Pregled po CROSBI profilu: Davor Juretić (CROSBI Profil: 14785, MBZ: 19290)

1.

Juretić, Davor; Bonačić Lošić, Željana

Comments on 'Flexibility of enzymatic transitions as a hallmark of optimized enzyme steady-state kinetics and thermodynamics' // Computational biology and chemistry, 95 (2021), 107571, 5 doi:10.1016/j.compbiolchem.2021.107571 (međunarodna recenzija, pismo uredniku, znanstveni)

doi

2.

Juretić, Davor; Golemac, Anja; Strand, Denise E.; Chung, Keshi; Ilić, Nada; Ivana Goić- Barišić, Ivana; Pellay, François-Xavier

The spectrum of design solutions for improving the activity-selectivity product of peptide antibiotics against multidrug-resistant bacteria and prostate cancer PC-3 cells. // Molecules, 25 (2020), 15; 3526, 21 doi:10.3390/molecules25153526 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi www.ncbi.nlm.nih.gov www.mdpi.com

3.

Juretić, Davor; Simunić, Juraj; Bonačić Lošić, Željana

Maximum Entropy Production Theorem for Transitions between Enzyme Functional States and Its Applications // Entropy (Basel. Online), 21 (2019), 8; 743, 20 doi:10.3390/e21080743 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com doi.org fulir.irb.hr

4.

Juretić, Davor; Simunić, Juraj

Design of α-helical antimicrobial peptides with a high selectivity index // Expert Opinion on Drug Discovery, 14 (2019), 10; 1053-1063 doi:10.1080/17460441.2019.1642322 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.tandfonline.com doi.org

5.

Juretić, Davor; Bonačić Lošić, Željana; Kuić, Domagoj; Simunić, Juraj; Dobovišek, Andrej

The maximum entropy production requirement for proton transfers enhances catalytic efficiency for β-lactamases // Biophysical chemistry, 244 (2019), 11-21 doi:10.1016/j.bpc.2018.10.004 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com

6.

Juretić, Davor; Sonavane, Yogesh; Ilić, Nada; Gajski, Goran; Goić Barišić, Ivana; Tonkić, Marija; Kozić, Mara; Maravić, Ana; Pellay, Francois-Xavier; Zoranić, Larisa

Designed peptide with a flexible central motif from ranatuerins adapts its conformation to bacterial membranes // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes, 1860 (2018), 12; 2655-2668 doi:10.1016/j.bbamem.2018.10.005. (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com

7.

Rončević, Tomislav; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Krce, Lucija; Gajski, Goran; Tonkić, Marija; Goić-Barišić, Ivana; Zoranić, Larisa; Sonavane, Yogesh; Benincasa, Monica et al.

Antibacterial Activity Affected by the Conformational Flexibility in Glycine–Lysine Based α-Helical Antimicrobial Peptides // Journal of medicinal chemistry, 61 (2018), 7; 2924-2936 doi:10.1021/acs.jmedchem.7b01831 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.acs.org

8.

Sani, Marc-Antoine; Saenger, Catharina; Juretić, Davor; Separović, Frances

Glycine Substitution Reduces Antimicrobial Activity and Helical Stretch of diPGLa-H in Lipid Micelles // The journal of physical chemistry. B, Condensed matter, materials, surfaces, interfaces & biophysical, 121 (2017), 4817-4822 doi:10.1021/acs.jpcb.7b03067 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi

9.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Tossi, Alessandro

Tools for Designing Amphipathic Helical Antimicrobial Peptides // Antimicrobial Peptides: Methods and Protocols / Hansen, Paul R. (ur.).
New York (NY): Humana Press, 2017. str. 23-34 doi:10.1007/978-1-4939-6737-7_2

doi link.springer.com

10.

Rončević, Tomislav; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Gajski, Goran; Tonkić, Marija; Goić Barišić, Ivana; Krce, Lucija; Zoranić, Larisa; Sonavane, Yogesh; Benincasa, Monica et al.

Combined computational and rational design of α-helical antimicrobial peptides active against opportunistic pathogens // Proceedings of the Advances in Biomedical Research / Merčep, Mladen ; Radman, Miroslav ; Štagljar, Igor (ur.).
Split: MedILS - Mediterranean institute for life sciences, 2017. str. 62-62 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

omics.medils.hr

11.

Bonačić Lošić, Željana; Donđivić, Tomislav; Juretić, Davor

Is the catalytic activity of triosephosphate isomerase fully optimized? An investigation based on maximization of entropy production // Journal of biological physics, 43 (2017), 1; 69-86 doi:10.1007/s10867-016-9434-3 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi link.springer.com link.springer.com

12.

Rončević, Tomislav; Gajski, Goran; Ilić, Nada; Goić-Barišić, Ivana; Tonkić, Marija; Zoranić, Larisa; Simunić, Juraj; Benincasa, Monica; Mijaković, Marijana; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor

PGLa-H tandem-repeat peptides active against multidrug resistant clinical bacterial isolates // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes, 1859 (2017), 2; 228-237 doi:10.1016/j.bbamem.2016.11.011 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com

13.

Rončević, Tomislav; Gajski, Goran; Ilić, Nada; Goić-Barišić, Ivana; Tonkić, Marija; Simunić, Juraj; Juretić, Davor

Design of PGLa-H tandem-repeat peptides with activity and selectivity testing against clinical bacterial isolates // Book of Abstracts
Rouen, Francuska, 2016. str. 245-245 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

14.

Kozić, Mara; Vukičević, Damir; Simunić, Juraj; Rončević, Tomislav; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor

Predicting the Minimal Inhibitory Concentration for Antimicrobial Peptides with Rana-Box Domain // Journal of chemical information and modeling, 55 (2015), 10; 2275-2287 doi:10.1021/acs.jcim.5b00161 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.acs.org

15.

Simunić, Juraj; Petrov, Dražen; Bouceba, Tahar; Kamech, Nedia; Benincasa, Monica; Juretić, Davor

Trichoplaxin - a new membrane-active antimicrobial peptide from placozoan cDNA // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes, 1838 (2014), 1430-1438 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

16.

Županović, Paško; Juretić, Davor

THE RELEVANCE OF MAXIMUM ENTROPY PRODUCTION PRINCIPLE AND MAXIMUM INFORMATION ENTROPY PRINCIPLE IN BIOLOGY // From Basic to Life Sciences 7 / Pavuna, Davor (ur.).
Cavtat, Hrvatska, 2014. (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

17.

Juretić, Davor

Host defense peptides as natural product scaffolds for a design of next generation antibiotic classes // Proceedings of the First Adriatic Symposium on Biophysical Approaches in Biomedical Studies / Raguž, Marija ; Kalyanaraman, Balaraman ; Sarna, Tadeusz ; Ilić, Nada ; Nejašmić, Danijel ; Thelaner, Jane (ur.).
Split: Mediterranean Institute for Life Sciences (MedILS), 2014. str. 53-53 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

18.

Simunić, Juraj; Petrov, Dražen; Bouceba, Tahar; Kamech, Nédia; Benincasa, Monica; Juretić, Davor

Trichoplaxin — A new membrane-active antimicrobial peptide from placozoan cDNA // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes, 1838 (2014), 5; 1430-1438 doi:10.1016/j.bbamem.2014.02.003 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com

19.

Juretić, Davor

Personal Impressions about Ante During almost 50 Years of Contacts with Him // Ante Graovac - Life and Works / Gutman, Ivan ; Pokrić, Biserka ; Vukičević, Damir (ur.).
Kragujevac: Univerzitet u Kragujevcu ; Prirodno-matematički fakultet Univerziteta u Kragujevcu, 2014. str. 139-140

20.

Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Juretić, Davor

Maximum Entropy Production and Maximum Shannon Entropy as Germane Principles for the Evolution of Enzyme Kinetics // Beyond the Second Law: Entropy Production and Non- equilibrium Systems / Dewar, Roderick C ; Charles ; Lineweaver, Charles H ; Niven, Robert K ; Regenauer-Lieb, Klaus (ur.).
Berlin: Springer, 2014. str. 361-382

21.

Juretić, Davor; Tossi, Alessandro; Kamech, Nédia; Ilić, Nada; Bojović, Viktor; Novković, Mario; Simunić, Juraj; Petrov, Dražen; Lučić, Bono; Miljak, Marija et al.

From Data Collecting to Web servers for Automatic Design of Peptide Antibiotics // Bioinformatics and biological physics : proceedings of the scientific meeting / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb: Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013. str. 63-78

Pristup cjelovitom tekstu rada

22.

Vučemilović-Alagić, Nataša

Antimicrobial activity of modified cell penetrating peptide and modified natural antimicrobial peptide against opportunistic (multiresistant) pathogens in hospital environment, 2013., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

23.

Miljak, Marija

Dimeric Analogue of a Natural Antimicrobial Peptide with Improved Activity and Selectivity: A Study Connecting Bioinformatics, Biophysics and Biochemistry, 2013., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

24.

Ivica, Josip

Algorithmic and knowledge-based modifications of cell-penetrating peptide leading to its improved physicochemical properties and antimicrobial activity, 2013., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

25.

Županović, Paško; Juretić, Davor

The relevance of maximum entropy production principle and maximum information entropy principle in biology // Proceedings / Piloteelli, Mariagrazia ; Beretta, Gian Paolo (ur.).
Brescia: Cartolibreria Snoopy, 2013. str. 94-98 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

26.

Juretić, Davor

Bioinformatics of Antimicrobial Peptides: From Collecting Data to Web Servers for Automatic Design of Peptide Antibiotics // HRVATSKA AKADEMIJA ZNANOSTI I UMJETNOSTI: NOVA DOSTIGNUĆA HRVATSKIH ZNANSTVENIKA IZ BIOINFORMATIKE I BIOLOŠKE FIZIKE / Paar, Vladimir (ur.).
Zagreb, Hrvatska, 2013. (plenarno, sažetak, znanstveni)

27.

Juretić Pešćica, Mirela; Knez, Rajna; Pavešić Radonja, Aristea

Delirij, MNS, nuspojava psihotropika, sve navedno ili ništa od toga? // Zbornik sažetaka
Opatija, Hrvatska, 2013. (predavanje, domaća recenzija, sažetak, stručni)

28.

Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Xhindoli, Daniela; Benincasa, Monica; Tossi, Alesandro; Juretić, Davor

Selective antimicrobial activity and mode of action of adepantins, glycine-rich peptide antibiotics based on anuran antimicrobial peptide sequences // Biochimica et biophysica acta. Biomembranes, 1828 (2013), 3; 1004-1012 doi:10.1016/j.bbamem.2012.11.017 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com ac.els-cdn.com dx.doi.org

29.

Kralj, Tomica

Fizikalna i kemijska svojstva peptida i proteina koji vežu srebro, 2012., diplomski rad, preddiplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

30.

Kozić, Mara

ASIMETRIČNI ANTIMIKROBNI PEPTIDI I NJIHOVA MJERENA SVOJSTVA, 2012., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

31.

Juretić, Davor

Peptide antibiotics: do they have a future or not? // From Solid State to BioPhysics VI / Pavuna, Davor (ur.).
Cavtat, Hrvatska, 2012. (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

32.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Kamech, Nédia; Tossi, Alessandro

In silico search strategies for finding new AMPs // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trst: Edizioni Università di Trieste, 2012. str. 23-24 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

33.

Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor

DADP: the Database of Anuran Defense Peptides // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trst: Edizioni Università di Trieste, 2012. str. 39-40 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

34.

Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Xhindoli, Daniela; Benincasa, Monica; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor

Adepantins, computationally designed, glycine-rich peptide antibiotics, with low toxicity and very high G- selectivity // New Antimicrobials Workshop in Trieste, 25-26.5.2012 / Tossi, Alessandro (ur.).
Trst: Edizioni Università di Trieste, 2012. str. 37-38 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

35.

Kamech, Nédia; Vukičević, Damir; Ladram, Ali; Piesse, Christophe; Vasseur, Julie; Bojović, Viktor; Simunić, Juraj; Juretić, Davor

Improving the Selectivity of Antimicrobial Peptides from Anuran Skin // Journal of chemical information and modeling, 52 (2012), 12; 3341-3351 doi:10.1021/ci300328y (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi pubs.acs.org

36.

Novković, Mario; Simunić, Juraj; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro; Juretić, Davor

DADP: the database of anuran defense peptides // Bioinformatics, 28 (2012), 10; 1406-1407 doi:10.1093/bioinformatics/bts141 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi bioinformatics.oxfordjournals.org bioinformatics.oxfordjournals.org

37.

Tessera, Valentina; Guida, Filomena; Juretić, Davor; Tossi, Alessandro

Identification of antimicrobial peptides from teleosts and anurans in expressed sequence tag databases using conserved signal sequences // The FEBS journal, 279 (2012), 5; 724-736 doi:10.1111/j.1742-4658.2011.08463.x (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi onlinelibrary.wiley.com

38.

Kuić, Domagoj; Županović, Paško; Juretić, Davor

Macroscopic Time Evolution and MaxEnt Inference for Closed Systems with Hamiltonian Dynamics // FOUNDATIONS OF PHYSICS, 42 (2012), 2; 319-339 doi:10.1007/s10701-011-9604-x (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.springerlink.com

39.

Afonin, Sergiy; Juretić, Davor; Separović, Frances; Urlich, Anne S.

Special issue on membrane-active peptides // European biophysics journal, 40 (2011), 347-348 doi:10.1007/s00249-011-0670-y (međunarodna recenzija, uvodnik, ostalo)

doi

40.

Paradžik, Ana

Hodgkin–Huxleyjeve jednadžbe u svjetlu današnjih saznanja o strukturi voltažnih kanala, 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

41.

Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Bonačić-Lošić, Željana; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor

Kinetika enzima i načelo najvećeg nastajanja entropije // Knjiga sažetaka, VII Znanstveni sastanak HFD-a Primošten, 13-16 listopada 2011
Zagreb, 2011. str. 136-136 (poster, sažetak, znanstveni)

42.

Kuić, Domagoj; Županović, Paško; Juretić, Davor

Algoritam maksimalne entropije i vremenska evolucija zatvorenih makroskopskih sustava s Hamiltonovom dinamikom // Knjiga sažetaka, VII Znanstveni sastanak HFD-a Primošten, 13-16 listopada 2011
Zagreb, 2011. str. 133-133 (poster, sažetak, znanstveni)

43.

Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Brumen, Milan; Bonačić-Lošić, Željana; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor

Enzyme kinetics and the maximum entropy production principle // Biophysical chemistry, 154 (2011), 2/3; 49-55 doi:10.1016/j.bpc.2010.12.009 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.sciencedirect.com ac.els-cdn.com dx.doi.org

44.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Petrov, Dražen; Novković, Mario; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada; Tossi, Alessandro

Knowledge-based computational methods for identifying or designing novel, non-homologous antimicrobial peptides // European biophysics journal, 40 (2011), 4; 371-385 doi:10.1007/s00249-011-0674-7 (međunarodna recenzija, pregledni rad, znanstveni)

doi www.springerlink.com

45.

Borozan, Marija

Usporedba fizikalnih svojstava signalnih peptida iz vodozemaca i sisavaca, 2010., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

46.

Novković, Mario

Adepantins, a new class of designed antimicrobial peptides, 2010., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

47.

Juretić, Davor

Structural asymmetries and biological activity of membrane-transforming-peptides // Book of Abstracts: Visualization and modeling in Chemistry
Split, 2010. (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

48.

Dobovišek, Andrej; Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Bonačić-Lošić, Željana; Brumen, Milan; Juretić, Davor

Evolutionary optimization of enzymatic reactions by Maximum Entropy Production Principle // Book of Abstracts, Regional Biophysics Conference , Primošten , 15-18 September 2010
Zagreb, 2010. str. 31-31 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

49.

Županović, Paško; Brumen, Milan; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor

Negative pressure in osmosis at constant volume and water uptake in tall tree // Book of Abstracts
Zagreb, 2010. str. 49-49 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

50.

Županović, Paško; Brumen, Milan; Kuić, Domagoj; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor

The effect of the elasticity of membrane on the stability of the solvent in osmotic process at constant volume // Workshop programme and abstracts
Jena, 2010. str. 18-18 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

51.

Petrov, Dražen; Juretić, Davor

Conserved signal sequences specific for processing of innate immunity antimicrobial peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split: Sveučilište u Splitu ; Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Splitu, 2010. str. 47-47 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

52.

Lučić, Bono; Bojović, Viktor; Vukičević, Damir; Juretić, Davor

Positional specific amino acid attributes improve the computational design of antimicrobial peptides // Australia-Croatia Workshop on Antimicrobial Peptides and Summer School in Biophysics in Biophysics (AMP2010) : Book of Abstracts / Juretić, Davor ; Šeparović, Frances (ur.).
Split: Faculty of Sciences, 2010. str. 43-43 (poster, sažetak, znanstveni)

53.

Ilić, Nada; Novković, Mario; Guida, Filomena; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro; Copić, Tea; Puizina, Jasna; Juretić, Davor

Adepantins, a new class of ab-initio designed antimicrobial peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split: Sveučilište u Splitu ; Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Splitu, 2010. str. 41-41 (poster, sažetak, znanstveni)

54.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Petrov, Dražen; Novković, Mario; Ilić, Nada; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro

Computational methods for using known antimicrobial peptide sequences to identify or design novel non-homologous peptides // Book of Abstracts AMP2010 / Juretić, Davor ; Separovic, Frances (ur.).
Split: Sveučilište u Splitu ; Prirodoslovno-matematički fakultet Sveučilišta u Splitu, 2010. str. 20-20 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

55.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Tossi, Alessandro

Designer Algorithm // AMP 2010 Book of Abstracts
Split, Hrvatska, 2010. (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)

56.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Petrov, Dražen; Novković, Mario; Ilić, Nada; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro

Computational methods for using known antimicrobial peptide sequences to identify or design novel non-homologous peptides // AMP 2010 Book of Abstracts
Split, Hrvatska, 2010. (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

57.

Županović, Paško; Botrić, Srećko; Juretić, Davor; Kuić, Domagoj

Relaxation processes and the maximum entropy production principle // Entropy (Basel. Online), 12 (2010), 3; 473-479 doi:10.3390/e12030473 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com

58.

Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Petrov, Dražen; Juretić, Davor; Brumen, Milan

The maximum entropy production principle and linear irreversible processes // Entropy (Basel. Online), 12 (2010), 5; 996-1005 doi:10.3390/e12050996 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com mdpi.com www.mdpi.com

59.

Županović, Paško; Kuić, Domagoj; Juretić, Davor; Dobovišek, Andrej

On the problem of formulating principles in nonequilibrium thermodynamics // Entropy (Basel. Online), 12 (2010), 4; 926-931 doi:10.3390/e12040926 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi www.mdpi.com www.mdpi.com

60.

Županović, Paško; Brumen, Milan; Jagodič, Marko; Juretić, Davor

Bacterial chemotaxis and entropy production // Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 365 (2010), 1397-1403 doi::10.1098/rstb.2009.0307 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

doi

61.

Sanader, Željka

Fizikalna svojstva koja razlikuju peptide antibiotike od peptida toksina, 2009., diplomski rad, preddiplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

62.

Petrov, Dražen

STUDIJA PONAŠANJA NESAVIJENOG POLIPEPTIDNOG LANCA U MEMBRANI UZ POMOĆ RAČUNALSKIH METODA MOLEKULARNE MEHANIKE, 2009., diplomski rad, Prirodoslovno matematički fakultet, Split

63.

Dobovišek, Andrej; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor

Maximum entropy production principle (MEPP) in generalized Michaelis-Menten kinetics // Abstracts of the 7th EBSA European Biophysics Congress ; u: European biophysics journal 38 (2009) (S1) ; S35–S212 ; Statistical, soft matter and biological physics ; P-330
Heidelberg: Springer, 2009. str. S121-S121 (poster, sažetak, znanstveni)

www.springerlink.com

64.

Dobovišek, Andrej; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor

Entropy production and Shannon's entropy in enzymatic reactions // Maximum Entropy Production in the Earth Systems, Jena, Germany, 2009
Jena, 2009. str. 18-18 (poster, sažetak, znanstveni)

65.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Bojović, Viktor; Tossi, Alessandro

Design optimisation of novel peptide antibiotics predicted to have high selectivity against G-negative bacteria // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja ; Smith, David (ur.).
Zagreb: Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. str. 59-59 (poster, sažetak, znanstveni)

66.

Juretić, Davor

Selectivity prediction for frog-type peptide antibiotics against Gram-negative bacteria // The 3rd Adriatic Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Tomić, Sanja ; Smith, David (ur.).
Zagreb: Centre for Computational Solutions in the Life Sciences, Ruđer Bošković Institute, 2009. str. 40-40 (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

67.

Paško Županović; Domagoj Kuić , Milan Brumen; Aleš Fajmut; Davor Juretić

Osmotic process at constant volume and ascent of sap in xylem // Maximum Entropy Production in the Earth Systems, Jena, Germany, 2009.
Jena, Njemačka, 2009. (predavanje, sažetak, znanstveni)

68.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Ilić, Nada; Antcheva, Nikolinka; Tossi, Alessandro

Computational Design of Highly Selective Antimicrobial Peptides // Journal of chemical information and modeling, 49 (2009), 12; 2873-2882 doi:10.1021/ci900308u (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Pristup cjelovitom tekstu rada doi pubs.acs.org pubs.acs.org

69.

Brumen, Milan; Fajmut, Aleš; Juretić, Davor; Kuić, Domagoj; Županović, Paško

The significance of the xylem-phloem coupling in the upward water transport in plants // Regional Biophysics Conference 2009, Linz, Austria, February 2009
Linz, Austrija, 2009. (poster, sažetak, znanstveni)

www.conferences.jku.at

70.

Dobovišek, Andrej; Kuić, Domagoj; Bonačić Lošić, Željana; Brumen, Milan; Županović, Paško; Juretić, Davor

Entropy production in enzymatic reactions // Regional Biophysics Conference 2009, Linz, Austria, February 2009
Linz, Austrija, 2009. (poster, sažetak, znanstveni)

www.conferences.jku.at

71.

Juretić, Davor; Vukičević, Damir; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada

Design principles for peptide antibiotics // From Solid State to Biophysics, 4th conference, Cavtat, Croatia, 2008
Cavtat, Hrvatska, 2008. str. x-x (poster, sažetak, znanstveni)

72.

Brumen, Milan; Županović, Paško; Jagodič, Marko: Juretić, Davor

Bacterial chemotaxis and entropy production // Maximum Entropy Production in the Earth system, Jena, Germany, May 2008
Jena, Njemačka, 2008. (predavanje, sažetak, znanstveni)

www.bgc-jena.mpg.de

73.

Juretić, Davor

Enzymes and living cells as functionally optimized systems for coupling thermodynamic to biological evolution // Entropy in Biomolecular Systems - MedILS Workshop, Split, Croatia, August 2008
Split, Hrvatska, 2008. (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

www.medils.org www.medils.hr

74.

Juretić, D.; Vukičević, D.; Bojović, V.; Ilić, N.; Lučić, B.

Design principles for peptide antibiotics and toxins // From Solid State to Biophysics, 4-th conference, Cavtat, Croatia, June 2008
Cavtat, Hrvatska, 2008. (pozvano predavanje, sažetak, znanstveni)

75.

Bojović, Viktor

Prilagodba PDB datoteka relacijskom modelu radi lakše vizualizacije membranskih proteina, 2007., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu, Split

76.

Bojović, Viktor; Skala, Karolj; Juretić, Davor

University of Split servers for membrane polypeptides // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural
Split, Hrvatska, 2007. (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni)

77.

Lučić, Bono; Batista, Jadranko; Juretić, Davor

Poboljšanje modela za predviđanje kristalizacije proteina // Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva / Dulčić, A. (ur.).
Zagreb: PMF Zagreb, Fizički odsjek, 2007. str. 106-106 (poster, sažetak, znanstveni)

78.

Juretić, Davor; Bojović, Viktor; Lučić, Bono; Ilić, Nada

Predicting the therapeutic index of peptide antibiotics // Third Austrian-Croatian Science Days, Grac, Austrija, listopad 2007
Graz, Austrija, 2007. (poster, sažetak, znanstveni)

79.

Županović, Paško; Botrić, Srećko; Juretić, Davor

Relaxation proceses and maximum entropy production principle // Peti znanstveni sastanak HFD-a : Knjiga sažetaka
Primošten, Hrvatska, 2007. (poster, sažetak, znanstveni)

80.

Juretić, Davor

Osobitosti znanstvene metode istraživanja prirode // Dijalog: Časopis za društveno - duhovna propitivanja i oglede, 7 (2007), 37-40 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, stručni)

81.

Juretić, Davor

Dragulj Erwina Schrodingera: Što je život // Priroda, 9 (2007), 26-30 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, stručni)

82.

Županović, Paško; Brumen, Milan; Jagodić, Marko; Juretić, Davor

Bacterial chemotaxis and entropy production // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics
Split, Hrvatska, 2007. (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

83.

Juretić, Davor; Bonačić-Lošić Željana; Županović, Paško; Dewar, Roderick

Optimization of enzymatic kinetics by using MaxENT and MEP entropy principles // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics
Split, Hrvatska, 2007. (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)

84.

Juretić, Davor; Lučić, Bono; Bojović, Viktor; Ilić, Nada

Designing peptide antibiotics with potential medical applications // The 1st Split Meeting on Development and Applications of Novel Methods and Models in Computational Biophysics and Structural Bioinformatics
Split, Hrvatska, 2007. (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

85.

Juretić, Davor; Bojović, Viktor; Lučić, Bono

Sequence attributes for estimating the therapeutic index of peptide antibiotics // The 2nd Opatija Meeting on Computational Solutions in the Life Sciences / Darko Babić, Nađa Došlić, David Smith, Sanja Tomić, Kristian Vlahoviček (ur.).
Zagreb: Ruđer Bošković Institute, Zagreb, Croatia, 2007. str. 19-19 (pozvano predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

86.

Dewar, Roderick; Juretić, Davor; Županović, Paško

The functional design of the rotary enzyme ATP synthase is consistent with maximum entropy production // Chemical Physics Letters, 430 (2006), 177-182 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

87.

Županović, Paško; Botrić, Srećko; Juretić, Davor

Relaxation processes, MaxEnt formalism and Einstein’ s formula for the probability of fluctuations // Croatica chemica acta, 79 (2006), 3; 335-338 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

88.

Juretić, Davor; Županović, Paško; Bilušić, Ante; Vranješ Markić, Leandra

Modernizacija studija fizike na Sveučilištu u Splitu u skladu s Bolonjskim procesom // Zbornik radova / Fakultet prirodoslovno matematičkih znanosti i odgojnih područja Sveučilišta u Splitu, (2005), 137-149 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, stručni)

89.

Županović, Paško; Juretić, Davor; Botrić, Srećko

On the equivalence between Onsager's principle of the least dissipation of energy and maximum entropy production principle. Conduction of heat in an anisotropic crystal // Fizika A, 14 (2005), 1; 89-96 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, znanstveni)

90.

Botrić, Srećko; Županović, Paško; Juretić, Davor

Is the Stationary Current Distribution in a Linear Planar Electric Network Determined by the Principle of Maximum Entropy Production? // Croatica Chemica Acte, 78 (2005), 2; 181-184 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

91.

Zoranić, Larisa; Jerončić, Ana; Juretić, Davor

Transmembrane helices predictor - the upgrade of the SPLIT algorithm // 1st South Eastern European Workshop on Practical Approaches to Computational Biology
Opatija, Hrvatska, 2005. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

92.

Juretić, Davor; Lučić, Bono; Trinajstić, Nenad

Why focusing on bioinformatics? // Periodicum biologorum, 107 (2005), 4; 379-383 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, ostalo)

93.

Juretić, Davor

Život je lijep // Dijalog : časopis za društveno-duhovna propitivanja i oglede, 6 (2005), 38-41 (podatak o recenziji nije dostupan, članak, stručni)

94.

Juretić, Davor

U Indoneziji su živjeli hobiti - metar visoki lovci patuljastih slonova // Priroda, 931 (2005), 2. (podatak o recenziji nije dostupan, vijest, ostalo)

95.

Juretić, Davor; Županović, Paško

The Free-Energy Transduction and Entropy Production in Initial Photosynthetic Reactions // Non-equilibrium Thermodynamics and the Production of Entropy. Life, Earth and Beyond / Kleidon, Alex ; Lorenz, Ralph D. (ur.).
Berlin: Springer, 2005. str. 161-171

96.

Županović, Paško; Juretić, Davor; Botrić, Srećko

Kirchhoff's loop law and the maximum entropy production principle // Physical Review E, 70 (2004), 056108; 1-5 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

97.

Jerončić, Ana

Sačuvanost sekundarne strukture pore ionskih kanala iz superfamilije P-segmenata, 2004., magistarski rad, Fakultet prirodoslovno-matematičkih znanosti i odgojnih područja,, Split

98.

Županović, Paško; Juretić, Davor

The chemical cycle kinetics close to the equilibrium state and electrical circuit analogy // Croatica chemica acta, 77 (2004), 4. (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

99.

Jerončić, Ana; Juretić, Davor

Collection of Pore Domain Models from Cationic Channels - Tendencies in Ion Channel Research // HDBMB 2004
HOC Bjelolasica, Hrvatska, 2004. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

100.

Županović, Paško; Zenčić, Edita; Juretić, Davor; Botrić, Srećko

Stationary processes in dilute gases and the maximum entropy production principle // MATH/CHEM/COMP/2004 / Graovac, Ante (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković, 2004. (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)