Naslov
Razvoj i varijabilnost mikrosatelita Y-kromosoma u populaciji divljih svinja
(The development and variability of microsatellite Y-chromosome in the wild boar population)

Autori
Brajković, Vladimir

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.12

Godina
2013

Stranica
82

Mentor
Čubrić Čurik, Vlatka

Ključne riječi
divlja svinja, mikrosateliti Y-kromosoma, Europa
(wild boar, microsatellite Y-chromosome, Europe)

Sažetak
Divlja svinja (Sus scrofa, Linnaeus, 1758.) je autohtona divljač na području Europe, Azije i Sjeverne Afrike te je kao lovna divljač uvedena na ostale kontinente, s izuzetkom Antarktike. Kako divlja svinja, ne samo u Hrvatskoj, već i u Europi, tradicionalno predstavlja vrlo atraktivnu i brojnu lovnu divljač, važno je očuvanje izvornosti ove vrste jer ima veliki utjecaj na ekološku ravnotežu i veliki je potencijalni resurs u lovno-gospodarskom smislu. Cilj ovog rada je bio dizajnirati početnice za amplifikaciju lokus specifičnih mikrosatelitnih markera Y-kromosoma te na temelju molekularno- genetskih metoda i analiza utvrditi varijabilnost divljih svinja u Europi. Od deset dizajniranih početnica, četiri su se potvrdile uspješnim (Y-LI01, Y-LI02, Y-LI04 i Y-LI10) u amplifikaciji mikrosatelitnih lokusa Y - kromosoma divljih svinja. 93 uzoraka divljih svinja analiziranih u ovom istraživanju potječu iz sedam država sa područja Europe: Austrije, Bjelorusije, Hrvatske, Francuske, Poljske, Španjolske i Italije. Također, analizirano je 7 uzoraka domaćih svinje iz Italije-Sardinija. Statističke analize su obavljene na 4 mikrosatelitna lokusa na kojima je utvrđena prisutnost ukupno 21 alela. Najviše alela, njih 9, imao je lokus Y-LI10 (9 alela), lokus Y-LI04 je imao 6 alela, dok su 2 lokusa (Y-LI02 i Y- LI01) imali 3 alela. Prosječan broj alela populacija divljih svinja je 2, 25 , a prosječan broj alela populacije domaćih svinja je 1, 75. Prosječna očekivana heterozigotnost analiziranih populacija divljih svinja se kretala od 0, 190 do 0, 490. Najveća vrijednost očekivane heterozigotnosti je uočena u populaciji divljih svinja iz Bjelorusije na lokusu Y-LI10 (0, 905), a najmanja u populaciji divljih svinja iz Italije-Sardinija na lokusu Y-LI1 (0, 111). Prosječna očekivana heterozigotnost populacije domaćih svinja je 0, 351. Analiza molekularne varijance (AMOVA) je pokazala da bez obzira što je različitost unutar populacija visoka (28, 21%), različitost između populacija opisuje većinu varijacije (71, 79%). Prosječna vrijednost FST parametra divljih svinja je 0, 225. Uočena je neravnoteža vezanosti gena (linkage disequilibrium) između lokusa. Na svim uzorcima zajedno, divljim i domaćim svinjama, pronađeno je 24 haplotipa. Vrijednost genske raznolikosti u populacijama divljih svinja se kretala od 0, 200 (Italija-San Rossore) do 0, 905 (Poljska). Analizom glavnih sastavnica (PC1 objašnjava 58.37% varijabilnosti, a PC2 objašnjava 37, 17% varijabilnosti) potvrđena je varijabilnost populacija.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija)

POVEZANOST RADA