Naslov
Utjecaj veličine uzoraka na procjenu "linkage disequilibrium efektivne veličine" u populacijama goveda
(Effect of Sample Size on Estimation of "effective linkage of disequilibrium Size" in Bovine Populations)

Autori
Krapandža, Nina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27.09

Godina
2016

Stranica
40

Mentor
Čurik, Ino

Neposredni voditelj
Ferenčaković, Maja

Ključne riječi
efektivna veličina populacije, veličina uzorka, linkage desequilibrium, SNep
(effective population size, sample size, linkage disequilibrium, SNp)

Sažetak
Efektivna veličina populacije (Ne) centralni je koncept u konzervacijskoj genetici. S obzirom na to da je iskustvo pokazalo kako su procjene temeljene na rodovniku često neprecizne, zbog nedostatnih i pogreš nih rodovnika i stohastičke prirode rekombinacije, za procjenu se koriste nove metode. Visoko -rezolutna genomska informacija kao najpolimorfnija informacija do sada, pokazala se puno preciznijom. Precizna procjena efektivne veličine populacije od velike je važnosti, posebice kada se za procjene koriste uzorci malih veličina. Najčešće korištena procjena je ona bazirana na „linkage disequilibrium-u“ (LD). Ovaj rad prikazuje kako koristeći osnovne postavke računalnog programa SNeP pri izračunima variraju vrijednosti Ne u odnosu na veličinu uzorka. Rezultati otkrivaju značajne razlike u procijenjenim NeLD pri veličinama uzoraka 10, 20, 30, (...), 100. Iako je navedena problematika relativno novijeg vijeka postoji nekoliko formula za korekciju, međutim ostaje pitanje koja je ona prava, te je nužno provoditi daljnja istraživanja kako bi se problem pristranosti riješio.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Interdisciplinarne prirodne znanosti, Poljoprivreda (agronomija), Interdisciplinarne biotehničke znanosti

POVEZANOST RADA