Pregled bibliografske jedinice broj: 88817
Karakterizacija aktivnog mjesta i interakcija kvaščeve seril-tRNA-sintetaze sa staničnim makromolekulama
Karakterizacija aktivnog mjesta i interakcija kvaščeve seril-tRNA-sintetaze sa staničnim makromolekulama, 2001., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički, Zagreb
CROSBI ID: 88817 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Karakterizacija aktivnog mjesta i interakcija kvaščeve seril-tRNA-sintetaze sa staničnim makromolekulama
(Active site characterization and interaction of yeast sery-tRNA-synthetase with other cellular components)
Autori
Ročak, Sanda
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički
Mjesto
Zagreb
Datum
01.06
Godina
2001
Stranica
157
Mentor
Weygand-Đurašević, Ivana
Ključne riječi
aminoacyl-tRNA-sintetaze; tRNA; proteinske interakcije; sustav dvaju hibrida; translacija proteina
(aminoacyl-tRNA synthetase; protein-protein interactions; protein synthesis; two-hybrid system; tRNA)
Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze su esencijalni enzimi koji kataliziraju vezanje aminokisleine na tRNA uz utrošak ATP. Studija aktivnog mjesta seril-tRNA-sintetaze iz kvasca Saccharomyces cerevisiae pokazala je da petlja motiva 2, konzerviranog slijeda u svim seril-tRNA-sintetazama, sudjeluje u vezanju supstrata i u kvaščevom enzimu. Kinetička anliza SerRS mutiranih u toj regiji pokazala je smanjenje afiniteta (povišen Km) za serin i ATP, uz smanjenu katalitički konstantu kcat. Usporedbom reakcija provedenih bez tRNA (aktivacija aminokiseline)i uz tRNA (aminoaciliranje), zaključeno je da kvaščeva SerRS pokazuje tRNA-ovisno vezanje aminokiseline. Taj mehanizam doprinosi specifičnosti reakcije te sprečava aktivaciju aminokiseline u nedostaku tRNA. Također, interakcija sintetaza s drugim proteinima u stanici doprinosi procesivnosti i specifičnosti aminoaciliranja. Upotrebom sustava dvaju hibrida identificiran je Pex21p, protein koji ostvaruje specifične interakcije s kvaščevom SerRS. Pex21p sudjeluje u biogenezi peroksisoma, međutim njegovim nedostatkom ne remeti se biogeneza, te se čini da je interakcija sa SerRS druga važna funkcija ovog proteina. U tom slučaju, pek21p može djelovati kao chaperon ili kofaktor u procesima koji prethode biosintezi proteina na ribosomu. Zaključno, tRNA-ovisno prepoznavanje aminokiseline kontrolni je mehanizam koji doprinosi kvaliteti translacije proteina. Biološko značenje interakcije SerRS s Pex21p treba tražiti u istom kontekstu.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
