Naslov
Karakterizacija proteinskih kompleksa proteina SSB
(Characterisation of SSB protein complexes)

Autori
Kostelac, Anja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb, Hrvatska

Datum
18.02

Godina
2019

Stranica
74

Mentor
Vujaklija, Dušica ; Ivančić-Baće, Ivana

Neposredni voditelj
Godinić Mikulčić, Vlatka

Ključne riječi
Streptomyces coelicolor ; protein SSB ; protein HU ; jednolančana DNA ; interakcije
(Streptomyces coelicolor ; SSB protein ; HU protein ; single-stranded DNA ; interactions)

Sažetak
Streptomiceti predstavljaju najbrojniji rod unutar koljena Actinobacteria. Bakterija Streptomyces coelicolor A3(2) je modelni organizam za proučavanje procesa stanične diferencijacije i proizvodnje antibiotika kod bakterija. Genom ove bakterije ima dva gene, ssbA i ssbB za proteine koji vežu jednolančanu molekulu DNA (SSB), a sudjeluju u različitim procesima metabolizma DNA. Također ima i dva gena, hupA i hupS, koji kodiraju za proteine HU. Ovi proteini su združeni s nukleoidom i važni su za očuvanje strukture i integriteta DNA unutar stanice. Protein HU je potencijalni proteinski partner proteina SsbA. U ovom je radu, proteini SsbA i HupS prekomjerno su eksprimirani u heterolognom domaćinu, bakteriji Escherichia coli u svrhu pročišćavanja veće količina proteina. Za potrebe ispitivanja kompleksa SSB:HU ispitane su interakcije protein-DNA proteina SsbA i SsbB s jednolančanom DNA. Rezultati su pokazali da protein SsbB ima prosječno dva puta veći afinitet prema jlDNA nego protein SsbA, te da nastajanje kompleksa SsbB:jlDNA ne ovisi značajnije o prisutnosti soli u odnosu na kompleks SsbA:jlDNA. Pokazano je da je nastajanje kompleksa SsbA:HU spontana reakcija s visokom konstantom disocijacije i da je vođena hidrofobnim interakcijama. Interakcija između proteina SsbA i HU se ostvaruje bez prisustva jlDNA, dok se konformacijska promjena uočava samo na proteinu HU.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA