Pregled bibliografske jedinice broj: 966414
CoRdon: Codon Usage Analysis and Prediction of Gene Expressivity
coRdon: Codon Usage Analysis and Prediction of Gene Expressivity, 2018. doi:10.18129/B9.bioc.coRdon (računalni programski paket).
CROSBI ID: 966414 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
CoRdon: Codon Usage Analysis and Prediction of Gene Expressivity
Autori
Elek, Anamaria ; Kuzman, Maja ; Vlahoviček, Kristian
Izvornik
Bioconductor 3.8
Vrsta, podvrsta
Ostale vrste radova, računalni programski paket
Godina
2018
Ključne riječi
Gene Expressivity ; Metagenomes ; Codon Usage
Sažetak
Tool for analysis of codon usage in various unannotated or KEGG/COG annotated DNA sequences. Calculates different measures of CU bias and CU-based predictors of gene expressivity, and performs gene set enrichment analysis for annotated sequences. Implements several methods for visualization of CU and enrichment analysis results.
Izvorni jezik
Engleski
Znanstvena područja
Biologija
POVEZANOST RADA
Projekti:
KK.01.1.1.01.0009 - Napredne metode i tehnologije u znanosti o podatcima i kooperativnim sustavima (EK )
KK.01.1.1.01.0010
HRZZ-IP-2014-09-6400 - Istraživanje razvoja, diferencijacije i evolucije životinja kroz genomiku bazalnih metazoa (BAMGEN) (Vlahoviček, Kristian, HRZZ - 2014-09) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
