Naslov
Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije
(Analysis of a Metagenomic Sample Obtained by Third Generation Sequencing Technology)

Autori
Rupe, Marina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet Elektrotehnike i Računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
04.07

Godina
2017

Stranica
35

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
metagenomika, patogeni, dijagnostika
(metagenomics, pathogens, diagnostics)

Sažetak
Brza i jeftina analiza metagenomskog uzorka korisna je za kontrolu kvalitete hrane, dijagnozu bolesti i utvrđivanje štetnih nametnika na biljkama. Tradicionalne laboratorijske metode su ili dugotrajne ili namijenjene za samo jednu vrstu. Korištenjem uređaja treće generacije dobivaju se očitanja koja su puno dulja, no sadrže i znatno veći postotak pogrešaka. Implementiran je alat koji utvrđuje koji su organizmi prisutni u metagenomskim uzorcima dobivenenima koristeći upravo uređaje treće generacije. Alat u prvom koraku pronalazi sve organizme čiji genetski materijal nalikuje očitanjima iz uzorka, a zatim u drugom koraku analizira rezultate iz prvog koraka i utvrđuje koji su organizmi prisutni u zadanom uzorku.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo

POVEZANOST RADA