Naslov
ASIMETRIČNI ANTIMIKROBNI PEPTIDI I NJIHOVA MJERENA SVOJSTVA
(ASYMMETRIC ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND THEIR MEASURED PROPERTIES)

Autori
Kozić, Mara

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu

Mjesto
Split

Datum
07.12

Godina
2012

Stranica
86

Mentor
Juretić, Davor

Ključne riječi
predviđanje MICa; nehomologni antimikrobni peptidi; E. coli; strukturni parametri
(MIC prediction; nonhomologous antimicrobial peptides; E. coli; structural parameters)

Sažetak
Cilj rada je predviđanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) za nehomologne antimikrobne peptide (AMP) iz vodozemaca, tako da se pronađu dobre korelacije različitih strukturnih ili modificiranih strukturnih parametara s mjerenim biološkim parametrom. Korišten je vektorski prikaz aminokiselinskih ogranaka dobiven rukovanjem koordinatama u programu Discovery Studio Visualizer i programskom jeziku C, nakon čega su u programima Mathematica, Matlab i Excel izvršeni proračuni strukturnih i modificiranih strukturnih parametara, korelacije i multilinearne regresije. Pokazano je da postoje značajne korelacije vektor-sume aminokiselinskih ogranaka (modificirani strukturni parametar koji predstavlja asimetriju) i naboja s log(MIC E. coli) uz upotrebu QIAN880124 i ROBB760107 ljestvica aminokiselinskih svojstava.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Matematika, Fizika, Biologija

Napomena
Magistarski rad (MSc thesis)

POVEZANOST RADA