Naslov
Ekspresija i identifikacija novih proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) iz biljke uročnjak (Arabidopsis thaliana) nakon izlaganja abiotičkom stresu
(Expression and identification of novel intrinsically disordered proteins in Arabidopsis thaliana during abiotic stress)

Autori
Tomljanović, Ingrid ; Skube, Karlo ; Pavoković, Dubravko

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Book of Abstracts of the 12th CROATIAN BIOLOGICAL CONGRESS / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2015, 279-280

Skup
12th CROATIAN BIOLOGICAL CONGRESS With International Participation 18th – 23rd September 2015 Sveti Martin na Muri, Croatia

Mjesto i datum
Sveti Martin na Muri, Hrvatska, 18.09.2015. - 23.09.2015

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
adapterske molekule, šaperoni, procjenitelji neuređenosti, stres hladnoća
(adapter molecules, chaperones, disorder predictors, disorder prediction software, cold stress)

Sažetak
Nativno neuređeni proteini (engl. intrinsically disordered proteins, IDP) pripadaju nedavno priznatoj skupini proteina koji su biološki aktivni usprkos nedostatku jasno definirane tercijarne strukture. Takvi proteini često su adapterske ili signalne molekule i šaperoni. Smatra se da imaju važnu ulogu u odgovoru biljaka na stres, no o tome nema mnogo podataka. Od velike je važnosti razjasniti molekularne mehanizme odgovora na stres jer on značajno ograničava rast i prinos industrijskih biljaka. Cilj ovog istraživanja bio je analizirati ekspresiju i identificirati IDP u biljci uročnjaku Arabidopsis thaliana nakon izlaganja hladnoći. Globularni proteini eliminirani su zagrijavanjem uzoraka na 99 °C. IDP i ostali globularni proteini razdvojeni su nativnom i denaturirajućom 2D PAGE s 8M urejom. U biljaka tretiranih hladnoćom, denzitometrijska analiza ukazala je na izostanak ekspresije 10 proteina, smanjenje ekspresije jednog i povećanje ekspresije četiri proteina u odnosu na kontrolu. Masenom spektrometrijom identificirano je 29 različitih proteina unutar 40 proteinskih mrlja. Bioinformatičkim alatom PrDOS za procjenu neuređenosti proteina na osnovi analiza primarne strukture otkriveno je 13 novih IDP. Analizom prema rječniku Gene Ontology pokazano je da većina proteina sudjeluje u abiotičkom stresu vezivanjem različitih bioloških molekula, kao što su DNA, RNA i proteini. Kao prvo istraživanje IDP u proteomu biljnog organizma ovaj rad je značajan za čitavo područje IDP.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA