Pregled bibliografske jedinice broj: 608414
Molekulsko modeliranje kompleksa bakra(II) s aminokiselinama u vakuumu, kristalu i vodenoj otopini
Molekulsko modeliranje kompleksa bakra(II) s aminokiselinama u vakuumu, kristalu i vodenoj otopini, 2012., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 608414 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Molekulsko modeliranje kompleksa bakra(II) s
aminokiselinama u vakuumu, kristalu i vodenoj
otopini
(Molecular modelling of copper(II) complexes with
amino acids in vacuum, crystal, and in aqueous
solution)
Autori
Marković, Marijana
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
12.12
Godina
2012
Stranica
123
Mentor
Sabolović, Jasmina
Ključne riječi
bakar(II) ; cis-trans izomerija ; konformacijska analiza ; kristalografski nered ; L-aminokiseline ; međumolekulske interakcije
(copper(II) ; cis-trans isomerism ; conformational analysis ; crystallographic disorder ; L-amino acids ; intermolecular interactions)
Sažetak
Cilj istraživanja bio je dobiti nove eksperimentalne i teorijske rezultate o fizikalno- kemijskim svojstvima kompleksa bakra(II) s L- aminokiselinama primjenom metoda molekularnog modeliranja (molekulska mehanika, MM, molekulska dinamika, MD, kvantno-kemijska metoda B3LYP) i rentgenske strukturne analize. Istraženi su cis- trans izomerija u bis(L-valinato)bakru(II), trostruki konformacijski i dinamički nered u kristalnoj strukturi cis-akvabis(L- izoleucinato)bakar(II) te relativna stabilnost različitih koordinacijskih geometrija bakra(II) u cis- i trans-bis(L-histidinato)bakru(II). Primjenom MM polja sila FFWa-SPCE za prva dva kompleksa u MM i MD simulacijama u vakuumu, čvrstom stanju i vodenoj otopini te metode B3LYP za bis(L-histidinato)bakar(II) kao izoliranu molekulu i s molekulama vode istražen je utjecaj međumolekulskih interakcija na relativne stabilnosti i geometrijske promjene kompleksa. Kombiniranjem eksperimentalnih i računalnih rezultata razjasnili smo procese koje se događaju na molekulskom nivou te potvrdili hipotezu da izomeri i/ili konformeri bis(aminoacidato)bakra(II) trebaju imati sličnu stabilnost u vodenoj otopini i krutom stanju da bi mogli agregirati u kristalizacijsku jezgru i kristalizirati iz vodene otopine.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
MZOS-022-0222148-2822 - Modeliranje i međudjelovanje kompleksa prijelaznih metala i bioliganada (Sabolović, Jasmina, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut za medicinska istraživanja i medicinu rada, Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb