Pregled bibliografske jedinice broj: 516577
Računalno istraživanje kiselinsko-baznih svojstava alfa-aminokiselina u vodenim otopinama
Računalno istraživanje kiselinsko-baznih svojstava alfa-aminokiselina u vodenim otopinama, 2010., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 516577 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Računalno istraživanje kiselinsko-baznih svojstava
alfa-aminokiselina u vodenim otopinama
(Computational Study of Acid-Base Properties of
alpha-Aminoacids in Water Solutions)
Autori
Peran, Nena
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
02.12
Godina
2010
Stranica
264
Mentor
Maksić, Zvonimir ; Vianello, Robert
Ključne riječi
aminokiseline ; COSMO ; COSMO-RS ; izodezmička reakcija ; klaster-kontinuum model ; pKa ; vodikove veze
(amino acids ; COSMO ; COSMO-RS ; hydrogen bonds ; cluster-continuum model ; isodesmic reaction ; pKa)
Sažetak
Kiselinsko-bazna svojstva 22 prirodne alfa- aminokiseline u vodenim otopinama istraživana su razmatranjem reakcija prijenosa protona u vodi primjenom računalnih metoda. Izračunane su obje konstante disocijacije za hidrofilne i hidrofobne aminokiseline te tri konstante disocijacije za aminokiseline koje sadrže kiselu ili bazičnu skupinu na bočnom ogranku. Pri tome su korištena tri koncepcijski potpuno različita računalna modela - COSMO-RS, COSMO i klaster-kontinuum model. Unutar ovog posljednjeg koriste se strukture grozdova s nekoliko molekula vode, određene u plinskoj fazi. Izvorni klaster- kontinuum model nije se mogao primjeniti na aminokiseline. Stoga je u ovom radu za računanje konstanti disocijacije aminokiselina po prvi puta predložen i primjenjen princip izodezmičkih reakcija, koje imaju sačuvan broj vodikovih veza s molekulama vode. Dana je usporedba dobivenih konstanti s eksperimentalnim vrijednostima za sva tri modela. Izračunane vrijednosti su u dobrom slaganju s mjerenjima, ako se uzme u obzir kompleksnost problema.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
MZOS-098-0982933-2932 - Broenstedove i Lewisove kiseline i baze u kemiji i biokemiji (Vianello, Robert, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb