Naslov
Potraga za proteinima koji interagiraju sa citosolnom seril-tRNA-sintetazom iz biljke Arabidopsis thaliana u sustavu dvaju hibrida
(Yeast two hybrid screening of proteins interacting with cytosolic seryl-tRNA synthetase from Arabidopsis thaliana)

Autori
Markeš, Marina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
10.01

Godina
2012

Stranica
68

Mentor
Rokov-Plavec, Jasmina

Neposredni voditelj
Kekez, Mario

Ključne riječi
Arabidopsis thaliana ; međuproteinske interakcije ; metoda dvaju hibrida u kvascima ; seril-tRNA-sintetaza
(Arabidopsis thaliana ; protein-protein interactions ; yeast two hybrid ; seryl-tRNA-synthetase)

Sažetak
Otkad je otkriveno da na funkciju proteina ne utječe samo njegova struktura već i interakcije koje on ostvaruje s drugim proteinima sve se češće istražuju interakcije između proteina s ciljem boljeg razumijevanja svih staničnih procesa. Tako je za bolje razumijevanje procesa translacije potrebno u potpunosti poznavati i funkciju aminoacil-tRNA-sintetaza (aaRS) što je moguće istražiti proučavanjem međuproteinskih interakcija u koje ti proteini stupaju. Seril-tRNA-sintetaze (SerRS) su enzimi koji kataliziraju vezanje serina na tRNASer. U dosadašnjim istraživanjima potvrđeno je da SerRS iz kvasca Saccharomyces cerevisiae i iz arheje Methanothermobacter thermautotrophicus stvaraju interakcije s peroksinom Pex21p odnosno s arginil-tRNA-sintetazom. Pregledom literature utvrđeno je da dosad nisu istraživani interaktori biljnih aaRS, pa ni biljnih SerRS. Stoga je svrha ovog istraživanja otkriti koji su proteini partneri citosolne SerRS iz modelne biljke Arabidopsis thaliana. Pretražena je knjižnica cDNA iz biljke Arabidopsis thaliana koristeći metodu dvaju hibrida u kvascu. Od približno 3, 5 x 105 klonova cDNA odabrano je 200 potencijalno pozitivnih kolonija. Nakon daljnje selekcije ostala su tri potencijalna pozitiva, za koje je detaljnom analizom utvrđeno da se radi o lažnim pozitivima. Na kraju rada se diskutiraju mogući razlozi takvog ishoda pretrage.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA