Naslov
In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza
(In silico characterisation of metagenomic alkane 1-monooxygenases)

Autori
Oršolić, Davor

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
28.09

Godina
2015

Stranica
40

Mentor
Žučko, Jurica

Neposredni voditelj
Diminić, Janko

Ključne riječi
alkB; metagenomska knjižnica; karakterizacija; filogenetsko stablo; razgradnja alkana
(alkB; metagenomic library; characterization; phylogenetic tree; alkane degradation)

Sažetak
Cilj istraživanja bio je provesti filogenetsku analizu, funkcionalnu karakterizaciju i trodimenzionalno strukturno modeliranje hipotetskih alkan monooksigenaza iz metagenomske knjižnice sastavljene iz umjereno onečišćenog uzorka sakupljenog iz sedimenta lučnog sidrišta u Puli. Filogenetska analiza provedena je s pomoću MEGA programa, te je dala hipotetski prikaz evolucijske povezanosti između proteina. Funkcionalnom karakterizacijom putem UniProt, InterPro i CD baze podataka potvrđena je pripadnost ispitivanih proteina alkan 1-monooksigenazama, dok strukturno modeliranje s pomoću SWISS-MODEL i I-TASSER web servisa nisu dali značajne rezultate niti za jedan od proteina. Neuspjelost strukturnog modeliranja pripisana je nedostatku homolognih proteina s eksperimentalno određenom trodimenzionalnom strukturom.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biotehnologija

POVEZANOST RADA