Naslov
Uloga nukleaza i helikaza na putu homologne rekombinacije RecF u bakteriji Escherichia coli
(The role of nucleases and helicases on the RecF pathway of homologous recombination in Escherichia coli)

Autori
Buljubašić, Maja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.02

Godina
2012

Stranica
117

Mentor
Zahradka, Davor

Ključne riječi
Escherichia coli; homologna rekombinacija; rekombinacijski put RecF; helikaze; nukleaze
(Escherichia coli; homologous recombination; RecF pathway; helicases; nucleases)

Sažetak
U divljem tipu bakterije Escherichia coli popravak dvolančanih lomova odvija se putem RecBCD. U mutantima recBC(D), rekombinacija se odvija alternativnim putem RecF, koji se aktivira unošenjem supresorskih mutacija sbcB i sbcC. U ovom radu proučavali smo uloge helikaza RecQ, UvrD i HelD te nukleaza ExoI, SbcCD, RecJ, ExoIII, ExoVII i ExoX u inicijaciji rekombinacije putem RecF. Pronašli smo da postoje dva tipa puta RecF, aktivirana mutacijama delsbcB i sbcB15, koji se razlikuju po svojoj učinkovitosti i enzimatskim zahtjevima. Našli smo da je u soju delrecBCD delsbcB sbcC201 helikaza RecQ neophodna za inicijaciju rekombinacije, dok helikaze UvrD i HelD nisu potrebne. U soju delrecBCD sbcB15 sbcC201, protein SbcB15 zaštićuje rekombinogene krajeve od degradacije nukleazama i tako smanjuje potrebu za helikaznom aktivnošću. Zbog toga helikazu RecQ može djelomično nadomjestiti helikaza UvrD, dok helikaza HelD ni ovdje nije potrebna. Inaktivacija ExoVII izjednačava rekombinaciju sojeva delrecBCD sbcBC i čini put RecF gotovo neovisnim o sve tri helikaze. Nadalje, otkrili smo da nukleaze ExoI i SbcCD imaju ključnu ulogu u fenomenu neobuzdane degradacije DNA u mutantima recA. One uklanjaju jednolančane produžetke na krajevima DNA i time omogućuju vezanje nukleaze RecBCD, odgovorne za degradaciju.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA