Naslov
Uspostava referentnog panela SSCP profila za analizu gena DRB skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti jelena (Cervus elaphus)
(ESTABILISHMENT OF SSCP PROFILE REFERENCE PANEL FOR ANALYSIS OF THE MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS II DRB GENE IN THE RED DEER (Cervus elaphus))

Autori
Radović, Tihana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.02

Godina
2018

Stranica
42

Mentor
Galov, Ana ; Šeruga Musić, Martina

Neposredni voditelj
Arbanasić, Haidi

Ključne riječi
jelen, MHC, polimorfizam, DRB, SSCP, Hrvatska
(red deer, MHC, polymorphism, DRB, SSCP, Croatia)

Sažetak
Imunološko prepoznavanje vlastitog od stranog djelomično je kontrolirano setom gena unutar glavnog sustava tkivne podudarnosti (MHC). Ti geni kodiraju sustav membranskih glikoproteinskih receptora čija je glavna uloga prepoznati strane proteine, prezentirati ih specijaliziranim imunosnim stanicama, te pokrenuti imunološki odgovor. Veća varijabilnost genskih lokusa MHC omogućuje prepoznavanje šireg spektra antigena, pa posljedično i bolju obranu od patogena. Istraživanja varijabilnosti MHC lokusa analizom sekvenci fragmenata DNA umnoženih PCR reakcijom, obično uključuju i molekularno kloniranje. Uvođenjem metode SSCP (single strand conformation polymorphism), postupak utvrđivanja genske varijabilnosti bio bi jednostavniji, brži i jeftiniji smanjujući potrebu za molekularnim kloniranjem i dodatnim sekvenciranjem. U ovom istraživanju, po prvi puta u Hrvatskoj, uvela sam metodu SSCP u istraživanje raznolikosti alela lokusa DRB, te uspostavila referentni panel SSCP profila spomenutih alela u jelena (Cervus elaphus). U ispitivanim uzorcima utvrdila sam postojanje ukupno sedam različitih alela, te postojanje dupliciranog lokusa DRB. Na referentnom panelu, svaki od pojedinačnh alela pokazuje jedinstven SSCP profil, ali utvrđeno je i preklapanje pojedinih vrpci različitih alela. Kod nekoliko odabranih uzoraka, analiza SSCP izravno umnoženih fragmenata alela potvrdila je rezultate dobivene molekularnim kloniranjem i sekvenciranjem. No, za rutinsku uporabu SSCP panela u procjeni imunogenetičke varijabilnosti jelena u Hrvatskoj, trebalo bi metodu dodatno optimizirati i unaprijediti.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA