Pregled bibliografske jedinice broj: 917823
Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze
Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze // Knjiga sažetaka - Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fzikalnog društva
Baška, Hrvatska: Hrvatsko zikalno društvo, Zagreb, Hrvatska, 2017. str. 74-74 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 917823 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze
(Comparison of Alpha satellites Higher Order Repeats in the DNA Sequence of Human, Neanderthals and Chimpanzees)
Autori
Glunčić, Matko ; Vlahović, Ines ; Martinjak, Ivica ; Rosandić, Marija ; Paar, Vladimir
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
Knjiga sažetaka - Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fzikalnog društva
/ - : Hrvatsko zikalno društvo, Zagreb, Hrvatska, 2017, 74-74
ISBN
978-953-7178-21-5
Skup
Deseti znanstveni sastanak Hrvatskog fzikalnog društva
Mjesto i datum
Baška, Hrvatska, 11.10.2017. - 13.10.2017
Vrsta sudjelovanja
Poster
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
periodičnosti višega reda, sateliti, čovjek, čimpanza , neandertalac, genom
(Higher order repeats, sattelites, human, chimpanzee, Neanderthal)
Sažetak
Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze - izrada baze podataka globalnih mapa U genomu čovjeka alfa sateliti su jedne od najzastupljenijih DNK periodičnosti, u obliku tandema ili periodičnosti višega reda – HOR-ova, te zauzimaju oko 5% cjelokupnog ljudskog genoma. Alfa sateliti u čovjeka su uvelike proučavani zbog svoje funkcionalne i strukturalne uloge u centromeri, koja je bitna za segregaciju kromosoma u mitozi i mejozi, sparivanju s homolognim kromosomima, formiranju kinetohornih struktura itd. .. Alfa sateliti su također pogodni i za proučavanje evolucije kao rezultat usklađene evolucije (concerted evolution) – procesa u kojemu su paralogne sekvence sličnije unutar iste vrste nego kod svojih srodnih vrsta, bez obzira što su se duplikacije prethodile procesu specijacije. Pomoću naše računalne metode Global Repeat Map – GRM razvijenene u našoj grupi , kao rezultat naših prethodnih istraživanja alfa satelita 3 , stvorili smo bazu podataka u sklopu novog projekta u koju smo pohranili sve identicirane sekvence alfa satelita iz genoma čovjeka, čimpanze te nedavno sekvencioniranog genoma neandertalca, naše bliske izumrle vrste. Iz analiziranih alfa satelita možemo zaključivati da li postoje razlike ili sličnosti u kromosomima u njihovim pripadajućim HOR strukturama između ove tri vrste, razlike u broju monomera koji tvore HOR-ove, divergencijama između konsenzusa. Svi prikupljeni podaci iz tih analiza, pošto se za alfa satelite u čovjeka smatra da su nedavno dodane u obliku periodičnosti višega reda u genom, dati će nam tragove o njihovim mogućim razlikama u njihovoj funkcionalnosti u ove tri proučavane vrste proučavanjem CENP-B box pJ distribucije motiva u njima.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Fizika, Interdisciplinarne prirodne znanosti
POVEZANOST RADA
Projekti:
IP-2014-09-3626 - repeticije višeg reda i globalna repeticijska mapa za genome neandertalca, čovjeka i čimpanze (NEAND_HUMAN_CHIMP) (Paar, Vladimir, HRZZ - 2014-09) ( CroRIS)
Ustanove:
Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Profili:
Ines Vlahović
(autor)
Ivica Martinjak
(autor)
Vladimir Paar
(autor)
Marija Rosandić-Pilaš
(autor)
Matko Glunčić
(autor)