandić, Marija; Paar Vladimir
Identification of the higher order repeats from T.castaneum to Human and Neanderthal genome using computational Global Repeat Map method // 15th European Conference on Computational Biology
Den Haag, Nizozemska, 2016. (poster, sažetak, znanstveni)
www.ebi.ac.uk

Ocjenski radovi

Doktorske disertacije

1.

Glunčić, Matko
Istraživanje korelacija periodičnosti u sekvenci ljudskog genoma, 2008., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Diplomski radovi (uključujući i diplomske radove starog programa)

1.

Glunčić, Matko
Analiza vremenske serije, 2002., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
2.

Glunčić, Matko
Analiza vremenske serije, 2002., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Ostale vrste radova

1.

Rosandić, Marija; Paar, Vladimir; Glunčić, Matko; Basar, Ivan; Pavin, Nenad
Key-string algorithm--novel approach to computational analysis of repetitive sequences in human centromeric DNA, 2003. (podatak o recenziji nije dostupan, ostalo).