Naslov
Web sučelje za poravnanje sljedova
(Web interface for sequence alignment)

Autori
Blažeka, Dino

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
09.07

Godina
2013

Stranica
48

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
poravnanje sljedova; web sučelje; Java; SW#; Spring
(sequence alignment; web interface; Java; SW#; Spring)

Sažetak
Problem poravnanja sljedova jedan je od najvažnijih problema s područja bioinformatike, ali i ostalih područja znanosti. U ovom radu predstavljeno je web sučelje za poravnanje sljedova. Ono, kao svoju osnovu, koristi biblioteku SW# koja provodi poravnanje sljedova koristeći grafičke kartice zasnovane na CUDA arhitekturi. Važnost web suˇcelja leži u tome što se njime istraživačima s područja bioinformatike omogu- ćava iskorištavanje brzih i efikasnih modula biblioteke SW# bez potrebe za nabavkom sklopovske opreme koja je nužna za njihovo izvođenje. Prikazano web sučelje proširivo je novim modulima, parametrima te bazama proteina i nukleotida.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo

POVEZANOST RADA