Naslov
Klasifikacija kodirajućih regija u genomu
(Classification of coding regions in the genome)

Autori
Štimac, Maja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
17.07

Godina
2009

Stranica
37

Mentor
Seršić, Damir

Neposredni voditelj
Šikić, Mile

Ključne riječi
gen; genom; ekson; intron; detektor; nukleotid; kodirajući; nekodirajući; mjesto izrezivanja; podjela u grupe; unakrsna validacija
(gene; genome; exon; intron; detector; nucleotide; coding; non-coding; splice-site; clustering; cross validation)

Sažetak
Danas korištene metode za detekciju mjesta izrezivanja introna su vrlo uspješne na jednostavnijim orgnizmima, dok im je uspješnost znatno lošija na složenijima. U ovom radu pokušala su se iskoristiti znanja iz vektorske kvantizacije za određivanje broja načina točnih mjesta izrezivanja. Dobiveni klasifikatori korišteni su za treniranje i testiranje statističkog paketa slučajne šume. Izlazne vrijednosti prikazane su Precision-Recall krivuljom te grafom važnosti. Iz krivulja dobivenih na temelju glasova klasifikatora i ulaznih podataka teško je zaključiti koja je bolja. Zaključak je da ovim načinom podjele ulaznih podataka nismo značajnije doprinijeli poboljšanju krivulje odnosno detektora za otkrivanje točnih mjesta izrezivanja. Također na temelju ovog rada nije moguće donijeti odluku o broju stvarnih načina točnih mjesta izrezivanja.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Elektrotehnika

POVEZANOST RADA