Naslov
Umnažanje i analiza gena secY i imp izolata bakterije 'Candidatus Phytoplasma mali'
(Amplification and analysis of secY and imp gene from 'Candidatus Phytoplasma mali' isolates)

Autori
Škoda, Silvija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
24.10

Godina
2014

Stranica
38

Mentor
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
fitoplazma; genotipizacija; zaraza; biljke; kukci; secY; imp; filogenetska analiza
(phytoplasma; genotyping; infection; plants; insects; secY; imp; phylogenetic analysis)

Sažetak
Proliferacija jabuke (apple proliferation ; AP) je bolest uzrokovana bakterijom ‘Candidatus Phytoplasma mali' koja je prisutna i rasprostranjena u većini europskih zemalja. Iako zaraza ne dovodi do potpunog propadanja biljke-domaćina, zbog značajnog smanjenja veličine i kvalitete plodova ekonomski gubici su značajni. Fitoplazme (rod ‘Candidatus Phytoplasma') su unutarstanični, pleomorfni biljni patogeni iz razreda Mollicutes. Smještene su u žilnom staničju zaražene biljke, a umnažaju se i žive samo unutar sitastih cijevi floema biljke i stanica kukaca. Bolest se prenosi zaraženim sadnim materijalom i kukcima – vektorima iz reda Hemiptera. Kako je još uvijek gotovo nemoguće uzgojiti čistu kulturu fitoplazmi na umjetnom mediju, za karakterizaciju se koristi metoda multigenske tipizacije. Uzročnik bolesti, ‘Candidatus Phytoplasma mali' tek je nedavno u Hrvatskoj po prvi puta identificiran molekularnim metodama. U ovom diplomskom radu glavni cilj bio je karakterizirati novootkrivene izolate bakterije 'Ca. Phytoplasma mali' iz zaraženog tkiva jabuke i kukca-vektora Cacopsylla picta analizom gena secY i imp. Fragmenti ovih gena umnoženi su metodom PCR korištenjem specifičnih početnica te su sekvencirani. Prisutnost zaraze fitoplazmom 'Ca. Phytoplasma mali' dokazana je umnažanjem i restrikcijskom analizom gena za 16S rRNA. Filogenetskom analizom dobivenih nukleotidnih sljedova dobiveni su podaci o varijabilnosti ovih gena kao i njihovoj srodnosti s izolatima iz čitavog svijeta. Rezultati analize varijabilnosti dodatnih molekularnih markera uz 16S rRNA važni su za razjašnjavanje molekularne epidemiologije, posebno stoga što se ova fitoplazma prenosi kukcima – vektorima iz roda Cacopsylla koje su prisutne u Hrvatskoj.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA