Naslov
Analiza sekundarne strukture proteina metodom obrade signala
(Secondary protein structure analysis by the method of signal processing)

Autori
Ćurić, Jura

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Fakultet Elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
06.07

Godina
2010

Stranica
49

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
protein; proteinski lanac; sekvenca aminokiselina; polarnost boĉnog lanca aminokiselina; indeks hidrofobnosti aminokiselina; primarna i sekundarna struktura; brza Fourierova transformacija; amplitudni spektar; spektralne mjere; tipovi sekundarne strukture; analiza glavnih komponenti.
(protein; protein chain; amino-acid sequence; sideward amino-acid chain polarity; amino-acid hydrophobicity index; the primary and the secondary structure; Fast Fourier Transform; amplitude spectrum; spectral measurements; secondary structure types; principle component analysis.)

Sažetak
Kako bi mogli odrediti ulogu i funkciju proteina potrebno je poznavati njegovu sekundarnu strukturu. Budući da su eksperimentalne metode određivanja sekundarne strukture veoma skupe i zahtjevne, sve više se teži unapređenju računalnih metoda za određivanje sekundarne strukture. Jedan način jest poznavajući primarnu strukturu iz nje izlučiti određene značajke i pomoću njih odrediti sekundarnu strukturu. Jedno od bitnih svojstava koje utječe na trodimenzionalnu, a time i na sekundarnu strukturu proteina jest polarnost bočnog lanca aminokiselina koja definira indeks hidrofobnosti aminokiselina. Pomoću tih vrijednosti sekvence aminokiselina se transformiraju u diskretne realne signale nad kojima je moguće vršiti razne transformacije ne bi li se došlo do korisne informacije o sekundarnoj strukturi.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Računarstvo

POVEZANOST RADA