Pregled bibliografske jedinice broj: 695388
Next generation sequencing (NGS) tehnologija u analizi genoma svinje
Next generation sequencing (NGS) tehnologija u analizi genoma svinje // Zbornik radova 49. hrvatskog i 9. međunarodnog simpozija agronoma / Marić, Sonja ; Lončarić, Zdenko (ur.).
Osijek: Poljoprivredni fakultet Sveučilišta Josipa Jurja Strossmayera u Osijeku, 2014. str. 167-168 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, ostalo)
CROSBI ID: 695388 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Next generation sequencing (NGS) tehnologija u analizi genoma svinje
(Next generation sequencing (NGS) technology in the analysis of swine genome)
Autori
Budimir, Kristina ; Margeta, Vladimir ; Čuljak, Vice ; Margeta, Polona
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, ostalo
Izvornik
Zbornik radova 49. hrvatskog i 9. međunarodnog simpozija agronoma
/ Marić, Sonja ; Lončarić, Zdenko - Osijek : Poljoprivredni fakultet Sveučilišta Josipa Jurja Strossmayera u Osijeku, 2014, 167-168
ISBN
978-953-7871-22-2
Skup
49. hrvatski i 9. međunarodni simpozij agronoma
Mjesto i datum
Dubrovnik, Hrvatska, 16.02.2014. - 21.02.2014
Vrsta sudjelovanja
Poster
Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija
Ključne riječi
Sangerova metoda analize ; genom ; shotgun sekvenciranje ; next generation
(Sanger sequencing method ; genome ; shotgun sequencing ; next generation)
Sažetak
Frederick Sanger razvio je prvu metodu izoliranja DNA provedenu tijekom 1975. godine. Navedena metoda poznata je kao metoda terminacije sinteze lanca (Chain termination method), odnosno dideoxy metoda. Ona se temelji na korištenju 2, 3- dideoksi nukleozid trifosfata pri sintezi DNA. Automatizirana Sangerova metoda bila je dominantna metoda izolacije DNA tijekom zadnja dva desetljeća te se smatra tehnologijom prve generacije. Next generation sequencing metoda (NGS) predstavlja novi način analize DNA koji se bazira na shotgun sekvenciranju. Tehnologija sekvenciranja uključuje niz metoda koje su grupirane obzirom na pripremu uzorka, sekvenciranje i analizu dobivenih podataka. Kombinacija specifičnih protokola razlikuje se između pojedinih tehnologija te određuje vrstu dobivenih podataka. Dvije su metode pripreme podataka za NGS analizu, a to su uzorci jednolančane DNA molekule te klonirani i umnoženi uzorci koji potječu od jednolančane DNA. Ovim načinom analiziraju se kratki fragmenti DNA koji se spajaju računalnim algoritmom. Sekvenciranje fragmenata duljih od 1000 baznih parova uobičajenim metodama analize je neprecizno. NGS tehnologijom stvaraju se kratki fragmenti duljine 600 do 700 baznih parova te se u tome očituje uspješnost ove metode. Primjena ovog načina analize genoma uspješnija je i jeftinija od primjene tehnologije prve generacije. Razvoj i primjena NGS tehnologije omogućuje sekvenciranje cijelog genoma pojedinih organizama.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija)
