Naslov
Elongacijski faktor Tu kao potencijalni marker mistranslacijskog stresa u bakteriji Escherichia coli
(Elongation factor Tu as a potential marker of mistranslation stress in Escherichia coli)

Autori
Hloušek-Kasun, Andrea

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
03.01

Godina
2018

Stranica
104, IX

Mentor
Gruić-Sovulj, Ita

Neposredni voditelj
Franičević, Nina

Ključne riječi
aminoacil-tRNA-sintetaze ; elongacijski faktor Tu ; mistranslacija ; Escherichia coli ; leucil-tRNA-sintetaza ; norvalin ; stanični odgovor ; modelni protein
(aminoacyl-tRNA-synthetases ; elongation factor Tu ; mistranslation ; Escherichia coli ; leucyl-tRNA synthetase ; norvaline ; cell response ; model protein)

Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS) su enzimi koji kovalentno povezuju odgovarajuću molekulu tRNA s njoj pripadnom aminokiselinom u reakciji aminoaciliranja. Nastala aminoacilirana tRNA se pomoću elongacijskog faktora Tu (EF-Tu) doprema do ribosoma gdje sudjeluje u procesu biosinteze proteina. Ukoliko aaRS pogriješe pri odabiru pripadne aminokiseline ili tRNA, dolazi do ugradnje nepripadne aminokiseline u proteine (mistranslacije). Pokazano je da leucil-tRNA- sintetaza (LeuRS) iz bakterije Escherichia coli ponekad griješi pri diskriminaciji pripadnog leucina od norvalina, zbog čega je evolucijski razvila deacilacijsku domenu koja omogućuje popravak pogreške. Inaktiviranjem deacilacijske domene dolazi do povremene ugradnje norvalina u uvjetima njegove povišene koncentracije. Stanice s norvaliranim proteomom pokazuju značajno smanjenu vijabilnost, a smatra se da bi to mogla biti posljedica nepravilnog smatanja i agregacije mistranslatiranih proteina. Stoga je u ovom diplomskom radu, kako bi stekli uvid u stanični odgovor na mistranslacijski stres, odabran EF-Tu kao modelni protein. Dobiveni rezultati pokazuju da u uvjetima mistranslacijskog stresa, ipak ne dolazi do značajne promjene u njegovoj stabilnosti te povećane agregacije u citoplazmi, već smanjenja njegove razine. Stoga je EF-Tu zanimljiv modelni protein za izučavanje biološkog odgovora bakterijske stanice na mistranslaciju. Međutim, da bi se utvrdio utjecaj mistranslacije na strukturu i topivost proteina, potrebno je provesti dodatna istraživanja i biokemijske analize drugih modelnih proteina.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA