Pregled bibliografske jedinice broj: 776208
Rekombinacijski popravak i SOS odgovor u mutantu recA730 bakterije Escherichia coli
Rekombinacijski popravak i SOS odgovor u mutantu recA730 bakterije Escherichia coli, 2015., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 776208 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Rekombinacijski popravak i SOS odgovor u mutantu
recA730 bakterije Escherichia coli
(Recombinational repair and SOS response in a recA730
mutant of bacteria Escherichia coli)
Autori
Šimatović, Ana
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
17.06
Godina
2015
Stranica
128
Mentor
Brčić-Kostić, Krunoslav
Ključne riječi
Escherichia coli ; homologna rekombinacija ; SOS odgovor ; recA730 ; recA730 ; 2201 ; recA730 ; 4159
(Escherichia coli ; homologous recombination ; SOS response ; recA730 ; recA730 ; 2201 ; recA730 ; 4159)
Sažetak
Protein RecA730 u biokemijskim reakcijama samostalno vrši nukleaciju, a in vivo suprimira nedostatak gena recF. Određivanjem preživljenja nakon UV i gama zračenja i frekvencije konjugacijske rekombinacije utvrdili smo kako mutant suprimira istovremeni nedostatak oba faktora u nanošenju na jednolančanu DNA (RecBCD i RecFOR) te kako u mutantu recB1080 recQ može suprimirati nedostatak helikaze RecQ. Mutant ne može suprimirati istovremeni nedostatak obje egzonukleaze (RecBCD i RecJ). Za nastanak RecA filamenta koji sudjeluje u rekombinaciji i DNA popravku važno je da protein RecA veže i hidrolizira ATP. Dodatna mutacija recA730 u mutantu recA2201, koji ima fenotip mutanta recA nul jer ne hidrolizira ATP, dovodi do konformacijske promjene koja omogućuje dvostrukom mutantu recA730, 2201 da inducira SOS odgovor. Određivanjem razine SOS odgovora u bazalnim uvjetima i nakon uvedenog dvolančanog loma utvrdili smo kako je indukcija SOS odgovora u ovom dvostrukom mutantu ovisna o enzimu RecBCD te kako je za postizanje maksimalne razine SOS odgovora, koja je utvrđena u jednostrukom mutantu recA730, ipak potrebna i hidroliza vezanog ATP-a. Dodatna mutacija recA730 u mutantu recA4159, za koji se smatra da nema sposobnost vezanja ATP-a, nije omogućila indukciju SOS odgovora što upućuje da je jednostrukom mutantu recA730 za indukciju SOS odgovora potrebna konformacijska promjena do koje se dolazi vezanjem ATP-a. Istoznačni rezultati dobiveni su i u testu konjugacijske rekombinacije. Naposljetku je utvrđeno kako su vezanje i hidroliza ATP-a nužni za rekombinacijski popravak dvolančanih lomova u mutantu recA730.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
POVEZANOST RADA
Projekti:
MZOS-098-0982913-2867 - Uloga rekombinacije u popravku DNA i evoluciji genoma (Brčić-Kostić, Krunoslav, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb