Naslov
Evolucijsko i funkcionalno značenje homologije između BY kinaza i ArsA ATP-aza
(Evolutionary and functional significance of homology between BY kinases and ArsA ATPases)

Autori
Lorena Kolar-Znika

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
20.06

Godina
2011

Stranica
50

Mentor
Mijaković, Ivan

Neposredni voditelj
Franjević, Damjan

Ključne riječi
Bakterijske tirozin kinaze; ArsA ATP-aze; funkcionalna karakterizacija; evolucijska karakterizacija
(Bacterial tyrosine-kinases; ArsA ATP-ase; functional characterization; evolutionary characterization)

Sažetak
Bakterijske tirozin kinaze (BY kinaze) su enzimi koji autofosforiliraju ili fosforiliraju druge supstrate na tirozinskim ostacima. Aktivno mjesto BY kinaza sadrži Walker A, A’ i B motiv. BY kinaze pripadaju superobitelji NTPaza P-petlje, skupini proteina karakterističnoj po specifičnoj petlji koja veže NTP. Strukturalno i na temelju sekvenci, BY kinaze su najsrodnije MinD ATPaznoj podobitelji kojoj između ostalih pripadaju i ArsA ATP-aze odgovorne za izbacivanje antimonita, arsenita i arsenata iz stanice uz utrošak ATP-a i koje pokazuju homologiju s BY kinazama. Cilj ovog istraživanja bio je ustvrditi evolucijsko i funkcionalno značenje homologije između BY kinaza i ArsA ATP-aza. Provedena je bioinformatička analiza s ciljem pronalaska BY kinaza s visoke sličnosti s ArsA ATP-azama. In vitro testovima fosforilacije praćena je fosforilacija BY kinaza i utjecaj antimonita na njihovu fosforilacijsku aktivnost. Pokazano je kako anitimonit nema utjecaja na kinaznu aktivnost što upućuje na veće promjene koje su se vjerojatno dogodile nakon odvajanja ArsA ATP-aza od BY kinaza i koje su utjecale na razvoj specifične aktivnosti tih ATP-aza i mehanizam njihove aktivacije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA