Naslov
Raznolikost gena za molekularni šaperonin GroEL u genomima bakterija roda ‘Candidatus Phytoplasma’
(Diversity of genes encoding molecular chaperonin GroEL in the genomes of bacteria from the genus ‘Candidatus Phytoplasma’)

Autori
Slović, Anamarija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
21.01

Godina
2014

Stranica
63

Mentor
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
Candidatus Phytoplasma solani; fitoplazme; stolbur skupina; Southern blot; filogenetska analiza; molekularni marker
(Candidatus Phytoplasma solani; phytoplasma; stolbur group; Southern blot; phylogenetic analysis; molecular marker)

Sažetak
Fitoplazme ('Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez stanične stijenke iz razreda Mollicutes. Obligatni su simbionti biljaka i kukaca te uzrokuju brojne ekonomski značajne bolesti mnogih poljoprivrednih kultura u cijelome svijetu. Nemoguće ih je uzgajati u mediju bez stanica, čime je njihova detekcija i klasifikacija otežana. Molekularni šaperonin GroEL pomaže u smatanju drugih proteina, a prisustvo ovog gena detektirano je u svim potpuno sekvenciranim genomima fitoplazmi. Zbog mnogobrojnih uloga proteina GroEL, ovaj je gen istražen u novim izolatima fitoplazmi ribosomske podskupine 16SrXII-A, koje pripadaju vrsti 'Ca. P. solani' i uzrokuju ekonomski značajne štete vinove loze (Vitis vinifera L.). Gen za molekularni šaperonin GroEL iz nekoliko izolata uspješno je umnožen PCR-om, nakon čega je određen slijed nukleotida ovog gena, a metodom Southern blot detektirana je jedna kopija gena u genomu. Raznolikost gena novih izolata i gena iz poznatih genoma ispitana je filogenetskim analizama, koje su pokazale očekivano grupiranje fitoplazmi s obzirom na 16Sr skupine, što ovaj gen čini pogodnim markerom za analizu evolucijskih odnosa među fitoplazmatskim vrstama kao i varijabilnost izolata unutar pojedine vrste.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA