Pregled bibliografske jedinice broj: 626054
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima, 2013., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 626054 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin:
[protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa
supstratima
(Structural characterization of bacterial glycine:
[carrier protein] ligase and its complexes with
substrates)
Autori
Ivić, Nives
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
17.04
Godina
2013
Stranica
88
Mentor
Luić, Marija
Ključne riječi
biomakromolekulska kristalografija ; aminokiselina:[protein-nosač]-ligaza ; homolog seril-tRNA-sintetaze ; protein-nosač ; Bradyrhizobium japonicum
(biomacromolecular crystallography ; amino acid:[carrier protein] ligase ; seryl-tRNA sinthetase homolog ; carrier protein ; Bradyrhizobium japonicum)
Sažetak
Nedavno je otkrivena nova porodica enzima sličnih metanogenom tipu seril-tRNA-sintetaza. Nazvani aminokiselina:[protein-nosač]-ligaze, ovi homolozi umjesto serina tioesterski vežu glicin ili alanin na odgovarajući protein-nosač (CP) umjesto na tRNA. U ovom radu je strukturno okarakteriziran član te porodice ; glicin:[protein-nosač]-ligaza 1 (Bj Gly:CP-ligaza 1) iz bakterije Bradyrhizobium japonicum. Usporedba kristalnih struktura Bj Gly:CP-ligaze 1 i metanogenog tipa seril-tRNA- sintetaze je otkrila strukturnu očuvanost katalitičke domene i aktivnog mjesta enzima. Strukture Bj Gly:CP-ligaze 1 u kompleksu s malim supstratima (ATP-om i analogom glicil-adenilata) su ukazale na potencijalne aminokiseline odgovorne za diskriminaciju glicina i očuvanost mehanizma aktivacije glicina. Analiza strukture kompleksa Bj Gly:CP-ligaze 1 i odgovarajućeg CP-a je otkrila međudjelovanje proteina isključivo preko CP-vezne zavojnice karakteristične za aminokiselina: [protein-nosač]-ligaze. Dizajnirana je hibridna Gly:CP-ligaza u kojoj je CP-vezna zavojnica iz Bj Gly:CP-ligaze 1 zamijenjena odgovarajućom iz Agrobacterium tumefaciens alanin:[protein-nosač]- ligaze. Usporedbom kompleksa ligaza s odgovarajućim CP-om razjašnjena je strukturna osnova na temelju koje aa:CP-ligaze razlikuju protein-nosače.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
MZOS-098-1191344-2943 - Protein-ligand međudjelovanja na atomnoj razini (Luić, Marija, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
