Naslov
Predviđanje kodirajućih regija u genomu metodama digitalne obrade signala
(Detection of protein-coding regions in genome using digital signal processing methods)

Autori
Baličević, Vedrana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
17.07

Godina
2009

Stranica
40

Mentor
Seršić, Damir

Ključne riječi
gen; genom; ekson; intron; period; detektor; nukleotid; kodirajući; nekodirajući; mjesto izrezivanja; filtar; DFT
(gene; genome. exon; intron; period; detector; nucleotide; coding; non-coding; splice-site; filter; DFT)

Sažetak
Činjenica da se proteini kodiraju iz aminokiselina formiranih prema kombinaciji tri uzastopna nukleotida, upućuju na mogućnost da kodirajući dijelovi gena pokazuju svojstvo periodičnosti s periodom 3. Kodirajuće eksone pokušano je na temelju ovog svojstva detektirati filtrima temeljenim na svepropusnom filtru, što je provjereno izračunom DFT. Istraživanje je pokazalo da je manji udio eksona uspješno detektiran i za njih je preciznost detektora vrlo visoka, dok je znatno veći dio eksona ostao nedetektiran. Zaključak je da svojstvo periodičnosti s 3 ne može biti samostalan kriterij detekcije eksona, ali ako postoje značajke (koje je tek potrebno otkriti) koje vrijede za druge eksone, tada bi u kombinaciji s njihovim detektorima bilo moguće istovremeno predvidjeti eksone različitih svojstava.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Elektrotehnika

POVEZANOST RADA