Naslov
Herpes simpleks virus 1 snižava razine proteina za biogenezu miRNA tijekom produktivne infekcije
(Herpes simplex virus 1 downregulates proteins involved in miRNA biogenesis during productive infection)

Autori
Ticijana Zornada

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Odjel za biotehnologiju

Mjesto
Rijeka

Datum
20.07

Godina
2015

Stranica
35

Mentor
Igor Jurak

Ključne riječi
herpes simpleks 1, HSV-1, biogeneza miRNA, subcelularna lokalizacija, pre-miRNA, miRNA
(herpes simplex type 1, biogenesis of miRNA, subcellular localization, pre-miRNA, miRNA)

Sažetak
MikroRNA (miRNA) su male, ~22 nukleotida, regulatorne molekule koje sudjeluju u regulaciji ekspresije gena. Biogeneza staničnih miRNA je kompleksan i vrlo efikasan proces. Tome u prilog govori detekcija gotovo isključivo zrelih formi miRNA dok su prekursori praktički ispod razine detekcije. Međutim, tijekom infekcije HSV-1 uočena je znatna prisutnost HSV-1 kodiranih pre-miRNA u odnosu na njihove zrele miRNA. Kako bi istražili molekularnu pozadinu neprocesuiranje HSV-1 pre- miRNA i utjecaj HSV-1 infekcije na proces biogeneze miRNA ispitali smo razinu proteina uključenih u biogenezu miRNA kod HSV-1 inficiranim stanicama. Naši rezultati pokazuju da tijekom infekcije dolazi do smanjenja razine većine proteina uključenih u nastanak miRNA, uključujući Dicer, Exportin 5 i Argonaut, što ukazuje na mogući smanjeni kapacitet aparata za biogenezu miRNA uzrokovane HSV-1 infekcijom. Također, ispitivali smo lokalizaciju pre-miRH1 i lokalizaciju zrele forme miR-H1 i miR-H6 pomoću Northern blot metode i qRT-PCR-a. Iznenađujuće, pre-miRH1 pronađena je u jezgri stanice što upućuje na moguću neefikasnost Eksportina 5, koji je smanjen tijekom infekcije HSV-1, u provođenju pre-miRA iz jezgre u citoplazmu čime je onemogućeno daljnje procesuiranje s Dicerom. Zrele forme miR-H1 i miR-H6 jednako su eksprimirane unutar jezgre i citoplazme što upućuje na cirkuliranje miRNA unutar stanice te na moguće nove, do sada nepoznate funkcije miRNA. Naše istraživanje doprinosi razmjevanju kompleksne interakcije između virusa i domaćina i načinima na koji virus, u vrlo kontrliranom procesu, istovremeno utišava i iskorištava stanične procese radi postizanja optimalnih uvjeta za replikaciju.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA