Pregled bibliografske jedinice broj: 843982
Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (l.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA bleomicinom
Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (l.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA bleomicinom, 2016., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split
CROSBI ID: 843982 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (l.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA bleomicinom
(Expression of damage response genes in mre11-2 mutant line of Arabidopsis thaliana (l.) after inducing DNA double strand breaks with bleomycin treatment)
Autori
Rakušić, Mia
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Split
Datum
28.09
Godina
2016
Stranica
51
Mentor
Šamanić, Ivica ; Puizina, Jasna
Ključne riječi
MRE11; mutant mre11-2; Arabidopsis thaliana; bleomicin; DSB
(MRE11; mutant mre11-2; Arabidopsis thaliana; bleomycin; DSB)
Sažetak
Protein Mre11, u okviru kompleksa Mre11-Rad50- Nbs1/Xrs2 (MRN/X), ima važnu ulogu u popravcima dvolančanih lomova DNA svih do sada istraživanih organizama, od bakterija do čovjeka. U cilju istraživanja te specifične uloge proteina Mre11 u biljne modelne vrste Arabidopsis thaliana (L.), uspoređena je ekspresija gena MRE11 i drugih gena staničnog odgovora, nakon izazivanja dvolančanih lomova DNA bleomicinom. Usporedna analiza ekspresije ciljanih gena urađena je kod mutantne liniji mre11-2 s insercijom T-DNA u 19. egzonu i kod biljaka divljeg tipa, ekotipova Columbia [Col- 0] i Wassilewskija [Ws]. Metodom RT-PCR ukupna biljna RNA prevedena je u cDNA koja je poslužila kao kalup za umnažanje gena metodom PCR. Umnoženi geni su potom naneseni na agarozni gel kako bi se mogla odrediti približna ekspresija tih gena kod različitih uzoraka. U mutanata mre11-2 tretiranih bleomicinom rezultati RT-PCR-a pokazali su smanjenu transkripciju gena CYCB1 ; 1, biljega faze G2/M staničnog ciklusa, te gena ključnih za popravak DNA (BRCA1, RAD51, PARP1), za razliku od povećane ekspresije tih gena kod biljaka divljeg tipa. Ekotipovi Columbia i Wassilewskija pokazuju podudaran obrazac ekspresije gena staničnog odgovora. Smanjena ekspresija gena staničnog odgovora u mutantnoj liniji Atmre11-2 potvrđuju važnost cjelovitosti Mre11 proteina za normalni odgovor stanice na dvolančane lomove DNA.
Izvorni jezik
Hrvatski