Pregled bibliografske jedinice broj: 778189
Aspects of DNA Assembly Acceleration on Reconfigurable Platforms
Aspects of DNA Assembly Acceleration on Reconfigurable Platforms // PROCEEDINGS IT SYSTEMS 2013 / Žagar, Martin ; Knezović, Josip ; Mlinarić, Hrvoje ; Hofman Daniel, Kovač Mario (ur.).
Bol: Fakultet elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu, 2013. str. 289-292 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)
CROSBI ID: 778189 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Aspects of DNA Assembly Acceleration on Reconfigurable Platforms
Autori
Sović, Ivan ; Šikić, Mile ; Skala, Karolj
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Radovi u zbornicima skupova, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni
Izvornik
PROCEEDINGS IT SYSTEMS 2013
/ Žagar, Martin ; Knezović, Josip ; Mlinarić, Hrvoje ; Hofman Daniel, Kovač Mario - Bol : Fakultet elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu, 2013, 289-292
ISBN
978-953-184-189-4
Skup
IT SYSTEMS 2013
Mjesto i datum
Bol, Hrvatska, 12.09.2013. - 14.09.2013
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija
Ključne riječi
de novo; reference; mapping; FPGA; systolic array
Sažetak
Modern DNA sequencing instruments produce read sequences that are considerably shorter than that of the genomes, or of the studied genomic features. In order to obtain the sequence of the entire genome, these sequences need to be assembled together. For this reason, DNA assembly is the first and the most important step in any genomics project. However, it presents a very computationally intensive and resource-consuming task. For this reason, various methods for DNA assembly acceleration are explored in practice. In this pap
Izvorni jezik
Engleski
Znanstvena područja
Računarstvo
POVEZANOST RADA
Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb,
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb