Naslov
Varijabilnost mitohondrijske DNA goveda
(Variability of mitochondrial DNA cattle)

Autori
Duvnjak, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
10.07

Godina
2017

Stranica
51

Mentor
Čubrić Čurik, Vlatka

Neposredni voditelj
Brajković, Vladimir

Ključne riječi
domestikacija goveda, kontrolna regija mtDNA, varijabilnost, MJ mreža, haplogrupe
(cattle domestication, mtDNA control region, variability, MJ network, haplogroups)

Sažetak
Uloga divljeg tura (B. primigenius) tijekom domestikacijskih procesa te utjecaj na formiranje domesticiranih i modernih pasmina goveda (B. taurus) nije do kraja razjašnjena. Postoje teorije prema kojima sve moderne pasmine goveda imaju jedinstveno podrijetlo s Bliskog istoka i nastale su domestikacijom populacije divljeg tura s tog područja te teorije prema kojima su one nastale tijekom više nezavisnih lokalnih domestikacijskih procesa uz introgresiju divljeg tura te uz dotok gena sjevernoafričkih goveda u područje južne Europe. Cilj ovog rada je rekonstrukcijom distribucije varijabilnosti mtDNA modernih pasmina i arheo- uzoraka u prostoru i vremenu dodatno razjasniti utjecaj divljeg tura na formiranje modernih pasmina. U analizi je korišteno ukupno 635 nukleotidnih sljedova kontrolne regije mtDNA duljine 237 bp iz NCBI baze podataka te iz uzoraka prikupljenih i analiziranih u ovom radu. Analiza i obrada nukleotidnih sljedova odrađena je putem programa MEGA7, DNasp5 i Mitotoolpy, a vizualizacija distribucije varijabilnosti i filogenetskih odnosa putem MJ mreže u PopArtu. Rezultati su pokazali veliku varijabilnost mtDNA kod goveda te porast varijabilnosti kroz vrijeme. Analizom haplogrupa utvrđeno je postojanje svih glavnih haplogrupa u odabranim uzorcima te su određene nepoznate haplogrupe za odabrane arheouzorke. Potvrđen je i utjecaj gena iz područja sjeverne Afrike na formiranje južnoeuropskih modernih pasmina goveda. Analizom geografske rasprostranjenosti utvrđene su tri moguće lokacije nezavisne domestikacije iz kojih su domesticirana goveda mogla migrirati. Tijekom migracije moglo je doći do introgresije lokalnih populacija divljeg tura. Za preciznije i točnije određivanje filogeneze modernih pasmina goveda i tijek domestikacije potrebno je u analize uključiti druge regije mtDNA, različite utjecaje kojima su one podložne (npr. selekciji), utjecaj molekularnog sata, datiranje arheo-uzoraka te koristiti dostupne nove tehnologije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija)

POVEZANOST RADA