Naslov
Primjena tehnologije LC-MS/MS za proteomsku analizu gingivnog tkiva: eksperimentalno istraživanje
(The Application of LC-MS/MS Technology for Proteomic Analysis of Gingival Tissue: a Pilot Study)

Autori
Badovinac, Ana ; Razdorov, Genadij ; Grgurević, Lovorka ; Puhar, Ivan ; Plančak, Darije ; Božić, Darko

Izvornik
Acta stomatologica Croatica (0001-7019) 47 (2013), 1; 10-20

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Radovi u časopisima, članak, znanstveni

Ključne riječi
parodontitis ; agresivni ; gingiva ; proteomika ; spektrometrija masa ; biopsija ; bjelančevine vezane na mikrotubule ; imunoglobulin kappa lanci ; dezmoplakini ; aneksini ; keratini ; S100 bjelančevine
(aggressive periodontitis ; gingiva ; proteomics ; mass spectrometry ; biopsy ; microtubule-associated proteins ; immunoglobulin kappa-chains ; antigens ; CD3 ; desmoplakins ; annexins ; keratins ; S100 proteins)

Sažetak
Svrha: Željelo se pronaći optimalne uvjete i metode za identifikaciju maksimalnog broja proteina u uzorcima tkiva gingive pacijentice s agresivnim parodontitisom. Pritom smo se koristili tehnologijom Label-free kvantifikacije, tekućinske kromatografije i spektrometrije masa (LC –MS/MS), te usporedili proteom zdravih i bolesnih uzoraka tkiva gingive. Materijali i metode: Četiri uzorka gingivnog tkiva (dva zdrava i dva bolesna) uzeta su od pacijentice, inače nepušačice, koja boluje od teškog oblika generaliziranog agresivnog parodontitisa. Proteini tkivnog lizata razdvojeni su 1D gel-elektroforezom nakon koje je slijedila digestija u gelu te mjerenje proteina nanoljestvicom HPLC-sistema preko nanoelektro spreja, ionizacijskog izvora i spektrometra mase. Dobiveni podaci obrađeni su u programu MaxQuant. Rezultati: Label-free kvantifikacija i LC-MS/MS analiza, zajedno s pripremom uzoraka, 1D gel- elektroforezom i digestijom u gelu pokazali su se kao učinkovita metoda za analizu proteoma gingivnog tkiva. Ukupan broj identificiranih i kvantificiranih proteina iznosio je 2429. Proteini koji su pokazali pojačanu ekspresiju u tkivu zahvaćenom agresivnim parodontitisom bili su: imunoglobulinski gama-1 lanac regije C, imunoglobulinski kapa lanac regije C i imunoglobulinski gama-3 lanac regije C (Ig gamma-1 chain C region, Ig kappa chain C region i Ig gamma-3 chain C region), a desmoplakin, aneksini, proteini S100-A8/A9 i keratini pokazali su sniženu ekspresiju. Zaključak: Ovo eksperimentalno istraživanje omogućuje novi uvid u proteomski profil zdravog i bolesnog gingivnog tkiva, što bi moglo pridonijeti napretku u dijagnostici i prognozi te boljem razumijevanju patogeneze agresivnog parodontitisa. Tehnologija LCMS/ MS pokazala se učinkovitom kad je riječ o proteomskoj analizi gingivnog tkiva.

Izvorni jezik
Hrvatski, engleski

Znanstvena područja
Biologija, Temeljne medicinske znanosti, Dentalna medicina

POVEZANOST RADA