Naslov
Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma
(Genetic evaluation of inbreeding based on sex markers)

Autori
Šantek, Martina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27.09

Godina
2016

Stranica
34

Mentor
Čurik, Ino

Ključne riječi
inbriding, autosomalni inbriding, X inbriding, ROH
(inbreeding, autosomal inbreeding, X inbreeding, ROH)

Sažetak
Inbriding, odnosno parenje jedinki u srodstvu se mjeri koeficijentom inbridinga, F. Do vrijednosti koeficijenta inbridinga se može doći na više načina, jedan od kojih je procjena inbridinga pomoću određivanja homozigotnih odsječaka (ROH). Genomski koeficijent inbridinga se obično odnosi na autosome, dok se inbriding na X kromosomu zanemaruje. U ovom radu su određeni ROH-ovi >4 Mb, >8 Mb i >16 Mb kod jedinki populacije Soay ovaca genotipiziranih Ovine 50K SNP čipom te su određene vrijednosti koeficijenata inbridinga za autosome i X kromosom. Za autosome su određene vrijednosti ukupno za sve kromosome te posebno za svaki kromosom. Inbriding na X kromosomu je ~4 do 15 puta veći nego na autosomima, a vrijednosti za autosomalni i X inbriding uvelike razlikuju kod pojedinih jedinki te je korelacija između vrijednosti niska. X inbriding može biti važan kod vrsta kojima veći dio genoma čini X kromosom te kod kojih su neka važna svojstva djelomično određena genima na X kromosomu te stoga ne smije biti zanemarivan.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija)

POVEZANOST RADA