Naslov
Predviđanje ishodišnih stanica raka na temelju organizacije kromatina.
(Using chromatin organization to predicting cancer cell-of-origin)

Autori
Karlić, Rosa ; Polak, Paz ; Koren, Amnon ; Thurman, Robert ; Sandstrom, Richard ; Lawrence, Michael S. ; Reynolds, Alex ; Rynes, Eric ; Vlahoviček, Kristian ; Stamatoyannopoulos, John A. ; Sunyaev, Shamil R.

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Zbornik sažetaka, 12. Hrvatski biološki kongres / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb, 2015, 130-131

Skup
12. Hrvatski biološki kongres

Mjesto i datum
Sveti Martin na Muri, Hrvatska, 18.09.2015. - 23.09.2015

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Podatak o recenziji nije dostupan

Ključne riječi
epigenetska obilježja, genom, rak, somatske mutacije
(epigenetic features, genome, cancer, somatic mutations)

Sažetak
Rak je bolest potencirana somatskim mutacijama, koje nisu jednoliko distribuirane duž genoma stanice raka, već se pojedine genomske regije razlikuju u lokalnoj gustoći somatskih mutacija. Pokazano je da je organizacija kromatina jedna od glavnih odrednica genomske raspodjele somatskih mutacija u stanicama raka. Kako su i somatske mutacije i organizacija kromatina tkivno specifične pojave, koristeći metode računalne biologije usporedili smo raspodjelu mutacija u više neovisnih tipova raka s brojnim epigenetskim podacima mjerenim u različitim normalnim tkivima. Pokazali smo da epigenetska svojstva i vrijeme replikacije objašnjavaju do 86% varijance u raspodjeli gustoće mutacija duž genoma različitih tipova raka. Najbolja točnost predviđanja lokalne gustoće somatskih mutacija dobivena je upotrebom epigenetskih svojstava stanica u kojima je proučavani tip raka najvjerojatnije nastao. Uz to, otkrili smo da je moguće točnije predvidjeti raspodjelu mutacija u raku na temelju kromatinske strukture stanica u kojima je rak nastao nego na temelju kromatinske strukture odgovarajućih staničnih linija. Nadalje, pokazali smo da se u skoro 90% slučajeva tip stanica iz kojih je rak nastao može precizno odrediti na temelju raspodjele mutacija u njegovu genomu. Dakle, naši rezultati pokazuju da genom stanica raka obuhvaća mnoštvo informacija o identitetu i epigenetskim obilježjima stanica u kojima je pojedini rak nastao. Taj podatak, pak, može biti izuzetno važan u dijagnozi i tretmanu malignih bolesti.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA