Naslov
Uvođenje mutacija u sintetsko mjesto izoleucil- tRNA-sintetaze s ciljem rasvjetljavanja mehanizma hidrolitičkog popravka
(Towards elucidation of hydrolytic proofreading mechanism by mutational analysis of isoleucyl-tRNA synthetase synthetic site)

Autori
Franičević, Nina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
04.07

Godina
2011

Stranica
91

Mentor
Gruić-Sovulj, Ita

Neposredni voditelj
Dulić, Morana

Ključne riječi
aminoacil-tRNA-sintetaze ; mehanizmi popravka pogreške ; popravak pogreške prije prijenosa ; ciljana mutageneza ; izoleucil-tRNA-sintetaza ; hidroliza aminoacil-adenilata
(aminoacyl-tRNA synthetases ; editing mechanisms ; pre-transfer editing ; site-directed mutagenesis ; isoleucyl-tRNA synthetase ; hydrolysis of aminoacyl-adenylates)

Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS) su enzimi koji kataliziraju reakciju kovalentnog vezanja aminokiseline na odgovarajuću molekulu tRNA. Uslijed nemogućnosti izbora pripadne aminokiseline s visokim stupnjem točnosti, neke aaRS su razvile mehanizme kojima popravljaju pogreške pri aminoacilaciji. Popravkom prije prijenosa uklanjaju se pogreške nastale prilikom aktivacije nepripadne aminokiseline, a popravkom poslije prijenosa one nastale njenim prijenosom na tRNA. Najnovija istraživanja upućuju na to da se kod izoleucil-tRNA-sintetaze (lleRS) popravak prije prijenosa odvija u sintetskom mjestu enzima, gdje dolazi do kinetičke razdiobe nepripadnog aminoacil-adenilata između reakcija hidrolize i prijenosa aminokiseline na tRNA. Ciljana mutageneza odabranih bočnih ogranaka u sintetskom mjestu i kinetička karakterizacija dobivenih mutanata IleRS pridonijele su razumijevanju mehanizma kojim se odvija reakcija aktivacije pripadne i nepripadne aminokiseline te hidroliza nepripadnih aminoacil-adenilata. Tako, hidrolitički popravak u sintetskom mjestu ovisi o preciznoj konformaciji aktivnog mjesta koja pozicionira nepripadni aminoacil-adenilat u hidrolitičko podmjesto. Dobiveni rezultati upućuju da Gly56, Tyr59 i Glu561 imaju važnu ulogu prilikom razlikovanja pripadnih i nepripadnih supstrata te pozicioniranja katalitičke molekule vode.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA