Pregled bibliografske jedinice broj: 535550
Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s dvolančanim DNA i RNA
Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s dvolančanim DNA i RNA, 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 535550 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s
dvolančanim DNA i RNA
(Study of interactions of new cyanine dyes with
doublestranded DNA and RNA)
Autori
Mikulin, Ivana
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
27.09
Godina
2011
Stranica
58
Mentor
Tumir, Lidija-Marija ; Juranović Cindrić, Iva
Ključne riječi
monometinske cijaninske boje ; vezanje na DNA/RNA ; fluorescencija ; cirkularni dikroizam ; apsorbancija
(monomethine cyanines ; DNA/RNA binding ; fluorescence ; circular dichroism ; absorbance)
Sažetak
U okviru ovog diplomskog rada spektroskopski su okarakterizirane vodene otopine cijaninskih boja, spojeva TD5-D4, TD5-D5 i TD5-D6 i ispitana je njihova interakcija s dvolančanim polinukleotidima. Vodene otopine spojeva TD5-D4, TD5-D5 i TD5-D6 imaju UV/Vis spektar u području od 220 nm do 550 nm i velike molarne ekstinkcijske koeficijente, slabi intenzitet fluorescenije spojeva se značajno povećava po dodatku polinukleotida te nemaju CD spektar. Primjenom UV- Vis spektroskopije, fluorimetrije i CD spektroskopije ispitano je kako strukturne razlike u homodimerima monometskih cijaninskih boja poput vrste premosnice ili prisutnost različitih supstituenata na aromatskim prstenovima utječu na njihovu interakciju s dvolančanim polinukleotidima. Spoj TD5-D4 u svojoj strukturi sadži krutu propil-piridinsku premosnicu koja uvjetuje da se spoj interkalira između parova baza dl-DNA i dl-RNA. TD5-D5 i TD5-D6 sadrže fleksibilniju propil-piperidinsku premosnicu zbog čega se vežu u mali utor dl-DNA i to u obliku dimera (TD5-D5) ili monomera (TD5-D6) što je posljedica utjecaja atoma klora koji se javlja na kinolinskoj skupini podjedinice TD5-D6. TD5-D5 i TD5-D6 se aglomeriraju na površinu dl-RNA. Svi nastali komleksi su jako stabilni pri čemu su spojevi pokazali veći afinitet prema dl-DNA nego prema dl-RNA.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
MZOS-098-0982914-2918 - Dizajn, sinteza i ispitivanje interakcija malih molekula s DNA, RNA i proteinima (Piantanida, Ivo, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb