Naslov
Uspostavljanje metode i određivanje čimbenika za nastanak crRNA u bakteriji Escherichia coli
(Establishment of the method and determination of factors for crRNA expression in Escherichia coli)

Autori
Majda Bratovič

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
PMF

Mjesto
Zagreb

Datum
14.11

Godina
2012

Stranica
47

Mentor
Ivančić Baće, Ivana

Ključne riječi
CRISPR/Cas; temperatura; H-NS; Rnaza HI; Cas3
(CRISPR/Cas; temperature; H-NS; Rnase HI; Cas3)

Sažetak
Nedavno je otkriven sustav CRISPR/Cas za obranu bakterija od stranih genetičkih elemenata. Mehanizam obrane još uvijek nije u potpunosti razjašnjen, a može se podijeliti u tri faze. U bakteriji Escherichia coli za obranu su neophodni ribonukleoproteinski kompleks Cascade i protein Cas3. Sustav CRISPR/Cas u E. coli normalno nije aktivan, a poznato je nekoliko čimbenika koji utječu na njegovu aktivnost. U ovom radu istražen je utjecaj temperature te proteina H-NS, RNazaHI, Cas3 i CasC na nastajanje i stabilnost transkripata regije CRISPR. Za tu svrhu uspostavljene su metode neradioaktivni Northern blot i dot blot. Prema dobivenim rezultatima može se zaključiti da snižena temperatura inkubacije bakterija nema utjecaj na stabilnost transkripata regije CRISPR. Protein H-NS služi kao negativni regulator sustava, a nedostatak enzima RNazaHI nema pozitivan utjecaj na obranu bakterija. Proteini Cas3 i CasC nisu potrebni za nastajanje crRNA, odnosno ne utječu na procesiranje pre-crRNA. Nema korelacije između količine crRNA i efikasnosti obrane.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA