Naslov
Sinteza bicikličkog peptida aminokiselinskog slijeda Ala-Orn-Lys-His-Met-Lys-Asn na čvrstom nosaču
(Solid phase synthesis of bicyclic peptide with amino acid sequence Ala-Orn-Lys-His-Met-Lys-Asn)

Autori
Čaić, Ana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
28.06

Godina
2013

Stranica
67

Mentor
Jakas, Andreja ; Petrović Peroković, Vesna

Ključne riječi
ciklički peptidi / linearni peptid / sinteza peptida na čvrstom nosaču
(cyclic peptides / linear peptide / solid-phase peptide synthesis)

Sažetak
Ciklički peptidi su spojevi koji su u prirodi pronađeni u bakterijama, biljkama i životinjama, a zanimljivi su radi niza pozitivnih svojstava, kao što je antimikrobna aktivnost, te veća stabilnost na enzimsku razgradnju od linearnih peptida. Ovisno o veličini prstena i aminokiselinskog slijeda, ciklički peptidi mogu stupati u nekovalentne interakcije sa šećerima. Jedan takav ciklički peptid je antibiotik polimiksin. Bakterija antraksa sadrži tetrasaharid koji na svom krajnjem položaju ima antrozu, aminošećer koji nije pronađen niti kod jedne druge bakterije, čak niti kod onih vrlo sličnih bakteriji antraksa. Na temelju polimiksinskog kostura, priređene su peptidne knjižnice koje su ispitane na selektivno vezanje na antrozu. Dekonvolucijskom metodom određeni su peptidi s najvećim afinitetom vezanja na antrozu. Ovaj diplomski rad obuhvaća sintezu bicikličkog heptapeptida 16 aminokiselinskog slijeda Ala- Orn-Lys-His-Met-Lys-Asn kao potencijalnog ugljikohidratnog receptora za antrozu. Sinteza peptida provedena je na čvrstom nosaču (engl. Solid phase peptide synthesis ; SPPS) korištenjem standardne Fmoc-strategije. Sinteza je podijeljena u dva dijela. Korištenjem standardnih reagensa te Fmoc zaštićenih aminokiselina na instrumentu za automatsku sintezu peptida, dobiven je linearni peptid 1. U drugom dijelu sinteze, tzv. glava-rep (engl. head-to-tail) ciklizacijom spoja 1 dobiven je ciklički spoj 6. Slijedi druga ciklizacija kojom iz spoja 6 preko bočnih lanaca lizina umetanjem bipiridinske premosnice, nastaje biciklički spoj 15. Ova je ciklizacija provedena korištenjem nestandardnih reagensa PyBOP (benzotriazol-1-il- oksitripirolidinofosfonijev heksafluorfosfat) i HATU (O-(7-azabenzotriazol-1-il)-1, 1, 3, 3- tetrametilamonijev heksafluorfosfat). Deprotekcijom i uklanjanjem spoja 15 s čvrstog nosača dobiven je konačni produkt 16 koji je čišćen na HPLC te karakteriziran masenom spektrometrijom i NMR spektroskopijom.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA